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However, it belongs more specifically to UdgX branch, whose founding member was found to bind uracil in DNA (where it does not belong), without cleaving it, appears to promote DNA repair by a pathway involving RecA, rather than base excision.; This protein belongs to the uracil DNA glycosylase superfamily, members of which act in excision repair of DNA. However, it belongs more specifically to UdgX branch, whose founding member was found to bind uracil in DNA (where it does not belong), without cleaving it, appears to promote DNA repair by a pathway involving RecA, rather than base excision; Derived by automated computational analysis using gene prediction method: Protein Homology."],"product":["UdgX family uracil-DNA binding protein"],"protein_id":["WP_267939182.1"],"transl_table":["11"],"translation":["MSSRLLARRRDRPPTQGRGELRAQPQTTRTRHRIRTAPGGYPHPMAGTEDAYTAEPFVPRRGGLPALREAAADCRGCPLHRTATQTVFGAGKASARVMLVGEQPGDQEDRQGKPFVGPAGKLLDRALTDAGIDPADAYVTNAVKHFKFTRAEPRRRRIHKAPTLRETTACGPWLAAELDRVAPELIVVLGATAGKALLGSSFRVTQARGTVLEEEIHGRPERLVPTVHPSAVLRADDREGAYRGLVSDLEIAARALE"]}},{"location":"[3578743:3579907](-)","type":"gene","qualifiers":{"gene":["mqnE"],"locus_tag":["LJA35_RS15760"]}},{"location":"[3578743:3579907](-)","type":"CDS","qualifiers":{"GO_process":["GO:0009234 - menaquinone biosynthetic process [Evidence 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r:other","tags":["AAS02094.1","AAS02095.1","AAS02096.1","AAS02097.1"],"start":0,"end":0},{"hits":4,"core_gene_hits":1,"blast_score":1719.0,"synteny_score":5,"core_bonus":3,"similarity":100,"pairings":[["input|c22|6348045-6348942|-|LJA35_RS28435|ectoine",1,{"name":"AAS02097.1","genecluster":"BGC0000853.3_c1","start":2452,"end":3345,"strand":"+","annotation":"ThpD","perc_ident":85,"blastscore":512,"perc_coverage":97.31543624161074,"evalue":1.62e-185,"locus_tag":"AAS02097.1","full_name":"BGC0000853.3_AAS02097.1"}],["input|c22|6348948-6349347|-|LJA35_RS28440|ectoine",2,{"name":"AAS02096.1","genecluster":"BGC0000853.3_c1","start":2047,"end":2445,"strand":"+","annotation":"ThpC","perc_ident":83,"blastscore":239,"perc_coverage":99.24242424242425,"evalue":9.63e-83,"locus_tag":"AAS02096.1","full_name":"BGC0000853.3_AAS02096.1"}],["input|c22|6349473-6350745|-|LJA35_RS28445|diaminobutyrate--2-oxoglutarate",3,{"name":"AAS02095.1","genecluster":"BGC0000853.3_c1","start":698,"end":1960,"strand":"+","annotation":"ThpB","perc_ident":85,"blastscore":727,"perc_coverage":100.0,"evalue":2.22e-266,"locus_tag":"AAS02095.1","full_name":"BGC0000853.3_AAS02095.1"}],["input|c22|6350870-6351383|-|LJA35_RS28450|diaminobutyrate",4,{"name":"AAS02094.1","genecluster":"BGC0000853.3_c1","start":9,"end":539,"strand":"+","annotation":"ThpA","perc_ident":70,"blastscore":241,"perc_coverage":102.94117647058823,"evalue":3.34e-82,"locus_tag":"AAS02094.1","full_name":"BGC0000853.3_AAS02094.1"}]]}],[{"accession":"BGC0002052.3","cluster_label":"c1","proteins":["QOE83927.1","QOE83928.1","QOE83929.1","QOE83930.1"],"description":"ectoine","cluster_type":"other:ectoine","tags":["NAI38-5748","NAI38-5749","NAI38-5750","NAI38-5751"],"start":0,"end":0},{"hits":4,"core_gene_hits":1,"blast_score":1688.0,"synteny_score":5,"core_bonus":3,"similarity":100,"pairings":[["input|c22|6348045-6348942|-|LJA35_RS28435|ectoine",1,{"name":"NAI38-5748","genecluster":"BGC0002052.3_c1","start":189,"end":1088,"strand":"-","annotation":"ectoine_dioxygenase","perc_ident":80,"blastscore":489,"perc_coverage":97.31543624161074,"evalue":3.42e-176,"locus_tag":"QOE83927.1","full_name":"BGC0002052.3_NAI38-5748"}],["input|c22|6348948-6349347|-|LJA35_RS28440|ectoine",2,{"name":"NAI38-5749","genecluster":"BGC0002052.3_c1","start":1184,"end":1600,"strand":"-","annotation":"EctC","perc_ident":82,"blastscore":238,"perc_coverage":98.48484848484848,"evalue":3.37e-82,"locus_tag":"QOE83928.1","full_name":"BGC0002052.3_NAI38-5749"}],["input|c22|6349473-6350745|-|LJA35_RS28445|diaminobutyrate--2-oxoglutarate",3,{"name":"NAI38-5750","genecluster":"BGC0002052.3_c1","start":1647,"end":2915,"strand":"-","annotation":"diaminobutyrate--2-oxoglutarate_transaminase","perc_ident":87,"blastscore":736,"perc_coverage":99.52718676122932,"evalue":1.06e-269,"locus_tag":"QOE83929.1","full_name":"BGC0002052.3_NAI38-5750"}],["input|c22|6350870-6351383|-|LJA35_RS28450|diaminobutyrate",4,{"name":"NAI38-5751","genecluster":"BGC0002052.3_c1","start":3051,"end":3620,"strand":"-","annotation":"L-2,4-diaminobutyric_acid_acetyltransferase","perc_ident":63,"blastscore":225,"perc_coverage":105.88235294117648,"evalue":6.29e-76,"locus_tag":"QOE83930.1","full_name":"BGC0002052.3_NAI38-5751"}]]}],[{"accession":"BGC0000858.3","cluster_label":"c1","proteins":["ACB30326.1","ACB30327.1","ACB30328.1","ACB30329.1"],"description":"ectoine","cluster_type":"other:other","tags":["ACB30326.1","ACB30327.1","ACB30328.1","ACB30329.1"],"start":0,"end":0},{"hits":2,"core_gene_hits":1,"blast_score":595.0,"synteny_score":2,"core_bonus":3,"similarity":50,"pairings":[["input|c22|6348948-6349347|-|LJA35_RS28440|ectoine",2,{"name":"ACB30328.1","genecluster":"BGC0000858.3_c1","start":1964,"end":2371,"strand":"+","annotation":"ectoine_synthase","perc_ident":51,"blastscore":148,"perc_coverage":94.6969696969697,"evalue":6.63e-47,"locus_tag":"ACB30328.1","full_name":"BGC0000858.3_ACB30328.1"}],["input|c22|6349473-6350745|-|LJA35_RS28445|diaminobutyrate--2-oxoglutarate",3,{"name":"ACB30327.1","genecluster":"BGC0000858.3_c1","start