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rule-based-clusters)"],"transl_table":["11"],"translation":["MSTLQPPVTQTERILAEIWCDVLELDEVGVLDNFFEVGGYSMLMQLVREQIAQRIGIRPKLPELFIYSTIRSCAAFLDGSTQEHEPDPLTQERAGESDSADPGAGGRDTDIAVIGLACRFPDAVDADQFWGNLVSGVDSVSRFPKKSFPSPGGITREYVPAGGLLQAPEWFDAGYFGYTPREALLTDPQHRVLLECSLEAIEGAGYDPDRFPGLIGIYAGSSLSTYTETLRARQQEDASITSWDILTGTTSDYLASRVAYKLGLRGPTANVQAACATSLYAVHFAARAVLSGECDLALAGGTSVRLPAALDNYRVGGITSPTGTCRPFDAAADGVIGGQGCGIIVLKRLSEAIADGDHIHAVLRGSAVNNDGRDRAGFTAPGVRGQVEVIRAAQRAADVTPSSITYLEAHGTGTRVGDPIEVAGLNHAFADGEPREQPCLLGSVKGNIGHTDAAAGIAGFIKTVLAVERGIIPPSLHYSEPNPDIDFAAGPFTVVTEPTPWEPAGLPRRAGVTSRGLGGGNAHVVLEQPPSPLPREHSAQDQVLVLSAHTPAALDELTARIAGRLTDHPELDLRDVAWTLQVGRRLHGHRRYAVVRDRQDALRVLSGDAPERLVTGDHARDGRAVALLVPETDAAQAVQHWTALGLKPDLTLTPDSSDAQIRAALDTPGRLFLEIGDSQLSARLREHPQWTPDHIAITVTDPLAALGELWLAGLPINWAAAHAEQPRRVPLPSYPFQRQRYLLEAGPIAQPTAPTADAEPDTELDTKLDTEQTVSKLFTQMLGLSDVDPQDNFFDLGGDSLVATELVGQLEQLLPVQLEVRSMYLAPSVRELTALLEEQMRDDPAVRRG"]}},{"location":"[794496:794700](+)","type":"aSDomain","qualifiers":{"aSDomain":["PCP"],"aSTool":["nrps_pks_domains"],"database":["nrpspksdomains.hmm"],"detection":["hmmscan"],"domain_id":["nrpspksdomains_STRTU_RS03580_PCP.1"],"evalue":["1.30E-16"],"label":["STRTU_RS03580_PCP.1"],"locus_tag":["STRTU_RS03580"],"protein_end":["79"],"protein_start":["11"],"score":["52.5"],"tool":["antismash"],"translation":["ERILAEIWCDVLELDEVGVLDNFFEVGGYSMLMQLVREQIAQRIGIRPKLPELFIYSTIRSCAAFLDG"]}},{"location":"[794793:796050](+)","type":"aSDomain","qualifiers":{"aSDomain":["PKS_KS"],"aSTool":["nrps_pks_domains"],"database":["nrpspksdomains.hmm"],"detection":["hmmscan"],"domain_id":["nrpspksdomains_STRTU_RS03580_PKS_KS.1"],"domain_subtypes":["Hybrid-KS"],"evalue":["9.10E-149"],"label":["STRTU_RS03580_PKS_KS.1"],"locus_tag":["STRTU_RS03580"],"protein_end":["529"],"protein_start":["110"],"score":["487.9"],"tool":["antismash"],"translation":["IAVIGLACRFPDAVDADQFWGNLVSGVDSVSRFPKKSFPSPGGITREYVPAGGLLQAPEWFDAGYFGYTPREALLTDPQHRVLLECSLEAIEGAGYDPDRFPGLIGIYAGSSLSTYTETLRARQQEDASITSWDILTGTTSDYLASRVAYKLGLRGPTANVQAACATSLYAVHFAARAVLSGECDLALAGGTSVRLPAALDNYRVGGITSPTGTCRPFDAAADGVIGGQGCGIIVLKRLSEAIADGDHIHAVLRGSAVNNDGRDRAGFTAPGVRGQVEVIRAAQRAADVTPSSITYLEAHGTGTRVGDPIEVAGLNHAFADGEPREQPCLLGSVKGNIGHTDAAAGIAGFIKTVLAVERGIIPPSLHYSEPNPDIDFAAGPFTVVTEPTPWEPAGLPRRAGVTSRGLGGGNAHVVLEQP"]}},{"location":"[794793:796977](+)","type":"aSModule","qualifiers":{"domains":["nrpspksdomains_STRTU_RS03580_PKS_KS.1","nrpspksdomains_STRTU_RS03580_PCP.2"],"incomplete":null,"locus_tags":["STRTU_RS03580"],"tool":["antismash"],"type":["pks"]}},{"location":"[795258:795306](+)","type":"CDS_motif","qualifiers":{"aSTool":["nrps_pks_domains"],"database":["abmotifs"],"detection":["hmmscan"],"domain_id":["nrpspksmotif_STRTU_RS03580_0001"],"evalue":["3.10E-03"],"label":["PKSI-KS_m3"],"locus_tag":["STRTU_RS03580"],"protein_end":["281"],"protein_start":["265"],"score":["10.3"],"tool":["antismash"],"translation":["GPTANVQAACATSLYA"]}},{"location":"[795678:795726](+)","type":"CDS_motif","qualifiers":{"aSTool":["nrps_pks_domains"],"database":["abmotifs"],"detection":["hmmscan"],"domain_id":["nrpspksmotif_STRTU_RS03580_0002"],"evalue":["8.00E-05"],"label":["PKSI-KS_m5"],"locus_tag":["STRTU_RS03580"],"protein_end":["421"],"protein_start":["405"],"score":["14.5"],"tool":["antismash"],"translation":["YLEAHGTGTRVGDPIE"]}},{"location":"[795786:795831](+)","type":"CDS_motif","qualifiers":{"aSTool":["nrps_pks_domains"],"database":["abmotifs"],"detection":["hmmscan"],"domain_id":["nrpspksmotif_STRTU_RS03580_0003"],"evalue":["1.30E-03"],"label":["PKSI-KS_m6"],"locus_tag":["STRTU_RS03580"],"protein_end":["456"],"protein_start":["441"],"score":["11.3"],"tool":["antismash"],"translation":["GSVKGNIGHTDAAAG"]}},{"location":"[796773:796977](+)","type":"aSDomain","qualifiers":{"aSDomain":["PCP"],"aSTool":["nrps_pks_domains"],"database":["nrpspksdomains.hmm"],"detection":["hmmscan"],"domain_id":["nrpspksdomains_STRTU_RS03580_PCP.2"],"evalue":["9.20E-18"],"label":["STRTU_RS03580_PCP.2"],"locus_tag":["STRTU_RS03580"],"protein_end":["838"],"protein_start":["770"],"score":["56.2"],"tool":["antismash"],"translation":["EQTVSKLFTQMLGLSDVDPQDNFFDLGGDSLVATELVGQLEQLLPVQLEVRSMYLAPSVRELTALLEE"]}},{"location":"[797020:797758](+)","type":"gene","qualifiers":{"db_xref":["GeneID:96281613"],"locus_tag":["STRTU_RS03585"],"old_locus_tag":["STRTU_000717"]}},{"location":"[797020:797758](+)","type":"CDS","qualifiers":{"NRPS_PKS":["Domain: 