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rule-based-clusters)"],"transl_table":["11"],"translation":["MTTTDHLRGRVALVTGAAKSLGADIVRRLAEGGAHVIVNYFHSVEQAESLRAELEQAGHSCEFIRASVAKTSEIDRMFDLVRERHGRLDILINNAAGGAFLPLFGVDDTYWQRAWSTNVMAAYHCSRRAAELMAGREGASILCLSSVGAHQPVPGYGPGGVTKAALESLVRYLALELVGRGIRVNTVLLGSVASEIVVNLDAPDAALGDPAGTSELMRRTLSTPEAARLIVHLLHEDAGFITGQTIFADGGISIGGMQGMRLHSRLADQVSRTPRTSTTGTSTPVGSTPAPGQPAAVRPAPAPAPAPAPAPAPAPAPAASPQPDRTPKPEPEHEPEPEPEPEPDRWRSRKPETEAEADPGAVAVVGLGLTLPGANNTAEFWDRLREGVLLSSEPSAFELKHFWAPTREETDAFYVREAGYLHDFVPDPASVAEPDGNVGHPGWPRTTRWLRHCAVQALAGVGRAPKDRYLAVTTGIHDQTGLGAQGVVLGDEYRRMVRGAIPADRDGDWLAELADHAISAHYGGDGGNPQGYLPASVSRDALRGLVPDDSQHLTLDSACASGLFAVDAAVKALREGSCDVALAGGTAVVEPIGFTLFCRAQGISMSGRVRPFDRAADGTLIGEGAVMLVLKSYARAVADGDRVLGVIRGTGLAADGRGKGIHAPAPRGQELAIARAWADAGVEADDVDWIVAHGTGTPVGDEIELRSLLSRLGPRRKACLLTSNKQVFGHTGVLAGLVSVAHALVALERRAVPGQPVVTDPHPLLGDGSRLTVPVEDRPWPADGTRPRVVGVSSFGLGGADAHVVLSDRVPPAAPAGRRGGAATADAEDLVVVGWNAHLPGLASDRVPAWLSGDGPRPEAGFGTPYPLPSPRDVRIPPLTMRHMDAAHLMMLQVLGPLLEQLGEPGAGLRPTTAIVVGSTLPTTHNTRAALRVHARECATAFDILPDPKQAQALKTYLAKGMEDAREVIPGDLNEDDFTGAVSCILSGRAANYYDFQALGTSVYSHRDSAHTAVDLALRQLRHRACDLALVGAVCLRPISGWDRHLTGLVPEGRSIAEGAAVLAVTRLSTALEHGLPVLGALSTAVGGSGPEESATPAHSLPALADAGHTYLSLDALLTVVRAVVTGTDALVTPAAAGSPLIRFTPAAEPPRPGPARQAPEQVAAPEQAAPEQARPEHTAADRAAGPEQAAAPEQAAPEQAAAPEQAAPEDRSAPEHDEGFTGRRQTFRLVPTTPPSRNPAAPALPPGTVVITDAPDLAAAVAGPDIALWSPRPGVAGTTHVPPEEAPGALAGLPFVPRHIRVLSRLPDLHAGGHGGDEAEAARVEDLQDLTFTALQAALPALRSGGSLSAVLLGPVPDDLPPPLSALFTGLVRSVRAEVPQCGGVTLLSDAPDAARALDQLARAGTAQVPAHTLACRGGDWFALAVADDPAPPPPAGAASLPPGAVVVAFGGARGITPELLHAVARTSDRPHVYVIGRTPLPESGEPLPPQAEFIAAGRRARPGASVRELRADYEKAQARLEVRRTVHRLTELCGPDRVHHRVCDVLDAERTTAVLGEVLDRHGRIDLLINTVLDLRSRALHAKTLTDFRAVRATKATGYRNLKRALAERPPRIWCNFSTLATLAPAPGDVDYCAVNEYLAYASAWAQRHGPDGRHEFAILWSGWREVGVASSTTMRETLKRNRMDAYISTAQGCAQFLSALARPPAGGVSFFIRDEERVLLARRGISTWGTSGGLPAPVPAPDAPPPAPPDPALTTPLLDGVLHRGKDWAVFTKTWDPRTLVELDGRWMRHHRVNGEYTLPGTFTLEAAAGAAAALCPGLRVTGFRGLVCRTSVTVRLAGPPRTVAVEARVTSRRPGGAEVAVRMTAHRIGKNGKVLRFNDLLCETTVVLADRYPDLAGPPDCSSYEPEPDFAMPVYSPDPPISLTGPFAGTRDYARGPDGCSAGFALDHAAWAPALAGAAVPAILLDAMVHLLLLPPRGDRPPLVGPMAGLDEVDLGGPGNDCRLSAENPVIRLHCDFASGALTAVTGRGRVLARITGVSAHALDHSGDVVRPRGGVPQPPPS"]}},{"location":"[1246057:1246132](+)","type":"CDS_motif","qualifiers":{"aSTool":["nrps_pks_domains"],"database":["abmotifs"],"detection":["hmmscan"],"domain_id":["nrpspksmotif_EES43_RS05460_0001"],"evalue":["3.60E-03"],"label":["PKSI-KR_m1"],"locus_tag":["EES43_RS05460"],"protein_end":["37"],"protein_start":["12"],"score":["10.0"],"tool":["antismash"],"translation":["LVTGAAKSLGADIVRRLAEGGAHVI"]}},{"location":"[1247677:1249129](+)","type":"aSDomain","qualifiers":{"aSDomain":["PKS_KS"],"aSTool":["nrps_pks_domains"],"database":["nrpspksdomains.hmm"],"detection":["hmmscan"],"domain_id":["nrpspksdomains_EES43_RS05460_PKS_KS.1"],"domain_subtypes":["Hybrid-KS"],"evalue":["1.20E-72"],"label":["EES43_RS05460_PKS_KS.1"],"locus_tag":["EES43_RS05460"],"protein_end":["1036"],"protein_start":["552"],"score":["237.1"],"tool":["antismash"],"translation":["LTLDSACASGLFAVDAAVKALREGSCDVALAGGTAVVEPIGFTLFCRAQGISMSGRVRPFDRAADGTLIGEGAVMLVLKSYARAVADGDRVLGVIRGTGLAADGRGKGIHAPAPRGQELAIARAWADAGVEADDVDWIVAHGTGTPVGDEIELRSLLSRLGPRRKACLLTSNKQVFGHTGVLAGLVSVAHALVALERRAVPGQPVVTDPHPLLGDGSRLTVPVEDRPWPADGTRPRVVGVSSFGLGGADAHVVLSDRVPPAAPAGRRGGAATADAEDLVVVGWNAHLPGLASDRVPAWLSGDGPRPEAGFGTPYPLPSPRDVRIPPLTMRHMDAAHLMMLQVLGPLLEQLGEPGAGLRPTTAIVVGSTLPTTHNTRAALRVHARECATAFDILPDPKQAQALKTYLAKGMEDAREVIPGDLNEDDFTGAVSCILSGRAANYYDFQALGTSVYSHRDSAHTAVDLALRQLRHRACDLALVGAVCL"]}},{"location":"[1247677:1251025](+)","type":"aSModule","qualifiers":{"domains":["nrpspksdomains_EES43_RS05460_PKS_KS.1","nrpspksdomains_EES43_RS05460_PKS_KR.1"],"incomplete":null,"locus_tags":["EES43_RS05460"],"tool":["antismash"],"type":["pks"]}},{"location":"[1250359:1251025](+)","type":"aSDomain","qualifiers":{"aSDomain":["PKS_KR"],"aSTool":["nrps_pks_domains"],"database":["nrpspksdomains.hmm"],"detection":["hmmscan"],"domain_id":["nrpspksdomains_EES43_RS05460_PKS_KR.1"],"evalue":["7.80E-24"],"label":["EES43_RS05460_PKS_KR.1"],"locus_tag":["EES43_RS05460"],"protein_end":["1668"],"protein_start":["1446"],"score":["76.5"],"tool":["antismash"],"translation":["VVVAFGGARGITPELLHAVARTSDRPHVYVIGRTPLPESGEPLPPQAEFIAAGRRARPGASVRELRADYEKAQARLEVRRTVHRLTELCGPDRVHHRVCDVLDAERTTAVLGEVLDRHGRIDLLINTVLDLRSRALHAKTLTDFRAVRATKATGYRNLKRALAERPPRIWCNFSTLATLAPAPGDVDYCAVNEYLAYASAWAQRHGPDGRHEFAILWSGWRE"]}},{"location":"[1251388:1251466](+)","type":"CDS_motif","qualifiers":{"aSTool":["nrps_pks_domains"],"database":["abmotifs"],"detection":["hmmscan"],"domain_id":["nrpspksmotif_EES43_RS05460_0002"],"evalue":["7.10E-03"],"label":["PKSI-DH_m2"],"locus_tag":["EES43_RS05460"],"protein_end":["1815"],"protein_start":["1789"],"score":["9.1"],"tool":["antismash"],"translation":["WMRHHRVNGEYTLPGTFTLEAAAGAA"]}},{"location":"[1252239:1253253](+)","type":"gene","qualifiers":{"locus_tag":["EES43_RS05465"],"old_locus_tag":["EES43_05450"]}},{"location":"[1252239:1253253](+)","type":"CDS","qualifiers":{"codon_start":["1"],"gene_functions":["biosynth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Information about PGAP can be found here:\nhttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/\nBacteria and source DNA available from Zotchev Lab, Department of\nPharmacognosy, University of Vienna.\nAnnotated using prokka v1.11 from http://www.vicbioinformatics.com.","structured_comment":{"Genome-Assembly-Data":{"Assembly Method":"Newbler v. 2.8","Genome Representation":"Full","Expected Final Version":"Yes","Genome Coverage":"64.8x","Sequencing Technology":"Illumina MiSeq"},"Genome-Annotation-Data":{"Annotation Provider":"NCBI RefSeq","Annotation Name":"GCF_003846185.1-RS_2024_05_23","Annotation Date":"05/23/2024 03:48:04","Annotation Pipeline":"NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP)","Annotation Method":"Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+","Annotation Software revision":"6.7","Features Annotated":"Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA","Genes (total)":"6,089","CDSs (total)":"6,032","Genes (coding)":"5,843","CDSs (with protein)":"5,843","Genes 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I",29.0,62.0,99.17582417582418,2.15e-10],["ALL53317.1","aminotransferase","BGC0001903.3",1,"other:other",29.0,56.0,58.791208791208796,1.65e-8]]},"17":{"EES43_RS20400":[["BAV56274.1","hypothetical_protein","BGC0001657.4",1,"NRPS:Type I",38.0,210.0,104.02010050251256,1.02e-63]],"EES43_RS20410":[["AIZ66873.1","putative_cyclic_nucleotide-binding_protein","BGC0002666.2",1,"NRPS:Type I+other:other",62.0,542.0,96.57387580299786,9.33e-192],["AEK21531.1","cyclic_nucleotide-binding_protein","BGC0000657.5",1,"terpene:Monoterpene",57.0,529.0,97.21627408993577,9.5e-187],["AEK21534.1","cyclic_nucleotide-binding_protein","BGC0000657.5",1,"terpene:Monoterpene",57.0,526.0,97.4304068522484,2.13e-185],["AAK57521.2","putative_nucleotide-binding_protein","BGC0000262.5",1,"PKS:Type II+saccharide:hybrid/tailoring",94.0,507.0,56.53104925053534,4.28e-181]],"EES43_RS20415":[["AHW57761.1","putative_polyprenyl_synthetase","BGC0000262.5",1,"PKS:Type 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MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/7/6/","description":"Cyclic AMP receptor protein","consensus":"TGTGANNNNNNTCACA","confidence":"weak","strand":1,"score":16.033289190916168,"max_score":19.25568},{"name":"CodY","start":1236019,"species":"Bacillus, Lactococcus & Streptococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/32/149/","description":"Regulator of stationary phase and virulence in Gram-positive bacteria","consensus":"AWTTTTCAGAAAATT","confidence":"weak","strand":-1,"score":15.509117793122938,"max_score":27.78253},{"name":"CodY","start":1260469,"species":"Bacillus, Lactococcus & Streptococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/32/149/","description":"Regulator of stationary phase and virulence in Gram-positive bacteria","consensus":"AWTTTTCAGAAAATT","confidence":"weak","strand":-1,"score":17.10152284616641,"max_score":27.78253},{"name":"ColR","start":1260691,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/111/58/","description":"Phenol-responsive regulator","consensus":"TTNACNNTTTTTTCAC","confidence":"weak","strand":-1,"score":18.583049870089393,"max_score":30.24844},{"name":"CopR","start":1269310,"species":"Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/121/191/","description":"Copper-responsive regulator","consensus":"RTTTACANWTGTAAAC","confidence":"weak","strand":1,"score":19.126376774036345,"max_score":30.9718},{"name":"FuR_variant_2","start":1244257,"species":"Caulobacter crescentus CB15","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/8/138/","description":"Ferric