":690,"end":1967,"strand":"+","annotation":"L-2,4-diaminobutyric_acid_aminotransferase","perc_ident":55,"blastscore":447,"perc_coverage":97.39952718676122,"evalue":6.42e-156,"locus_tag":"ACB30327.1","full_name":"BGC0000858.3_ACB30327.1"}]]}],[{"accession":"BGC0000852.5","cluster_label":"c1","proteins":["AAK12083.1","AAK12084.1","AAK12085.1"],"description":"ectoine","cluster_type":"other:other","tags":["AAK12083.1","AAK12084.1","AAK12085.1"],"start":0,"end":0},{"hits":2,"core_gene_hits":1,"blast_score":574.0,"synteny_score":2,"core_bonus":3,"similarity":66,"pairings":[["input|c22|6348948-6349347|-|LJA35_RS28440|ectoine",2,{"name":"AAK12085.1","genecluster":"BGC0000852.5_c1","start":2450,"end":2854,"strand":"+","annotation":"EctC","perc_ident":47,"blastscore":122,"perc_coverage":100.0,"evalue":9.64e-37,"locus_tag":"AAK12085.1","full_name":"BGC0000852.5_AAK12085.1"}],["input|c22|6349473-6350745|-|LJA35_RS28445|diaminobutyrate--2-oxo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beta-lactam",33.0,52.0,50.43478260869565,1.05e-7],["ATL73056.1","LuxR_family_transcriptional_regulator","BGC0001807.4",1,"NRPS:Type I+PKS",42.0,52.0,31.30434782608696,1.84e-7],["AGC09510.1","TetR_regulator","BGC0001183.5",1,"PKS",42.0,52.0,31.30434782608696,1.86e-7],["BAE93717.1","putative_transcriptional_regulator,_LuxR_family","BGC0000164.5",1,"PKS",44.0,50.0,27.82608695652174,7.14e-7],["ABV91292.1","putative_transcriptional_regulator","BGC0000158.5",1,"PKS:Type I",36.0,49.0,37.826086956521735,1.99e-6],["ABI94385.1","TMC_biosynthetic_enzyme_R5","BGC0000157.5",1,"PKS",36.0,49.0,37.826086956521735,2.02e-6],["AAY93437.1","DNA-binding_response_regulator","BGC0000413.5",1,"NRPS:Type I",27.0,47.0,90.0,3.05e-6],["ABV91302.1","putative_regulatory_protein","BGC0000158.5",1,"PKS:Type 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I",53.0,303.0,97.0059880239521,2.3e-101]],"LJA35_RS03840":[["crtaQ","","BGC0001456.3",1,"terpene",68.0,221.0,85.64356435643565,1.76e-73],["ADE22347.1","transcriptional_regulator","BGC0000065.5",1,"PKS:Iterative type I",55.0,180.0,90.5940594059406,1.26e-57]],"LJA35_RS03845":[["ADE22348.1","lipoprotein","BGC0000065.5",1,"PKS:Iterative type I",59.0,292.0,97.72727272727273,2.17e-99]],"LJA35_RS03850":[["AKA59073.1","hydrolase","BGC0001619.5",1,"PKS",56.0,238.0,92.79661016949152,3.8e-79],["QEV63697.1","HAD_family_phosphatase","BGC0002657.2",1,"PKS+NRPS:Type I",32.0,76.0,80.9322033898305,2.47e-16]],"LJA35_RS03860":[["QPP46759.1","LuxR_family_transcriptional_regulator","BGC0002500.2",1,"PKS",69.0,1055.0,99.66216216216216,0.0]]},"5":{"LJA35_RS36455":[["BAJ05877.1","putative_pirin-like_protein","BGC0000872.5",1,"other:other",84.0,60.0,88.57142857142857,9.26e-13],["AHH25573.1","pirin-like_protein","BGC0000957.5",1,"NRPS:Type 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K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/30/6/","description":"Manganese transport regulator","consensus":"AAACATAGCAYAGGCTATATT","confidence":"weak","strand":1,"score":21.072346285426537,"max_score":39.62117}],"5":[{"name":"CsoR","start":854586,"species":"Streptomyces lividans","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/CsoR","description":"Copper-responsive repressor","consensus":"ATACCCCTNGGGGGTA","confidence":"medium","strand":1,"score":25.695211116107092,"max_score":32.37643},{"name":"DmdR1","start":946223,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/DmdR1","description":"Iron(II)-dependent repressor","consensus":"TTAGGTTAGGCTCACCTWA","confidence":"weak","strand":1,"score":21.28546882711189,"max_score":36.52555},{"name":"ZuR_variant_1","start":898466,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/ZuR","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TGAANNTCATTTTCA","confidence":"weak","strand":1,"score":18.602872928940695,"max_score":28.18779},{"name":"ZuR_variant_1","start":926634,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/ZuR","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TGAANNTCATTTTCA","confidence":"medium","strand":-1,"score":21.20543088504821,"max_score":28.18779},{"name":"ZuR_variant_1","start":926640,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/ZuR","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TGAANNTCATTTTCA","confidence":"weak","strand":1,"score":20.4057613667494,"max_score":28.18779},{"name":"ZuR_variant_1","start":933612,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/ZuR","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TGAANNTCATTTTCA","confidence":"weak","strand":1,"score":18.470584070737253,"max_score":28.18779},{"name":"ZuR_variant_1","start":938050,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/ZuR","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TGAANNTCATTTTCA","confidence":"strong","strand":1,"score":24.463906788841825,"max_score":28.18779},{"name":"ANR","start":883424,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/143/58/","description":"Anaerobic transcriptional regulator","consensus":"TTGAYCCAGATCAA","confidence":"weak","strand":1,"score":18.473616905393772,"max_score":26.32537},{"name":"ANR","start":945692,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/143/58/","description":"Anaerobic transcriptional regulator","consensus":"TTGAYCCAGATCAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":18.473616905393772,"max_score":26.32537},{"name":"ArcA","start":926658,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/47/6/","description":"Repressor of carbon oxidation","consensus":"WTGTTAAWNNNWTGTTAN","confidence":"weak","strand":-1,"score":14.433388662285411,"max_score":21.55091},{"name":"CRP","start":844858,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. 