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A44380.1"}],["input|c29|7397241-7398492|+|STRTU_RS32395|ketosynthase",14,{"name":"CAA44381.1","genecluster":"BGC0000215.5_c1","start":3075,"end":4334,"strand":"+","annotation":"","perc_ident":76,"blastscore":600,"perc_coverage":98.3173076923077,"evalue":2.81e-216,"locus_tag":"CAA44381.1","full_name":"BGC0000215.5_CAA44381.1"}],["input|c29|7398507-7398789|+|STRTU_RS32400|acyl",15,{"name":"CAA44382.1","genecluster":"BGC0000215.5_c1","start":4418,"end":4678,"strand":"+","annotation":"Acyl_Carrier_Protein","perc_ident":63,"blastscore":87,"perc_coverage":80.64516129032258,"evalue":5.29e-24,"locus_tag":"CAA44382.1","full_name":"BGC0000215.5_CAA44382.1"}],["input|c29|7398790-7399264|+|STRTU_RS32405|SRPBCC",16,{"name":"CAA44383.1","genecluster":"BGC0000215.5_c1","start":4680,"end":5138,"strand":"+","annotation":"cyclase","perc_ident":76,"blastscore":240,"perc_coverage":92.99363057324841,"evalue":1.27e-82,"locus_tag":"CAA44383.1","full_name":"BGC0000215.5_CAA44383.1"}],["input|c29|7399320-7399653|+|STRTU_RS32410|TcmI",17,{"name":"CAA44384.1","genecluster":"BGC0000215.5_c1","start":5123,"end":5446,"strand":"+","annotation":"","perc_ident":66,"blastscore":147,"perc_coverage":97.27272727272728,"evalue":3.38e-47,"locus_tag":"CAA44384.1","full_name":"BGC0000215.5_CAA44384.1"}]]}],[{"accession":"BGC0001590.5","cluster_label":"c1","proteins":["AQP25545.1","AQP25546.1","AQP25547.1","AQP25548.1","AQP25549.1","AQP25550.1","AQP25551.1","AQP25552.1","AQP25553.1","AQP25554.1","AQP25555.1","AQP25556.1","AQP25557.1","AQP25558.1","AQP25559.1","AQP25560.1","AQP25561.1","AQP25562.1","AQP25563.1","AQP25564.1","AQP25565.1","AQP25566.1","AQP25567.1","AQP25568.1","AQP25569.1","AQP25570.1","AQP25571.1","AQP25572.1","AQP25573.1","AQP25574.1","AQP25575.1","AQP25576.1","AQP25577.1","AQP25578.1","AQP25579.1","AQP25580.1","AQP25581.1","AQP25582.1","AQP25583.1","AQP25584.1","AQP25585.1","AQP25586.1","AQP25587.1"],"description":"formicamycin 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I",31.0,66.0,39.851485148514854,1.82e-11],["CAH55646.1","putative_acyl-CoA_dehydrogenase","BGC0000259.3",1,"PKS",24.0,64.0,82.67326732673267,6.15e-11],["WP_078645621.1","acyl-CoA_dehydrogenase_family_protein","BGC0001348.5",1,"PKS:Type I",34.0,63.0,30.198019801980198,1.59e-10],["ABW96553.1","acyl-CoA_dehydrogenase","BGC0000159.5",1,"PKS:Type I",37.0,60.0,24.752475247524753,1.39e-9],["AAO06923.1","GdmI","BGC0000066.5",1,"PKS",35.0,59.0,26.48514851485149,2.44e-9],["BAP34766.1","acyl-CoA_dehydrogenase","BGC0000078.5",1,"PKS",30.0,54.0,34.65346534653465,1.11e-7],["AAU04876.1","acyl-coA-dehydrogenase","BGC0000365.4",1,"NRPS:Type I",25.0,50.0,43.31683168316832,2.37e-6]],"STRTU_RS31205":[["ACN64858.1","PokX1","BGC0001061.4",1,"PKS:Type II aromatic",73.0,140.0,31.147540983606557,1.18e-41],["AHY06366.1","histidine_kinase","BGC0002496.3",1,"NRPS:Type I",40.0,125.0,76.39344262295083,1.05e-33]],"STRTU_RS31210":[["CCC55901.1","hypothetical_protein","BGC0000973.5",1,"NRPS:Type I+PKS:Type 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MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/31/6/","description":"Cell cycle regulator","consensus":"GTGACRYTGTCAC","confidence":"weak","strand":1,"score":18.91783916386562,"max_score":25.75231},{"name":"PerR","start":158450,"species":"Bacillus & Staphylococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/22/170/","description":"Peroxide regulator","consensus":"TATAATTATTATAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":13.908832719708743,"max_score":28.13881}],"3":[{"name":"NuR","start":266674,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/NuR","description":"Nickel-responsive regulator","consensus":"TTGCANANNACTYGCAA","confidence":"weak","strand":1,"score":22.124251158699835,"max_score":30.97839},{"name":"ZuR_variant_1","start":266583,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/ZuR","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TGAANNTCATTTTCA","confidence":"weak","strand":-1,"score":17.625814816690987,"max_score":28.18779},{"name":"CodY","start":252347,"species":"Bacillus, Lactococcus & Streptococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/32/149/","description":"Regulator of stationary phase and virulence in Gram-positive bacteria","consensus":"AWTTTTCAGAAAATT","confidence":"weak","strand":1,"score":15.518309708716583,"max_score":27.78253},{"name":"CodY","start":254168,"species":"Bacillus, Lactococcus & Streptococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/32/149/","description":"Regulator of stationary phase and virulence in Gram-positive bacteria","consensus":"AWTTTTCAGAAAATT","confidence":"weak","strand":-1,"score":15.813966367370742,"max_score":27.78253},{"name":"ColR","start":250888,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/111/58/","description":"Phenol-responsive regulator","consensus":"TTNACNNTTTTTTCAC","confidence":"weak","strand":-1,"score":17.948455993322106,"max_score":30.24844},{"name":"HexR","start":252349,"species":"Shewanella oneidensis MR-1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/80/218/","description":"Glucose-responsive