Uptake Regulator","consensus":"ATTGCGAAYGNYTCTCAAN","confidence":"weak","strand":1,"score":20.74294259140387,"max_score":32.74363},{"name":"GnfM","start":1273036,"species":"Geobacter sulfurreducens PCA","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/58/104/","description":"Regulator of nitrogen-fixation genes","consensus":"TGCNNNAAAANNNGGCA","confidence":"weak","strand":-1,"score":19.998807045032077,"max_score":27.5541},{"name":"LuxO","start":1236007,"species":"Vibrio campbellii ATCC BAA-1116","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/208/197/","description":"Repressor of luminescence","consensus":"TTGCATTTTGCAA","confidence":"weak","strand":1,"score":17.04209509346318,"max_score":26.11696},{"name":"MexT","start":1264258,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/76/59/","description":"Global virulence regulator","consensus":"ATCANNNNTGTCGAT","confidence":"weak","strand":-1,"score":16.83779486592588,"max_score":21.84196},{"name":"ToxT","start":1260599,"species":"Vibrio cholerae O395","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/18/16/","description":"Regulator of MSHA biosynthesis","consensus":"TRTTTTTTKA","confidence":"weak","strand":-1,"score":13.401165916586768,"max_score":18.57433}],"9":[{"name":"ArcA","start":1581067,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/47/6/","description":"Repressor of carbon oxidation","consensus":"WTGTTAAWNNNWTGTTAN","confidence":"weak","strand":-1,"score":16.62507778288335,"max_score":21.55091},{"name":"ColR","start":1579209,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/111/58/","description":"Phenol-responsive regulator","consensus":"TTNACNNTTTTTTCAC","confidence":"weak","strand":1,"score":17.27184818179509,"max_score":30.24844},{"name":"ColR","start":1585917,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/111/58/","description":"Phenol-responsive regulator","consensus":"TTNACNNTTTTTTCAC","confidence":"weak","strand":-1,"score":17.670154830835003,"max_score":30.24844},{"name":"MatP","start":1617858,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. 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K-12 substr. 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MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/7/6/","description":"Cyclic AMP receptor protein","consensus":"TGTGANNNNNNTCACA","confidence":"medium","strand":-1,"score":17.13113651431431,"max_score":19.25568},{"name":"CcpA","start":2221170,"species":"Streptococcus & Clostridium sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/25/180/","description":"Catabolite control protein A","consensus":"GAAAANGNTTNC","confidence":"weak","strand":-1,"score":15.869773202912473,"max_score":20.96724},{"name":"CodY","start":2218896,"species":"Bacillus, Lactococcus & Streptococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/32/149/","description":"Regulator of stationary phase and virulence in Gram-positive bacteria","consensus":"AWTTTTCAGAAAATT","confidence":"weak","strand":1,"score":17.050730582293767,"max_score":27.78253},{"name":"HgtR","start":2221162,"species":"Geobacter sulfurreducens PCA","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/60/104/","description":"Hydrogen-dependent regulator","consensus":"AWATTGTATACAGTATACR","confidence":"weak","strand":-1,"score":18.22589109181314,"max_score":36.53961},{"name":"MogR","start":2213860,"species":"Listeria monocytogenes EGD-e","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/233/35/","description":"Repressor of flagellar motility genes","consensus":"ATTTTTWAANAAAA","confidence":"weak","strand":1,"score":14.65365394606271,"max_score":26.06143}],"13":[{"name":"AfsR","start":2626180,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/AfsR","description":"Pleiotropic regulatory for antibiotic production","consensus":"GTAAATGAACGC","confidence":"medium","strand":1,"score":18.46067740327897,"max_score":23.04516},{"name":"CatR","start":2613907,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/CatR","description":"H2O2-responsive repressor","consensus":"TGGANMGNRTCTAA","confidence":"medium","strand":-1,"score":18.51351675005781,"max_score":25.31008},{"name":"ANR","start":2626303,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/143/58/","description":"Anaerobic transcriptional