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MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/31/6/","description":"Cell cycle regulator","consensus":"GTGACRYTGTCAC","confidence":"weak","strand":1,"score":19.108645757086347,"max_score":25.75231}],"8":[{"name":"BldD","start":1568795,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/BldD","description":"Development and antibiotic global regulator","consensus":"GTNACKCTNNGTGA","confidence":"weak","strand":-1,"score":18.58364092494061,"max_score":23.43222},{"name":"HypR","start":1559099,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/HypR","description":"L-hydroxyproline utilization repressor","consensus":"TGCMATGTCAC","confidence":"weak","strand":-1,"score":20.41981498031416,"max_score":22.39835},{"name":"HypR","start":1564783,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/HypR","description":"L-hydroxyproline utilization repressor","consensus":"TGCMATGTCAC","confidence":"strong","strand":1,"score":22.398352669785243,"max_score":22.39835},{"name":"ZuR_variant_2","start":1559097,"species":"Pseudomonas protegens Pf-5","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/46/235/","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TTGTTATAANATAACAT","confidence":"weak","strand":-1,"score":16.35179071184835,"max_score":33.14175},{"name":"CRP","start":1558973,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/7/6/","description":"Cyclic AMP receptor protein","consensus":"TGTGANNNNNNTCACA","confidence":"weak","strand":-1,"score":16.033289190916168,"max_score":19.25568},{"name":"GnfM","start":1568671,"species":"Geobacter sulfurreducens PCA","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/58/104/","description":"Regulator of nitrogen-fixation genes","consensus":"TGCNNNAAAANNNGGCA","confidence":"weak","strand":-1,"score":18.88580707865459,"max_score":27.5541},{"name":"VqsM","start":1567482,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/234/59/","description":"Regulator of quorum-sensing signalling systems","consensus":"GGANNNYNTCGGCCA","confidence":"strong","strand":1,"score":20.468886013445566,"max_score":20.46889}],"9":[{"name":"CatR","start":1621522,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/CatR","description":"H2O2-responsive repressor","consensus":"TGGANMGNRTCTAA","confidence":"weak","strand":1,"score":17.98654548139751,"max_score":25.31008},{"name":"DasR","start":1598869,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/DasR","description":"N-acetylglucosamine dependent repressor","consensus":"ANWGGTCTAGACCANW","confidence":"weak","strand":1,"score":19.223707900926723,"max_score":27.0358},{"name":"ArcA","start":1592620,"species":"Escherichia coli str. 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MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/47/6/","description":"Repressor of carbon oxidation","consensus":"WTGTTAAWNNNWTGTTAN","confidence":"weak","strand":-1,"score":15.229092542810646,"max_score":21.55091},{"name":"CodY","start":1620140,"species":"Bacillus, Lactococcus & Streptococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/32/149/","description":"Regulator of stationary phase and virulence in Gram-positive bacteria","consensus":"AWTTTTCAGAAAATT","confidence":"weak","strand":1,"score":19.33181874127859,"max_score":27.78253},{"name":"ColR","start":1620135,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/111/58/","description":"Phenol-responsive regulator","consensus":"TTNACNNTTTTTTCAC","confidence":"weak","strand":1,"score":17.55155740123653,"max_score":30.24844},{"name":"MogR","start":1598914,"species":"Listeria monocytogenes EGD-e","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/233/35/","description":"Repressor of flagellar motility genes","consensus":"ATTTTTWAANAAAA","confidence":"weak","strand":1,"score":13.901334558575154,"max_score":26.06143},{"name":"MogR","start":1620140,"species":"Listeria monocytogenes EGD-e","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/233/35/","description":"Repressor of flagellar motility genes","consensus":"ATTTTTWAANAAAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":14.961715485351348,"max_score":26.06143},{"name":"MogR","start":1620141,"species":"Listeria monocytogenes EGD-e","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/233/35/","description":"Repressor of flagellar motility genes","consensus":"ATTTTTWAANAAAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":16.521144054356782,"max_score":26.06143},{"name":"RpoN","start":1604290,"species":"Salmonella & Vibrio sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/9/27/","description":"Regulator of nitrogen assimilation and virulence","consensus":"GGCAYNNWNNTTGC","confidence":"medium","strand":1,"score":16.824840068946443,"max_score":18.4649}],"10":[{"name":"BldD","start":1716269,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/BldD","description":"Development and antibiotic global