regulator","consensus":"TTGTAATTTTATTACAR","confidence":"weak","strand":-1,"score":16.107950599183958,"max_score":31.73147},{"name":"MatP","start":255826,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/31/6/","description":"Cell cycle regulator","consensus":"GTGACRYTGTCAC","confidence":"weak","strand":1,"score":22.134180849193484,"max_score":25.75231}],"4":[{"name":"AbrC3","start":332407,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/AbrC3","description":"Antibiotic production activator","consensus":"GAASGCGRCS","confidence":"strong","strand":-1,"score":18.15655576909236,"max_score":18.15656},{"name":"AfsQ1","start":304860,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/AfsQ1","description":"Two-component system AfsQ1-Q2, activator of antibiotic production","consensus":"GTCACNNNNNNGTCAC","confidence":"medium","strand":-1,"score":17.108039681418468,"max_score":19.52302},{"name":"DasR","start":292291,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/DasR","description":"N-acetylglucosamine dependent repressor","consensus":"ANWGGTCTAGACCANW","confidence":"weak","strand":1,"score":19.938440101404378,"max_score":27.0358},{"name":"DasR","start":306136,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/DasR","description":"N-acetylglucosamine dependent repressor","consensus":"ANWGGTCTAGACCANW","confidence":"weak","strand":1,"score":20.32156024889579,"max_score":27.0358},{"name":"LexA_variant_2","start":340066,"species":"Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/1/12/","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"MGAACAWANGTTCN","confidence":"weak","strand":-1,"score":18.303204144350033,"max_score":24.7784},{"name":"ClgR","start":304836,"species":"Corynebacterium glutamicum ATCC 13032","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/102/77/","description":"Caseinolytic protease gene regulator","consensus":"ACGCCGNNAGCGAACA","confidence":"weak","strand":1,"score":22.366424027182518,"max_score":30.22426},{"name":"CodY","start":288236,"species":"Bacillus, Lactococcus & Streptococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/32/149/","description":"Regulator of stationary phase and virulence in Gram-positive bacteria","consensus":"AWTTTTCAGAAAATT","confidence":"weak","strand":1,"score":16.62256275723268,"max_score":27.78253},{"name":"CodY","start":314608,"species":"Bacillus, Lactococcus & Streptococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/32/149/","description":"Regulator of stationary phase and virulence in Gram-positive bacteria","consensus":"AWTTTTCAGAAAATT","confidence":"weak","strand":1,"score":15.71627502807051,"max_score":27.78253},{"name":"ColR","start":303809,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/111/58/","description":"Phenol-responsive regulator","consensus":"TTNACNNTTTTTTCAC","confidence":"weak","strand":-1,"score":18.382352519852265,"max_score":30.24844},{"name":"FuR_variant_2","start":332228,"species":"Caulobacter crescentus CB15","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/8/138/","description":"Ferric Uptake Regulator","consensus":"ATTGCGAAYGNYTCTCAAN","confidence":"weak","strand":1,"score":20.395266824715712,"max_score":32.74363},{"name":"GnfM","start":344454,"species":"Geobacter sulfurreducens PCA","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/58/104/","description":"Regulator of nitrogen-fixation genes","consensus":"TGCNNNAAAANNNGGCA","confidence":"weak","strand":1,"score":19.947460165031856,"max_score":27.5541},{"name":"HgtR","start":343400,"species":"Geobacter sulfurreducens PCA","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/60/104/","description":"Hydrogen-dependent regulator","consensus":"AWATTGTATACAGTATACR","confidence":"weak","strand":1,"score":19.390612686327557,"max_score":36.53961},{"name":"ToxT","start":314672,"species":"Vibrio cholerae O395","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/18/16/","description":"Regulator of MSHA biosynthesis","consensus":"TRTTTTTTKA","confidence":"weak","strand":1,"score":14.291776636967011,"max_score":18.57433},{"name":"VqsM","start":302778,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/234/59/","description":"Regulator of quorum-sensing signalling systems","consensus":"GGANNNYNTCGGCCA","confidence":"strong","strand":-1,"score":19.001760003018266,"max_score":20.46889}],"5":[{"name":"LexA_variant_1","start":390722,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/LexA","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"TCGAANKNNTGTTCGA","confidence":"weak","strand":-1,"score":20.202123620325327,"max_score":29.65219},{"name":"LexA_variant_1","start":391512,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/LexA","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"TCGAANKNNTGTTCGA","confidence":"weak","strand":-1,"score":20.884435320312434,"max_score":29.65219},{"name":"LexA_variant_1","start":401197,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/LexA","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"TCGAANKNNTGTTCGA","confidence":"weak","strand":-1,"score":19.752504083684126,"max_score":29.65219},{"name":"ArcA","start":391255,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/47/6/","description":"Repressor