regulator","consensus":"TTGAYCCAGATCAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":18.83618698477848,"max_score":26.32537},{"name":"CRP","start":2619596,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/7/6/","description":"Cyclic AMP receptor protein","consensus":"TGTGANNNNNNTCACA","confidence":"strong","strand":-1,"score":19.255681612252616,"max_score":19.25568}],"14":[{"name":"CatR","start":3765873,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/CatR","description":"H2O2-responsive repressor","consensus":"TGGANMGNRTCTAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":17.614590204674613,"max_score":25.31008},{"name":"LexA_variant_1","start":3788085,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/LexA","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"TCGAANKNNTGTTCGA","confidence":"weak","strand":1,"score":19.92074282444458,"max_score":29.65219},{"name":"NrtR","start":3765533,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/NrtR","description":"NAD synthesis repressor","consensus":"TTNTNGTCRNNNTGACGATTA","confidence":"weak","strand":-1,"score":19.834913801721164,"max_score":35.6303},{"name":"ANR","start":3766087,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/143/58/","description":"Anaerobic transcriptional regulator","consensus":"TTGAYCCAGATCAA","confidence":"weak","strand":1,"score":17.736651311227565,"max_score":26.32537},{"name":"CcpA","start":3769670,"species":"Streptococcus & Clostridium sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/25/180/","description":"Catabolite control protein A","consensus":"GAAAANGNTTNC","confidence":"weak","strand":-1,"score":15.324347144291547,"max_score":20.96724},{"name":"CodY","start":3774645,"species":"Bacillus, Lactococcus & Streptococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/32/149/","description":"Regulator of stationary phase and virulence in Gram-positive bacteria","consensus":"AWTTTTCAGAAAATT","confidence":"weak","strand":-1,"score":14.128146115621268,"max_score":27.78253},{"name":"ColR","start":3769416,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/111/58/","description":"Phenol-responsive regulator","consensus":"TTNACNNTTTTTTCAC","confidence":"weak","strand":1,"score":17.014216356243303,"max_score":30.24844},{"name":"FuR_variant_1","start":3788359,"species":"Bacillus, Pseudomonas, Yersinia sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/8/12/","description":"Ferric Uptake Regulator","consensus":"AATGANAATNATTATC","confidence":"weak","strand":-1,"score":15.29933565994113,"max_score":29.38453},{"name":"RutR","start":3765655,"species":"Escherichia coli str. 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MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/27/6/","description":"Regulator of the pyrimidine and purine metabolism","consensus":"TTGACCRNNTGGTCNR","confidence":"weak","strand":1,"score":19.16610313612279,"max_score":26.85092},{"name":"ToxT","start":3785242,"species":"Vibrio cholerae O395","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/18/16/","description":"Regulator of MSHA biosynthesis","consensus":"TRTTTTTTKA","confidence":"weak","strand":1,"score":14.023843431720378,"max_score":18.57433},{"name":"VqsM","start":3769548,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/234/59/","description":"Regulator of quorum-sensing signalling systems","consensus":"GGANNNYNTCGGCCA","confidence":"medium","strand":-1,"score":18.248651395764245,"max_score":20.46889}],"15":[{"name":"CatR","start":4177531,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/CatR","description":"H2O2-responsive repressor","consensus":"TGGANMGNRTCTAA","confidence":"medium","strand":1,"score":19.387947616420565,"max_score":25.31008},{"name":"DosR","start":4190691,"species":"Mycobacterium tuberculosis H37Rv","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/4/25/","description":"Hypoxia stress response regulator","consensus":"KYGGGGACNANYGRCCCNNN","confidence":"weak","strand":1,"score":22.342788738994074,"max_score":29.50795},{"name":"PerR","start":4190393,"species":"Bacillus & Staphylococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/22/170/","description":"Peroxide regulator","consensus":"TATAATTATTATAA","confidence":"weak","strand":1,"score":18.288846009097025,"max_score":28.13881},{"name":"VqsM","start":4177220,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/234/59/","description":"Regulator of