regulator","consensus":"GTNACKCTNNGTGA","confidence":"weak","strand":-1,"score":19.069998216467923,"max_score":23.43222},{"name":"LexA_variant_1","start":1728855,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/LexA","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"TCGAANKNNTGTTCGA","confidence":"weak","strand":-1,"score":20.10138356419627,"max_score":29.65219},{"name":"LexA_variant_2","start":1728856,"species":"Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/1/12/","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"MGAACAWANGTTCN","confidence":"weak","strand":1,"score":18.000027223759812,"max_score":24.7784},{"name":"ZuR_variant_1","start":1713110,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/ZuR","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TGAANNTCATTTTCA","confidence":"weak","strand":1,"score":16.279211367594385,"max_score":28.18779},{"name":"ColR","start":1713189,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/111/58/","description":"Phenol-responsive regulator","consensus":"TTNACNNTTTTTTCAC","confidence":"weak","strand":-1,"score":17.53787814223396,"max_score":30.24844},{"name":"FuR_variant_1","start":1713105,"species":"Bacillus, Pseudomonas, Yersinia sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/8/12/","description":"Ferric Uptake Regulator","consensus":"AATGANAATNATTATC","confidence":"weak","strand":-1,"score":17.75697486795478,"max_score":29.38453},{"name":"FuR_variant_1","start":1717543,"species":"Bacillus, Pseudomonas, Yersinia sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/8/12/","description":"Ferric Uptake Regulator","consensus":"AATGANAATNATTATC","confidence":"weak","strand":1,"score":15.688695330147615,"max_score":29.38453},{"name":"MexT","start":1703677,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/76/59/","description":"Global virulence regulator","consensus":"ATCANNNNTGTCGAT","confidence":"weak","strand":-1,"score":16.40389833939572,"max_score":21.84196},{"name":"MexT","start":1716268,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/76/59/","description":"Global virulence regulator","consensus":"ATCANNNNTGTCGAT","confidence":"weak","strand":-1,"score":16.13927643591118,"max_score":21.84196},{"name":"RutR","start":1702263,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/27/6/","description":"Regulator of the pyrimidine and purine metabolism","consensus":"TTGACCRNNTGGTCNR","confidence":"medium","strand":1,"score":20.91056253666968,"max_score":26.85092},{"name":"ToxT","start":1713364,"species":"Vibrio cholerae O395","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/18/16/","description":"Regulator of MSHA biosynthesis","consensus":"TRTTTTTTKA","confidence":"weak","strand":-1,"score":14.023843431720378,"max_score":18.57433}],"11":[{"name":"AfsQ1","start":1851779,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/AfsQ1","description":"Two-component system AfsQ1-Q2, activator of antibiotic production","consensus":"GTCACNNNNNNGTCAC","confidence":"medium","strand":1,"score":17.275134829679875,"max_score":19.52302},{"name":"ArgR","start":1854855,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/ArgR","description":"Regulator of arginine biosynthesis genes","consensus":"YGCATRNNCATGCA","confidence":"weak","strand":-1,"score":17.26200737,"max_score":20.00603},{"name":"HypR","start":1795875,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/HypR","description":"L-hydroxyproline utilization repressor","consensus":"TGCMATGTCAC","confidence":"weak","strand":-1,"score":18.939183330725605,"max_score":22.39835},{"name":"OsdR","start":1848475,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/OsdR","description":"Development and stress management regulator","consensus":"GGGCCGACCGGCCCT","confidence":"medium","strand":-1,"score":24.852157599513887,"max_score":30.11854},{"name":"ZuR_variant_1","start":1842234,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/ZuR","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TGAANNTCATTTTCA","confidence":"weak","strand":1,"score":17.09102246429896,"max_score":28.18779},{"name":"ZuR_variant_2","start":1823551,"species":"Pseudomonas protegens Pf-5","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/46/235/","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TTGTTATAANATAACAT","confidence":"weak","strand":-1,"score":15.299420224466148,"max_score":33.14175},{"name":"ANR","start":1814573,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/143/58/","description":"Anaerobic transcriptional regulator","consensus":"TTGAYCCAGATCAA","confidence":"weak","strand":1,"score":18.473616905393772,"max_score":26.32537},{"name":"ArcA","start":1839241,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/47/6/","description":"Repressor of carbon oxidation","consensus":"WTGTTAAWNNNWTGTTAN","confidence":"weak","strand":-1,"score":14.297011209860006,"max_score":21.55091},{"name":"DosR","start":1864964,"species":"Mycobacterium tuberculosis H37Rv","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/4/25/","description":"Hypoxia stress response regulator","consensus":"KYGGGGACNANYGRCCCNNN","confidence":"medium","strand":-1,"score":23.82881176266244,"max_score":29.50795},{"name":"HexR","start":1805871,"species":"Shewanella oneidensis MR-1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/80/218/","description":"Glucose-responsive regulator","consensus":"TTGTAATTTTATTACAR","confidence":"weak","strand":1,"score":18.22319309261688,"max_score":31.73147},{"name":"RutR","start":1830851,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. 