of carbon oxidation","consensus":"WTGTTAAWNNNWTGTTAN","confidence":"weak","strand":-1,"score":15.359680433718035,"max_score":21.55091},{"name":"ArcA","start":391266,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/47/6/","description":"Repressor of carbon oxidation","consensus":"WTGTTAAWNNNWTGTTAN","confidence":"weak","strand":-1,"score":16.668483761659058,"max_score":21.55091},{"name":"CRP","start":401129,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/7/6/","description":"Cyclic AMP receptor protein","consensus":"TGTGANNNNNNTCACA","confidence":"medium","strand":-1,"score":16.375753973993042,"max_score":19.25568},{"name":"MexT","start":399859,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/76/59/","description":"Global virulence regulator","consensus":"ATCANNNNTGTCGAT","confidence":"weak","strand":1,"score":18.38252468860315,"max_score":21.84196},{"name":"MogR","start":395575,"species":"Listeria monocytogenes EGD-e","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/233/35/","description":"Repressor of flagellar motility genes","consensus":"ATTTTTWAANAAAA","confidence":"weak","strand":1,"score":13.856636815559401,"max_score":26.06143},{"name":"RutR","start":401554,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/27/6/","description":"Regulator of the pyrimidine and purine metabolism","consensus":"TTGACCRNNTGGTCNR","confidence":"weak","strand":1,"score":20.518787236152736,"max_score":26.85092}],"6":[{"name":"AbrC3","start":608803,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/AbrC3","description":"Antibiotic production activator","consensus":"GAASGCGRCS","confidence":"strong","strand":1,"score":18.15655576909236,"max_score":18.15656},{"name":"CelR","start":595868,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/CelR","description":"Cellobiose uptake repressor","consensus":"TGGGAGCGCTCCCAN","confidence":"medium","strand":-1,"score":25.87277855583794,"max_score":30.11462},{"name":"CelR","start":595869,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/CelR","description":"Cellobiose uptake repressor","consensus":"TGGGAGCGCTCCCAN","confidence":"medium","strand":1,"score":25.87277855583794,"max_score":30.11462},{"name":"CsoR","start":599924,"species":"Streptomyces lividans","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/CsoR","description":"Copper-responsive repressor","consensus":"ATACCCCTNGGGGGTA","confidence":"weak","strand":-1,"score":22.003655511891324,"max_score":32.37643},{"name":"DmdR1","start":606856,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/DmdR1","description":"Iron(II)-dependent repressor","consensus":"TTAGGTTAGGCTCACCTWA","confidence":"strong","strand":-1,"score":32.03385472695873,"max_score":36.52555},{"name":"NrdR","start":623634,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/NrdR","description":"Represses ribonucleotide reductase encoding genes","consensus":"NCACAASATGTGGGS","confidence":"medium","strand":1,"score":24.29207564033026,"max_score":27.17858},{"name":"CodY","start":604333,"species":"Bacillus, Lactococcus & Streptococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/32/149/","description":"Regulator of stationary phase and virulence in Gram-positive bacteria","consensus":"AWTTTTCAGAAAATT","confidence":"weak","strand":1,"score":17.478871312370572,"max_score":27.78253},{"name":"IolR","start":620200,"species":"Caulobacter crescentus CB15","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/66/138/","description":"Regulator of the inositol catabolism","consensus":"GGANNANNYGTTCCN","confidence":"medium","strand":-1,"score":18.382524115901603,"max_score":23.7932},{"name":"MexT","start":610203,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/76/59/","description":"Global virulence regulator","consensus":"ATCANNNNTGTCGAT","confidence":"weak","strand":-1,"score":18.38252468860315,"max_score":21.84196},{"name":"RutR","start":623562,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/27/6/","description":"Regulator of the pyrimidine and purine metabolism","consensus":"TTGACCRNNTGGTCNR","confidence":"weak","strand":-1,"score":20.300510507466754,"max_score":26.85092},{"name":"ToxT","start":610972,"species":"Vibrio cholerae O395","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/18/16/","description":"Regulator of MSHA biosynthesis","consensus":"TRTTTTTTKA","confidence":"weak","strand":1,"score":14.41581269255117,"max_score":18.57433}],"7":[{"name":"LexA_variant_3","start":696123,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/1/6/","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"TACTGTATAWAWNNMCAGN","confidence":"weak","strand":-1,"score":19.29737061657498,"max_score":32.92827},{"name":"ZuR_variant_1","start":695524,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/ZuR","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TGAANNTCATTTTCA","confidence":"weak","strand":-1,"score":16.957152519250087,"max_score":28.18779},{"name":"CRP","start":699970,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. 