quorum-sensing signalling systems","consensus":"GGANNNYNTCGGCCA","confidence":"strong","strand":-1,"score":19.188778094252832,"max_score":20.46889},{"name":"VqsM","start":4180416,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/234/59/","description":"Regulator of quorum-sensing signalling systems","consensus":"GGANNNYNTCGGCCA","confidence":"medium","strand":-1,"score":17.67557202986566,"max_score":20.46889}],"16":[{"name":"ArgR","start":4453432,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/ArgR","description":"Regulator of arginine biosynthesis genes","consensus":"YGCATRNNCATGCA","confidence":"weak","strand":-1,"score":16.315178377,"max_score":20.00603},{"name":"ArgR","start":4458590,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/ArgR","description":"Regulator of arginine biosynthesis genes","consensus":"YGCATRNNCATGCA","confidence":"weak","strand":-1,"score":16.671721608,"max_score":20.00603},{"name":"CatR","start":4472103,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/CatR","description":"H2O2-responsive repressor","consensus":"TGGANMGNRTCTAA","confidence":"medium","strand":1,"score":18.513516750057807,"max_score":25.31008},{"name":"HypR","start":4454785,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/HypR","description":"L-hydroxyproline utilization repressor","consensus":"TGCMATGTCAC","confidence":"weak","strand":1,"score":18.594059458850385,"max_score":22.39835},{"name":"ZuR_variant_1","start":4458714,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/ZuR","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TGAANNTCATTTTCA","confidence":"weak","strand":1,"score":17.80320341064188,"max_score":28.18779},{"name":"ArcA","start":4450633,"species":"Escherichia coli str. 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MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/47/6/","description":"Repressor of carbon oxidation","consensus":"WTGTTAAWNNNWTGTTAN","confidence":"weak","strand":-1,"score":14.859034763623649,"max_score":21.55091},{"name":"CodY","start":4459428,"species":"Bacillus, Lactococcus & Streptococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/32/149/","description":"Regulator of stationary phase and virulence in Gram-positive bacteria","consensus":"AWTTTTCAGAAAATT","confidence":"weak","strand":1,"score":14.302823364453365,"max_score":27.78253},{"name":"FuR_variant_1","start":4450214,"species":"Bacillus, Pseudomonas, Yersinia sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/8/12/","description":"Ferric Uptake Regulator","consensus":"AATGANAATNATTATC","confidence":"weak","strand":1,"score":15.43842721671697,"max_score":29.38453},{"name":"FuR_variant_1","start":4452974,"species":"Bacillus, Pseudomonas, Yersinia sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/8/12/","description":"Ferric Uptake Regulator","consensus":"AATGANAATNATTATC","confidence":"weak","strand":1,"score":16.189609994862366,"max_score":29.38453},{"name":"FuR_variant_1","start":4452977,"species":"Bacillus, Pseudomonas, Yersinia sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/8/12/","description":"Ferric Uptake Regulator","consensus":"AATGANAATNATTATC","confidence":"weak","strand":-1,"score":15.779629667057016,"max_score":29.38453},{"name":"LuxO","start":4458599,"species":"Vibrio campbellii ATCC BAA-1116","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/208/197/","description":"Repressor of luminescence","consensus":"TTGCATTTTGCAA","confidence":"weak","strand":1,"score":16.34216860649415,"max_score":26.11696},{"name":"MogR","start":4449621,"species":"Listeria monocytogenes 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ES114","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/187/19/","description":"Regulator of biofilm formation and host colonization","consensus":"TTCTCAATTTGARAA","confidence":"weak","strand":1,"score":15.67693876592686,"max_score":29.24588}],"17":[{"name":"AbrC3","start":4586450,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/AbrC3","description":"Antibiotic production activator","consensus":"GAASGCGRCS","confidence":"strong","strand":1,"score":18.06747299585037,"max_score":18.15656},{"name":"HypR","start":4597991,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/HypR","description":"L-hydroxyproline utilization repressor","consensus":"TGCMATGTCAC","confidence":"weak","strand":-1,"score":18.594059458850385,"max_score":22.39835},{"name":"OsdR","start":4592201,"species":"Streptomyces 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K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/31/6/","description":"Cell cycle regulator","consensus":"GTGACRYTGTCAC","confidence":"weak","strand":-1,"score":19.45958113598765,"max_score":25.75231},{"name":"MntR","start":5335497,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. 