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K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/27/6/","description":"Regulator of the pyrimidine and purine metabolism","consensus":"TTGACCRNNTGGTCNR","confidence":"weak","strand":1,"score":19.31648758078998,"max_score":26.85092},{"name":"VqsM","start":2016223,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/234/59/","description":"Regulator of quorum-sensing signalling systems","consensus":"GGANNNYNTCGGCCA","confidence":"medium","strand":1,"score":18.49753621820231,"max_score":20.46889}],"13":[{"name":"LexA_variant_1","start":2135320,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/LexA","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"TCGAANKNNTGTTCGA","confidence":"weak","strand":1,"score":23.09332347729913,"max_score":29.65219},{"name":"LexA_variant_1","start":2151408,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/LexA","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"TCGAANKNNTGTTCGA","confidence":"weak","strand":-1,"score":19.884861963829042,"max_score":29.65219},{"name":"LexA_variant_2","start":2135321,"species":"Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/1/12/","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"MGAACAWANGTTCN","confidence":"medium","strand":-1,"score":20.9304061722907,"max_score":24.7784},{"name":"NrdR","start":2134973,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/NrdR","description":"Represses ribonucleotide reductase encoding genes","consensus":"NCACAASATGTGGGS","confidence":"medium","strand":-1,"score":22.137529382162167,"max_score":27.17858},{"name":"NrdR","start":2134975,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/NrdR","description":"Represses ribonucleotide reductase encoding genes","consensus":"NCACAASATGTGGGS","confidence":"strong","strand":1,"score":25.898497515099532,"max_score":27.17858},{"name":"NrdR","start":2135006,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/NrdR","description":"Represses ribonucleotide reductase encoding genes","consensus":"NCACAASATGTGGGS","confidence":"strong","strand":1,"score":26.063359264703866,"max_score":27.17858},{"name":"CRP","start":2151401,"species":"Escherichia coli str. 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MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/7/6/","description":"Cyclic AMP receptor protein","consensus":"TGTGANNNNNNTCACA","confidence":"medium","strand":-1,"score":16.262097192197473,"max_score":19.25568},{"name":"CcpA","start":2151438,"species":"Streptococcus & Clostridium sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/25/180/","description":"Catabolite control protein A","consensus":"GAAAANGNTTNC","confidence":"medium","strand":-1,"score":17.704467817552626,"max_score":20.96724},{"name":"ColR","start":2126366,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/111/58/","description":"Phenol-responsive regulator","consensus":"TTNACNNTTTTTTCAC","confidence":"weak","strand":-1,"score":18.382352519852265,"max_score":30.24844},{"name":"ColR","start":2134169,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/111/58/","description":"Phenol-responsive regulator","consensus":"TTNACNNTTTTTTCAC","confidence":"weak","strand":-1,"score":18.250336263058706,"max_score":30.24844},{"name":"CopR","start":2144444,"species":"Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/121/191/","description":"Copper-responsive regulator","consensus":"RTTTACANWTGTAAAC","confidence":"weak","strand":1,"score":19.126376774036345,"max_score":30.9718},{"name":"IolR","start":2144470,"species":"Caulobacter crescentus CB15","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/66/138/","description":"Regulator of the inositol catabolism","consensus":"GGANNANNYGTTCCN","confidence":"medium","strand":1,"score":18.36971146471721,"max_score":23.7932},{"name":"PsrA","start":2135321,"species":"Pseudomonas sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/109/59/","description":"Oleic acid responsive regulator","consensus":"CAAACGYNNGTTTG","confidence":"weak","strand":1,"score":19.771607294944598,"max_score":25.87793},{"name":"ToxT","start":2126367,"species":"Vibrio cholerae O395","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/18/16/","description":"Regulator of MSHA biosynthesis","consensus":"TRTTTTTTKA","confidence":"weak","strand":-1,"score":13.822722310946613,"max_score":18.57433}],"14":[{"name":"AfsQ1","start":2579639,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/AfsQ1","description":"Two-component system AfsQ1-Q2, activator of antibiotic production","consensus":"GTCACNNNNNNGTCAC","confidence":"weak","strand":-1,"score":16.86011416115592,"max_score":19.52302},{"name":"NuR","start":2580415,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/NuR","description":"Nickel-responsive regulator","consensus":"TTGCANANNACTYGCAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":19.790285560610695,"max_score":30.97839},{"name":"ZuR_variant_2","start":2580392,"species":"Pseudomonas protegens Pf-5","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/46/235/","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TTGTTATAANATAACAT","confidence":"weak","strand":1,"score":17.5553857371803,"max_score":33.14175},{"name":"ZuR_variant_2","start":2584282,"species":"Pseudomonas protegens Pf-5","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/46/235/","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TTGTTATAANATAACAT","confidence":"weak","strand":-1,"score":16.700334073091394,"max_score":33.14175},{"name":"ColR","start":2580416,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/111/58/","description":"Phenol-responsive regulator","consensus":"TTNACNNTTTTTTCAC","confidence":"weak","strand":1,"score":17.012808299288974,"max_score":30.24844},{"name":"HexR","start":2580363,"species":"Shewanella