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coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/NrdR","description":"Represses ribonucleotide reductase encoding genes","consensus":"NCACAASATGTGGGS","confidence":"weak","strand":1,"score":21.56178634705137,"max_score":27.17858},{"name":"ColR","start":1749121,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/111/58/","description":"Phenol-responsive regulator","consensus":"TTNACNNTTTTTTCAC","confidence":"weak","strand":1,"score":18.426340532229602,"max_score":30.24844},{"name":"ColR","start":1749140,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/111/58/","description":"Phenol-responsive regulator","consensus":"TTNACNNTTTTTTCAC","confidence":"weak","strand":-1,"score":18.836918383317744,"max_score":30.24844},{"name":"ColR","start":1755255,"species":"Pseudomonas putida 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PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/76/59/","description":"Global virulence regulator","consensus":"ATCANNNNTGTCGAT","confidence":"weak","strand":1,"score":16.40389833939572,"max_score":21.84196},{"name":"MexT","start":1775085,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/76/59/","description":"Global virulence regulator","consensus":"ATCANNNNTGTCGAT","confidence":"weak","strand":-1,"score":15.557686946733144,"max_score":21.84196},{"name":"ToxT","start":1762801,"species":"Vibrio cholerae O395","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/18/16/","description":"Regulator of MSHA biosynthesis","consensus":"TRTTTTTTKA","confidence":"weak","strand":1,"score":14.8469656696363,"max_score":18.57433}],"13":[{"name":"NrtR","start":1851153,"species":"Streptomyces 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168","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/1/12/","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"MGAACAWANGTTCN","confidence":"medium","strand":-1,"score":20.9304061722907,"max_score":24.7784},{"name":"NrdR","start":2086435,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/NrdR","description":"Represses ribonucleotide reductase encoding genes","consensus":"NCACAASATGTGGGS","confidence":"medium","strand":1,"score":22.0335535020591,"max_score":27.17858},{"name":"NrdR","start":2086466,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/NrdR","description":"Represses ribonucleotide reductase encoding genes","consensus":"NCACAASATGTGGGS","confidence":"medium","strand":1,"score":23.41761608562575,"max_score":27.17858},{"name":"CRP","start":2103233,"species":"Escherichia coli str. 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K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/1/6/","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"TACTGTATAWAWNNMCAGN","confidence":"weak","strand":1,"score":20.07741896597779,"max_score":32.92827},{"name":"LexA_variant_3","start":6413498,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/1/6/","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"TACTGTATAWAWNNMCAGN","confidence":"weak","strand":1,"score":20.28997433814201,"max_score":32.92827},{"name":"NuR","start":6409306,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/NuR","description":"Nickel-responsive regulator","consensus":"TTGCANANNACTYGCAA","confidence":"weak","strand":1,"score":21.191687695633746,"max_score":30.97839},{"name":"ZuR_variant_1","start":6403706,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/ZuR","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TGAANNTCATTTTCA","confidence":"weak","strand":1,"score":18.439065806184168,"max_score":28.18779},{"name":"CodY","start":6414286,"species":"Bacillus, Lactococcus & Streptococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/32/149/","description":"Regulator of stationary phase and virulence in Gram-positive bacteria","consensus":"AWTTTTCAGAAAATT","confidence":"weak","strand":-1,"score":19.463744083303204,"max_score":27.78253},{"name":"ColR","start":6412414,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/111/58/","description":"Phenol-responsive regulator","consensus":"TTNACNNTTTTTTCAC","confidence":"weak","strand":-1,"score":18.250336263058703,"max_score":30.24844},{"name":"FuR_variant_2","start":6411844,"species":"Caulobacter