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MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/47/6/","description":"Repressor of carbon oxidation","consensus":"WTGTTAAWNNNWTGTTAN","confidence":"weak","strand":1,"score":13.953217076933399,"max_score":21.55091},{"name":"CcpA","start":5416757,"species":"Streptococcus & Clostridium sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/25/180/","description":"Catabolite control protein A","consensus":"GAAAANGNTTNC","confidence":"weak","strand":1,"score":15.177267036395119,"max_score":20.96724},{"name":"ClgR","start":5385126,"species":"Corynebacterium glutamicum ATCC 13032","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/102/77/","description":"Caseinolytic protease gene regulator","consensus":"ACGCCGNNAGCGAACA","confidence":"weak","strand":-1,"score":20.96554459090033,"max_score":30.22426},{"name":"ColR","start":5363066,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/111/58/","description":"Phenol-responsive regulator","consensus":"TTNACNNTTTTTTCAC","confidence":"weak","strand":1,"score":17.52571669502344,"max_score":30.24844},{"name":"DosR","start":5361400,"species":"Mycobacterium tuberculosis H37Rv","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/4/25/","description":"Hypoxia stress response regulator","consensus":"KYGGGGACNANYGRCCCNNN","confidence":"weak","strand":-1,"score":23.38304589423257,"max_score":29.50795},{"name":"FuR_variant_1","start":5367958,"species":"Bacillus, Pseudomonas, Yersinia sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/8/12/","description":"Ferric Uptake Regulator","consensus":"AATGANAATNATTATC","confidence":"weak","strand":1,"score":15.481750353663651,"max_score":29.38453},{"name":"HexR","start":5384763,"species":"Shewanella oneidensis MR-1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/80/218/","description":"Glucose-responsive regulator","consensus":"TTGTAATTTTATTACAR","confidence":"weak","strand":1,"score":15.149370526563942,"max_score":31.73147},{"name":"IolR","start":5384852,"species":"Caulobacter crescentus CB15","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/66/138/","description":"Regulator of the inositol catabolism","consensus":"GGANNANNYGTTCCN","confidence":"medium","strand":-1,"score":19.392151922944045,"max_score":23.7932},{"name":"MexT","start":5366194,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/76/59/","description":"Global virulence regulator","consensus":"ATCANNNNTGTCGAT","confidence":"weak","strand":1,"score":15.356989596496016,"max_score":21.84196},{"name":"MntR","start":5389627,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/30/6/","description":"Manganese transport regulator","consensus":"AAACATAGCAYAGGCTATATT","confidence":"weak","strand":-1,"score":19.32073391529593,"max_score":39.62117},{"name":"VqsM","start":5366439,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/234/59/","description":"Regulator of quorum-sensing signalling systems","consensus":"GGANNNYNTCGGCCA","confidence":"medium","strand":1,"score":17.801326426645886,"max_score":20.46889}],"22":[{"name":"BldD","start":5518986,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/BldD","description":"Development and antibiotic global regulator","consensus":"GTNACKCTNNGTGA","confidence":"medium","strand":1,"score":20.482061840668166,"max_score":23.43222},{"name":"DasR","start":5554074,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/DasR","description":"N-acetylglucosamine dependent repressor","consensus":"ANWGGTCTAGACCANW","confidence":"medium","strand":-1,"score":23.355336573846227,"max_score":27.0358},{"name":"DmdR1","start":5529580,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/DmdR1","description":"Iron(II)-dependent