oneidensis MR-1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/80/218/","description":"Glucose-responsive regulator","consensus":"TTGTAATTTTATTACAR","confidence":"weak","strand":1,"score":15.614385812496701,"max_score":31.73147},{"name":"HexR","start":2584309,"species":"Shewanella oneidensis MR-1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/80/218/","description":"Glucose-responsive regulator","consensus":"TTGTAATTTTATTACAR","confidence":"weak","strand":1,"score":15.33932638921326,"max_score":31.73147},{"name":"MexT","start":2582740,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/76/59/","description":"Global virulence regulator","consensus":"ATCANNNNTGTCGAT","confidence":"medium","strand":-1,"score":20.096529134326047,"max_score":21.84196},{"name":"MogR","start":2584282,"species":"Listeria monocytogenes EGD-e","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/233/35/","description":"Repressor of flagellar motility genes","consensus":"ATTTTTWAANAAAA","confidence":"weak","strand":1,"score":12.962238043174468,"max_score":26.06143},{"name":"MogR","start":2584283,"species":"Listeria monocytogenes EGD-e","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/233/35/","description":"Repressor of flagellar motility genes","consensus":"ATTTTTWAANAAAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":14.403832630293632,"max_score":26.06143},{"name":"MogR","start":2584286,"species":"Listeria monocytogenes EGD-e","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/233/35/","description":"Repressor of flagellar motility genes","consensus":"ATTTTTWAANAAAA","confidence":"weak","strand":1,"score":12.50477647663971,"max_score":26.06143},{"name":"MogR","start":2584287,"species":"Listeria monocytogenes EGD-e","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/233/35/","description":"Repressor of flagellar motility genes","consensus":"ATTTTTWAANAAAA","confidence":"weak","strand":1,"score":13.279528380813563,"max_score":26.06143}],"15":[{"name":"AbrC3","start":2788726,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/AbrC3","description":"Antibiotic production activator","consensus":"GAASGCGRCS","confidence":"strong","strand":1,"score":18.15655576909236,"max_score":18.15656},{"name":"AfsR","start":2788921,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/AfsR","description":"Pleiotropic regulatory for antibiotic production","consensus":"GTAAATGAACGC","confidence":"medium","strand":1,"score":19.283765867148958,"max_score":23.04516},{"name":"ArgR","start":2724181,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/ArgR","description":"Regulator of arginine biosynthesis genes","consensus":"YGCATRNNCATGCA","confidence":"weak","strand":-1,"score":16.946746622,"max_score":20.00603},{"name":"ArgR","start":2789933,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/ArgR","description":"Regulator of arginine biosynthesis genes","consensus":"YGCATRNNCATGCA","confidence":"weak","strand":-1,"score":16.251975577,"max_score":20.00603},{"name":"CsoR","start":2719130,"species":"Streptomyces lividans","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/CsoR","description":"Copper-responsive repressor","consensus":"ATACCCCTNGGGGGTA","confidence":"weak","strand":1,"score":21.843647866055502,"max_score":32.37643},{"name":"HypR","start":2788317,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/HypR","description":"L-hydroxyproline utilization repressor","consensus":"TGCMATGTCAC","confidence":"weak","strand":1,"score":17.672826587597438,"max_score":22.39835},{"name":"LexA_variant_1","start":2746530,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/LexA","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"TCGAANKNNTGTTCGA","confidence":"weak","strand":-1,"score":20.001100832850067,"max_score":29.65219},{"name":"LexA_variant_2","start":2732805,"species":"Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/1/12/","description":"Repressor of DNA damage 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EGD-e","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/233/35/","description":"Repressor of flagellar motility genes","consensus":"ATTTTTWAANAAAA","confidence":"weak","strand":1,"score":13.490638416816173,"max_score":26.06143},{"name":"PsrA","start":3001727,"species":"Pseudomonas sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/109/59/","description":"Oleic acid responsive regulator","consensus":"CAAACGYNNGTTTG","confidence":"weak","strand":1,"score":18.876743143288806,"max_score":25.87793}],"19":[{"name":"NrtR","start":4700421,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/NrtR","description":"NAD synthesis repressor","consensus":"TTNTNGTCRNNNTGACGATTA","confidence":"weak","strand":-1,"score":23.220782845139592,"max_score":35.6303},{"name":"FuR_variant_2","start":4703254,"species":"Caulobacter crescentus CB15","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/8/138/","description":"Ferric Uptake Regulator","consensus":"ATTGCGAAYGNYTCTCAAN","confidence":"weak","strand":1,"score":22.615622910039868,"max_score":32.74363},{"name":"MexT","start":4702594,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/76/59/","description":"Global virulence regulator","consensus":"ATCANNNNTGTCGAT","confidence":"weak","strand":-1,"score":17.30452217660188,"max_score":21.84196},{"name":"MogR","start":4703090,"species":"Listeria monocytogenes