crescentus CB15","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/8/138/","description":"Ferric Uptake Regulator","consensus":"ATTGCGAAYGNYTCTCAAN","confidence":"weak","strand":-1,"score":21.272293336518125,"max_score":32.74363},{"name":"GnfM","start":6411248,"species":"Geobacter sulfurreducens PCA","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/58/104/","description":"Regulator of nitrogen-fixation genes","consensus":"TGCNNNAAAANNNGGCA","confidence":"weak","strand":1,"score":20.923619548637863,"max_score":27.5541},{"name":"HexR","start":6409683,"species":"Shewanella oneidensis MR-1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/80/218/","description":"Glucose-responsive regulator","consensus":"TTGTAATTTTATTACAR","confidence":"weak","strand":1,"score":17.973480881475076,"max_score":31.73147},{"name":"HipB","start":6409100,"species":"Escherichia coli BL21(DE3)","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/240/6/","description":"Bacterial antitoxin HipB","consensus":"TATCCCNTAGAGCGGATA","confidence":"weak","strand":1,"score":20.416504775993943,"max_score":33.7334},{"name":"MntR","start":6413310,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/30/6/","description":"Manganese transport regulator","consensus":"AAACATAGCAYAGGCTATATT","confidence":"weak","strand":1,"score":20.458237439045863,"max_score":39.62117},{"name":"MogR","start":6413076,"species":"Listeria monocytogenes EGD-e","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/233/35/","description":"Repressor of flagellar motility genes","consensus":"ATTTTTWAANAAAA","confidence":"weak","strand":1,"score":16.92408944162697,"max_score":26.06143},{"name":"MogR","start":6413077,"species":"Listeria monocytogenes EGD-e","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/233/35/","description":"Repressor of flagellar motility genes","consensus":"ATTTTTWAANAAAA","confidence":"weak","strand":1,"score":14.674211161799004,"max_score":26.06143},{"name":"MogR","start":6413078,"species":"Listeria monocytogenes EGD-e","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/233/35/","description":"Repressor of flagellar motility genes","consensus":"ATTTTTWAANAAAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":15.10163238553368,"max_score":26.06143},{"name":"MogR","start":6413079,"species":"Listeria monocytogenes EGD-e","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/233/35/","description":"Repressor of flagellar motility genes","consensus":"ATTTTTWAANAAAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":15.033736605670384,"max_score":26.06143},{"name":"PerR","start":6413228,"species":"Bacillus & Staphylococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/22/170/","description":"Peroxide regulator","consensus":"TATAATTATTATAA","confidence":"weak","strand":1,"score":15.956888089489128,"max_score":28.13881},{"name":"RutR","start":6429150,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/27/6/","description":"Regulator of the pyrimidine and purine metabolism","consensus":"TTGACCRNNTGGTCNR","confidence":"weak","strand":-1,"score":19.67156771652958,"max_score":26.85092},{"name":"ToxT","start":6413085,"species":"Vibrio cholerae O395","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/18/16/","description":"Regulator of MSHA biosynthesis","consensus":"TRTTTTTTKA","confidence":"weak","strand":-1,"score":14.8469656696363,"max_score":18.57433}],"25":[{"name":"AfsQ1","start":7133056,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/AfsQ1","description":"Two-component system AfsQ1-Q2, activator of antibiotic production","consensus":"GTCACNNNNNNGTCAC","confidence":"medium","strand":-1,"score":17.675054747448883,"max_score":19.52302},{"name":"DmdR1","start":7124459,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/DmdR1","description":"Iron(II)-dependent repressor","consensus":"TTAGGTTAGGCTCACCTWA","confidence":"medium","strand":1,"score":30.896454017391793,"max_score":36.52555},{"name":"HypR","start":7128981,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/HypR","description":"L-hydroxyproline utilization repressor","consensus":"TGCMATGTCAC","confidence":"strong","strand":-1,"score":22.053228797910023,"max_score":22.39835},{"name":"HypR","start":7132801,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/HypR","description":"L-hydroxyproline utilization repressor","consensus":"TGCMATGTCAC","confidence":"weak","strand":-1,"score":16.960645641254523,"max_score":22.39835},{"name":"LexA_variant_3","start":7133026,"species":"Escherichia coli str. 