repressor","consensus":"TTAGGTTAGGCTCACCTWA","confidence":"weak","strand":1,"score":22.819918371865807,"max_score":36.52555},{"name":"LexA_variant_1","start":5535676,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/LexA","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"TCGAANKNNTGTTCGA","confidence":"weak","strand":1,"score":20.04850043121212,"max_score":29.65219},{"name":"NuR","start":5560690,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/NuR","description":"Nickel-responsive 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regulator","consensus":"TTGAYCCAGATCAA","confidence":"weak","strand":1,"score":18.473616905393772,"max_score":26.32537},{"name":"CcpA","start":5553867,"species":"Streptococcus & Clostridium sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/25/180/","description":"Catabolite control protein A","consensus":"GAAAANGNTTNC","confidence":"weak","strand":-1,"score":15.52192962659339,"max_score":20.96724},{"name":"ClgR","start":5534669,"species":"Corynebacterium glutamicum ATCC 13032","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/102/77/","description":"Caseinolytic protease gene regulator","consensus":"ACGCCGNNAGCGAACA","confidence":"weak","strand":-1,"score":23.07294850778458,"max_score":30.22426},{"name":"SypG","start":5554014,"species":"Vibrio fischeri ES114","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/187/19/","description":"Regulator of biofilm formation and host colonization","consensus":"TTCTCAATTTGARAA","confidence":"weak","strand":1,"score":17.322851508103607,"max_score":29.24588}],"23":[{"name":"AfsR","start":5583847,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/AfsR","description":"Pleiotropic regulatory for antibiotic production","consensus":"GTAAATGAACGC","confidence":"strong","strand":-1,"score":21.398984176480994,"max_score":23.04516},{"name":"ZuR_variant_1","start":5587780,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/ZuR","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TGAANNTCATTTTCA","confidence":"weak","strand":1,"score":18.60287292894069,"max_score":28.18779},{"name":"CodY","start":5587808,"species":"Bacillus, Lactococcus & Streptococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/32/149/","description":"Regulator of stationary phase and virulence in Gram-positive bacteria","consensus":"AWTTTTCAGAAAATT","confidence":"weak","strand":-1,"score":16.84550432479757,"max_score":27.78253},{"name":"CodY","start":5587818,"species":"Bacillus, Lactococcus & Streptococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/32/149/","description":"Regulator of stationary phase and virulence in Gram-positive bacteria","consensus":"AWTTTTCAGAAAATT","confidence":"weak","strand":-1,"score":14.383931275543112,"max_score":27.78253},{"name":"FuR_variant_1","start":5587778,"species":"Bacillus, Pseudomonas, Yersinia sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/8/12/","description":"Ferric Uptake Regulator","consensus":"AATGANAATNATTATC","confidence":"weak","strand":1,"score":16.313425258193618,"max_score":29.38453},{"name":"FuR_variant_1","start":5587781,"species":"Bacillus, Pseudomonas, Yersinia sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/8/12/","description":"Ferric Uptake Regulator","consensus":"AATGANAATNATTATC","confidence":"weak","strand":-1,"score":17.852318952442776,"max_score":29.38453},{"name":"MatP","start":5582577,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/31/6/","description":"Cell cycle regulator","consensus":"GTGACRYTGTCAC","confidence":"weak","strand":1,"score":19.45958113598765,"max_score":25.75231},{"name":"PerR","start":5587781,"species":"Bacillus & Staphylococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/22/170/","description":"Peroxide regulator","consensus":"TATAATTATTATAA","confidence":"weak","strand":1,"score":12.59247604566091,"max_score":28.13881}],"24":[{"name":"HypR","start":6163449,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/HypR","description":"L-hydroxyproline utilization repressor","consensus":"TGCMATGTCAC","confidence":"weak","strand":-1,"score":17.16133907652054,"max_score":22.39835},{"name":"NuR","start":6154715,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/NuR","description":"Nickel-responsive regulator","consensus":"TTGCANANNACTYGCAA","confidence":"weak","strand":1,"score":22.50534767408519,"max_score":30.97839},{"name":"ZuR_variant_1","start":6141423,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/ZuR","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TGAANNTCATTTTCA","confidence":"weak","strand":1,"score":18.724436281894825,"max_score":28.18779},{"name":"IolR","start":6162188,"species":"Caulobacter