EGD-e","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/233/35/","description":"Repressor of flagellar motility genes","consensus":"ATTTTTWAANAAAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":13.973872160336152,"max_score":26.06143},{"name":"SypG","start":4703813,"species":"Vibrio fischeri 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coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/CatR","description":"H2O2-responsive repressor","consensus":"TGGANMGNRTCTAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":17.98654548139751,"max_score":25.31008},{"name":"CelR","start":5206771,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/CelR","description":"Cellobiose uptake repressor","consensus":"TGGGAGCGCTCCCAN","confidence":"strong","strand":-1,"score":28.619889709954286,"max_score":30.11462},{"name":"CelR","start":5206772,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/CelR","description":"Cellobiose uptake repressor","consensus":"TGGGAGCGCTCCCAN","confidence":"medium","strand":1,"score":26.655324315205412,"max_score":30.11462},{"name":"CelR","start":5210358,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/CelR","description":"Cellobiose uptake repressor","consensus":"TGGGAGCGCTCCCAN","confidence":"strong","strand":-1,"score":28.647536693553665,"max_score":30.11462},{"name":"CelR","start":5210359,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/CelR","description":"Cellobiose uptake repressor","consensus":"TGGGAGCGCTCCCAN","confidence":"strong","strand":1,"score":28.647536693553665,"max_score":30.11462},{"name":"DasR","start":5218547,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/DasR","description":"N-acetylglucosamine dependent repressor","consensus":"ANWGGTCTAGACCANW","confidence":"medium","strand":-1,"score":23.92294204738202,"max_score":27.0358},{"name":"DmdR1","start":5225359,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/DmdR1","description":"Iron(II)-dependent 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MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/47/6/","description":"Repressor of carbon oxidation","consensus":"WTGTTAAWNNNWTGTTAN","confidence":"weak","strand":1,"score":17.82570130095611,"max_score":21.55091},{"name":"CodY","start":5214261,"species":"Bacillus, Lactococcus & Streptococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/32/149/","description":"Regulator of stationary phase and virulence in Gram-positive bacteria","consensus":"AWTTTTCAGAAAATT","confidence":"weak","strand":-1,"score":17.16107158455371,"max_score":27.78253},{"name":"FuR_variant_2","start":5210211,"species":"Caulobacter crescentus CB15","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/8/138/","description":"Ferric Uptake Regulator","consensus":"ATTGCGAAYGNYTCTCAAN","confidence":"weak","strand":-1,"score":21.891952669496415,"max_score":32.74363},{"name":"HipB","start":5214839,"species":"Escherichia coli BL21(DE3)","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/240/6/","description":"Bacterial antitoxin HipB","consensus":"TATCCCNTAGAGCGGATA","confidence":"weak","strand":1,"score":23.052814156715314,"max_score":33.7334},{"name":"MntR","start":5225361,"species":"Escherichia coli str. 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MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/27/6/","description":"Regulator of the pyrimidine and purine metabolism","consensus":"TTGACCRNNTGGTCNR","confidence":"medium","strand":-1,"score":22.352326090013992,"max_score":26.85092},{"name":"VqsM","start":5218486,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/234/59/","description":"Regulator of quorum-sensing signalling systems","consensus":"GGANNNYNTCGGCCA","confidence":"medium","strand":1,"score":17.711284126585063,"max_score":20.46889}],"21":[{"name":"AfsQ1","start":5315382,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/AfsQ1","description":"Two-component system AfsQ1-Q2, activator of antibiotic production","consensus":"GTCACNNNNNNGTCAC","confidence":"medium","strand":-1,"score":17.108039681418468,"max_score":19.52302},{"name":"ZuR_variant_2","start":5321805,"species":"Pseudomonas protegens Pf-5","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/46/235/","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TTGTTATAANATAACAT","confidence":"weak","strand":-1,"score":14.91772581336948,"max_score":33.14175},{"name":"ColR","start":5319456,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/111/58/","description":"Phenol-responsive regulator","consensus":"TTNACNNTTTTTTCAC","confidence":"weak","strand":1,"score":18.816249046382424,"max_score":30.24844},{"name":"MntR","start":5313223,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/30/6/","description":"Manganese transport regulator","consensus":"AAACATAGCAYAGGCTATATT","confidence":"weak","strand":1,"score":20.420269588846843,"max_score":39.62117}],"22":[{"name":"AfsQ1","start":6351548,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/AfsQ1","description":"Two-component system AfsQ1-Q2, activator of antibiotic production","consensus":"GTCACNNNNNNGTCAC","confidence":"medium","strand":1,"score":17.61616891276941,"max_score":19.52302},{"name":"NrtR","start":6348932,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/NrtR","description":"NAD synthesis repressor","consensus":"TTNTNGTCRNNNTGACGATTA","confidence":"weak","strand":-1,"score":19.147528324710763,"max_score":35.6303},{"name":"CRP","start":6351538,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. 