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MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/1/6/","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"TACTGTATAWAWNNMCAGN","confidence":"weak","strand":-1,"score":21.55441178636854,"max_score":32.92827}],"26":[{"name":"CatR","start":7285109,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/CatR","description":"H2O2-responsive repressor","consensus":"TGGANMGNRTCTAA","confidence":"medium","strand":-1,"score":18.513516750057807,"max_score":25.31008},{"name":"LexA_variant_1","start":7267954,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/LexA","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"TCGAANKNNTGTTCGA","confidence":"weak","strand":1,"score":20.326676704752575,"max_score":29.65219},{"name":"LexA_variant_1","start":7297708,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/LexA","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"TCGAANKNNTGTTCGA","confidence":"weak","strand":-1,"score":21.8451533716498,"max_score":29.65219},{"name":"FuR_variant_1","start":7264619,"species":"Bacillus, Pseudomonas, Yersinia sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/8/12/","description":"Ferric Uptake Regulator","consensus":"AATGANAATNATTATC","confidence":"weak","strand":1,"score":17.134237590799763,"max_score":29.38453},{"name":"MatP","start":7292986,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. 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MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/7/6/","description":"Cyclic AMP receptor protein","consensus":"TGTGANNNNNNTCACA","confidence":"medium","strand":-1,"score":16.24254621006348,"max_score":19.25568},{"name":"CcpA","start":7402298,"species":"Streptococcus & Clostridium sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/25/180/","description":"Catabolite control protein A","consensus":"GAAAANGNTTNC","confidence":"weak","strand":1,"score":15.695820766148598,"max_score":20.96724},{"name":"ClgR","start":7388988,"species":"Corynebacterium glutamicum ATCC 13032","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/102/77/","description":"Caseinolytic protease gene regulator","consensus":"ACGCCGNNAGCGAACA","confidence":"weak","strand":1,"score":21.03314749972661,"max_score":30.22426},{"name":"ClgR","start":7401909,"species":"Corynebacterium glutamicum ATCC 13032","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/102/77/","description":"Caseinolytic protease gene regulator","consensus":"ACGCCGNNAGCGAACA","confidence":"weak","strand":1,"score":21.516538304311364,"max_score":30.22426},{"name":"ClgR","start":7410181,"species":"Corynebacterium glutamicum ATCC 13032","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/102/77/","description":"Caseinolytic protease gene regulator","consensus":"ACGCCGNNAGCGAACA","confidence":"weak","strand":-1,"score":21.625062761089538,"max_score":30.22426},{"name":"CopR","start":7372962,"species":"Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/121/191/","description":"Copper-responsive regulator","consensus":"RTTTACANWTGTAAAC","confidence":"weak","strand":1,"score":18.61487643525621,"max_score":30.9718},{"name":"CopR","start":7407185,"species":"Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/121/191/","description":"Copper-responsive regulator","consensus":"RTTTACANWTGTAAAC","confidence":"weak","strand":1,"score":17.492885910877597,"max_score":30.9718},{"name":"DosR","start":7376360,"species":"Mycobacterium tuberculosis H37Rv","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/4/25/","description":"Hypoxia stress response regulator","consensus":"KYGGGGACNANYGRCCCNNN","confidence":"medium","strand":1,"score":24.36135082313325,"max_score":29.50795},{"name":"FuR_variant_2","start":7399331,"species":"Caulobacter crescentus CB15","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/8/138/","description":"Ferric Uptake Regulator","consensus":"ATTGCGAAYGNYTCTCAAN","confidence":"weak","strand":-1,"score":20.9394042657695,"max_score":32.74363},{"name":"GnfM","start":7386925,"species":"Geobacter sulfurreducens 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BAA-1116","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/208/197/","description":"Repressor of luminescence","consensus":"TTGCATTTTGCAA","confidence":"weak","strand":1,"score":17.155549215010883,"max_score":26.11696},{"name":"MexT","start":7410159,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/76/59/","description":"Global virulence regulator","consensus":"ATCANNNNTGTCGAT","confidence":"weak","strand":1,"score":17.03990027311734,"max_score":21.84196},{"name":"SypG","start":7382312,"species":"Vibrio fischeri ES114","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/187/19/","description":"Regulator of biofilm formation and host colonization","consensus":"TTCTCAATTTGARAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":16.47804817239536,"max_score":29.24588},{"name":"ToxT","start":7361724,"species":"Vibrio cholerae O395","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/18/16/","description":"Regulator of MSHA biosynthesis","consensus":"TRTTTTTTKA","confidence":"weak","strand":-1,"score":14.291776636967011,"max_score":18.57433},{"name":"ToxT","start":7369681,"species":"Vibrio cholerae O395","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/18/16/","description":"Regulator of MSHA biosynthesis","consensus":"TRTTTTTTKA","confidence":"weak","strand":-1,"score":15.255469132834863,"max_score":18.57433},{"name":"VqsM","start":7415437,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/234/59/","description":"Regulator of quorum-sensing signalling systems","consensus":"GGANNNYNTCGGCCA","confidence":"strong","strand":1,"score":19.188778094252832,"max_score":20.46889}],"30":[{"name":"AbrC3","start":7470981,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/AbrC3","description":"Antibiotic production activator","consensus":"GAASGCGRCS","confidence":"strong","strand":-1,"score":18.15655576909236,"max_score":18.15656},{"name":"CatR","start":7461175,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/CatR","description":"H2O2-responsive repressor","consensus":"TGGANMGNRTCTAA","confidence":"weak","strand":1,"score":17.98654548139751,"max_score":25.31008},{"name":"ZuR_variant_1","start":7470953,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/ZuR","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TGAANNTCATTTTCA","confidence":"weak","strand":1,"score":17.337797823158052,"max_score":28.18779},{"name":"GnfM","start":7465688,"species":"Geobacter sulfurreducens PCA","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/58/104/","description":"Regulator of nitrogen-fixation 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K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/31/6/","description":"Cell cycle regulator","consensus":"GTGACRYTGTCAC","confidence":"weak","strand":-1,"score":19.50116023973905,"max_score":25.75231},{"name":"NtrC","start":7461726,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/86/58/","description":"Nitrogen regulatory protein C","consensus":"TGCACAATTYMGGTGCG","confidence":"weak","strand":1,"score":21.669537115369025,"max_score":29.71721}],"31":[{"name":"AfsQ1","start":7499428,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/AfsQ1","description":"Two-component system AfsQ1-Q2, activator of antibiotic production","consensus":"GTCACNNNNNNGTCAC","confidence":"strong","strand":1,"score":18.33039363216951,"max_score":19.52302},{"name":"LexA_variant_2","start":7515031,"species":"Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/1/12/","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"MGAACAWANGTTCN","confidence":"weak","strand":1,"score":19.649120061900682,"max_score":24.7784},{"name":"HexR","start":7501271,"species":"Shewanella oneidensis MR-1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/80/218/","description":"Glucose-responsive regulator","consensus":"TTGTAATTTTATTACAR","confidence":"weak","strand":-1,"score":16.6513416001913,"max_score":31.73147},{"name":"SypG","start":7528389,"species":"Vibrio fischeri ES114","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/187/19/","description":"Regulator of biofilm formation and host colonization","consensus":"TTCTCAATTTGARAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":17.624471346032728,"max_score":29.24588},{"name":"VqsM","start":7497271,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/234/59/","description":"Regulator of quorum-sensing signalling systems","consensus":"GGANNNYNTCGGCCA","confidence":"strong","strand":1,"score":19.346895489066956,"max_score":20.46889}],"32":[{"name":"AfsR","start":7619198,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/AfsR","description":"Pleiotropic regulatory for antibiotic production","consensus":"GTAAATGAACGC","confidence":"strong","strand":-1,"score":21.398984176481,"max_score":23.04516},{"name":"ArgR","start":7620084,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/ArgR","description":"Regulator of arginine biosynthesis genes","consensus":"YGCATRNNCATGCA","confidence":"medium","strand":1,"score":18.015435988,"max_score":20.00603},{"name":"BldD","start":7643512,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/BldD","description":"Development and antibiotic global regulator","consensus":"GTNACKCTNNGTGA","confidence":"weak","strand":1,"score":18.868580440055737,"max_score":23.43222},{"name":"LexA_variant_2","start":7646964,"species":"Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/1/12/","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"MGAACAWANGTTCN","confidence":"weak","strand":-1,"score":18.68082892162802,"max_score":24.7784},{"name":"LexA_variant_3","start":7612969,"species":"Escherichia coli str. 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