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K-12 substr. 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K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/27/6/","description":"Regulator of the pyrimidine and purine metabolism","consensus":"TTGACCRNNTGGTCNR","confidence":"weak","strand":1,"score":19.784724749954275,"max_score":26.85092},{"name":"VqsM","start":7043216,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/234/59/","description":"Regulator of quorum-sensing signalling systems","consensus":"GGANNNYNTCGGCCA","confidence":"medium","strand":1,"score":18.923316951024496,"max_score":20.46889}],"24":[{"name":"DasR","start":7419708,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/DasR","description":"N-acetylglucosamine dependent repressor","consensus":"ANWGGTCTAGACCANW","confidence":"medium","strand":-1,"score":22.471196374737865,"max_score":27.0358},{"name":"DasR","start":7419820,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/DasR","description":"N-acetylglucosamine dependent repressor","consensus":"ANWGGTCTAGACCANW","confidence":"medium","strand":-1,"score":23.764577245219414,"max_score":27.0358},{"name":"DasR","start":7419841,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/DasR","description":"N-acetylglucosamine dependent repressor","consensus":"ANWGGTCTAGACCANW","confidence":"medium","strand":1,"score":23.36031805409466,"max_score":27.0358},{"name":"HypR","start":7379870,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/HypR","description":"L-hydroxyproline utilization repressor","consensus":"TGCMATGTCAC","confidence":"weak","strand":1,"score":18.594059458850385,"max_score":22.39835},{"name":"NrtR","start":7410767,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/NrtR","description":"NAD synthesis repressor","consensus":"TTNTNGTCRNNNTGACGATTA","confidence":"weak","strand":-1,"score":19.145029189634617,"max_score":35.6303},{"name":"ZuR_variant_1","start":7381737,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/ZuR","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TGAANNTCATTTTCA","confidence":"weak","strand":-1,"score":17.64519150283831,"max_score":28.18779},{"name":"ANR","start":7410722,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/143/58/","description":"Anaerobic transcriptional regulator","consensus":"TTGAYCCAGATCAA","confidence":"medium","strand":-1,"score":20.54400623328517,"max_score":26.32537},{"name":"ArcA","start":7387312,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/47/6/","description":"Repressor of carbon oxidation","consensus":"WTGTTAAWNNNWTGTTAN","confidence":"weak","strand":1,"score":14.7189881771924,"max_score":21.55091},{"name":"CRP","start":7419046,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/7/6/","description":"Cyclic AMP receptor protein","consensus":"TGTGANNNNNNTCACA","confidence":"weak","strand":-1,"score":15.80167978941462,"max_score":19.25568},{"name":"ClgR","start":7418835,"species":"Corynebacterium glutamicum ATCC 13032","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/102/77/","description":"Caseinolytic protease gene regulator","consensus":"ACGCCGNNAGCGAACA","confidence":"weak","strand":1,"score":21.665984309041423,"max_score":30.22426},{"name":"CodY","start":7384298,"species":"Bacillus, Lactococcus & Streptococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/32/149/","description":"Regulator of stationary phase and virulence in Gram-positive bacteria","consensus":"AWTTTTCAGAAAATT","confidence":"weak","strand":1,"score":15.660316505903545,"max_score":27.78253},{"name":"CodY","start":7420708,"species":"Bacillus, Lactococcus & Streptococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/32/149/","description":"Regulator of stationary phase and virulence in Gram-positive bacteria","consensus":"AWTTTTCAGAAAATT","confidence":"weak","strand":1,"score":15.45730572731096,"max_score":27.78253},{"name":"ColR","start":7400042,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/111/58/","description":"Phenol-responsive regulator","consensus":"TTNACNNTTTTTTCAC","confidence":"weak","strand":-1,"score":17.891521518007448,"max_score":30.24844},{"name":"ColR","start":7421233,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/111/58/","description":"Phenol-responsive regulator","consensus":"TTNACNNTTTTTTCAC","confidence":"weak","strand":1,"score":20.22896261226614,"max_score":30.24844},{"name":"GnfM","start":7386858,"species":"Geobacter sulfurreducens PCA","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/58/104/","description":"Regulator of nitrogen-fixation genes","consensus":"TGCNNNAAAANNNGGCA","confidence":"weak","strand":-1,"score":19.645170090417377,"max_score":27.5541},{"name":"HexR","start":7420722,"species":"Shewanella oneidensis MR-1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/80/218/","description":"Glucose-responsive regulator","consensus":"TTGTAATTTTATTACAR","confidence":"weak","strand":-1,"score":21.73638783197466,"max_score":31.73147},{"name":"MatP","start":7410778,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. 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K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/27/6/","description":"Regulator of the pyrimidine and purine metabolism","consensus":"TTGACCRNNTGGTCNR","confidence":"weak","strand":-1,"score":19.416355676364248,"max_score":26.85092},{"name":"RutR","start":7413028,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. 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