crescentus CB15","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/66/138/","description":"Regulator of the inositol catabolism","consensus":"GGANNANNYGTTCCN","confidence":"medium","strand":-1,"score":19.090748070824073,"max_score":23.7932},{"name":"MexT","start":6142539,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/76/59/","description":"Global virulence regulator","consensus":"ATCANNNNTGTCGAT","confidence":"strong","strand":-1,"score":20.763953795239175,"max_score":21.84196},{"name":"MexT","start":6162027,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/76/59/","description":"Global virulence regulator","consensus":"ATCANNNNTGTCGAT","confidence":"weak","strand":1,"score":16.80670109682431,"max_score":21.84196},{"name":"MogR","start":6163384,"species":"Listeria monocytogenes EGD-e","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/233/35/","description":"Repressor of flagellar motility genes","consensus":"ATTTTTWAANAAAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":14.122617886756633,"max_score":26.06143},{"name":"RpoN","start":6160021,"species":"Salmonella & Vibrio sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/9/27/","description":"Regulator of nitrogen assimilation and virulence","consensus":"GGCAYNNWNNTTGC","confidence":"medium","strand":1,"score":16.155296350770932,"max_score":18.4649},{"name":"RutR","start":6163396,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/27/6/","description":"Regulator of the pyrimidine and purine metabolism","consensus":"TTGACCRNNTGGTCNR","confidence":"weak","strand":1,"score":20.375095119013444,"max_score":26.85092},{"name":"VqsM","start":6160088,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/234/59/","description":"Regulator of quorum-sensing signalling systems","consensus":"GGANNNYNTCGGCCA","confidence":"strong","strand":-1,"score":19.346895489066956,"max_score":20.46889}],"25":[{"name":"FuR_variant_1","start":6275607,"species":"Bacillus, Pseudomonas, Yersinia sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/8/12/","description":"Ferric Uptake Regulator","consensus":"AATGANAATNATTATC","confidence":"weak","strand":1,"score":17.53778752796525,"max_score":29.38453},{"name":"MogR","start":6266794,"species":"Listeria monocytogenes EGD-e","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/233/35/","description":"Repressor of flagellar motility genes","consensus":"ATTTTTWAANAAAA","confidence":"weak","strand":1,"score":12.754536670612168,"max_score":26.06143}],"26":[{"name":"AbrC3","start":6363326,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/AbrC3","description":"Antibiotic production activator","consensus":"GAASGCGRCS","confidence":"strong","strand":-1,"score":18.15655576909236,"max_score":18.15656},{"name":"HypR","start":6360514,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/HypR","description":"L-hydroxyproline utilization repressor","consensus":"TGCMATGTCAC","confidence":"weak","strand":1,"score":18.594059458850385,"max_score":22.39835},{"name":"NrtR","start":6360358,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/NrtR","description":"NAD synthesis repressor","consensus":"TTNTNGTCRNNNTGACGATTA","confidence":"weak","strand":1,"score":19.278357070348413,"max_score":35.6303},{"name":"ArcA","start":6362161,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/47/6/","description":"Repressor of carbon oxidation","consensus":"WTGTTAAWNNNWTGTTAN","confidence":"weak","strand":-1,"score":15.688985507225137,"max_score":21.55091},{"name":"ColR","start":6377657,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/111/58/","description":"Phenol-responsive regulator","consensus":"TTNACNNTTTTTTCAC","confidence":"weak","strand":-1,"score":22.73057548657514,"max_score":30.24844},{"name":"FuR_variant_2","start":6362222,"species":"Caulobacter crescentus CB15","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/8/138/","description":"Ferric Uptake Regulator","consensus":"ATTGCGAAYGNYTCTCAAN","confidence":"weak","strand":-1,"score":20.7230564164735,"max_score":32.74363},{"name":"HexR","start":6377615,"species":"Shewanella oneidensis MR-1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/80/218/","description":"Glucose-responsive regulator","consensus":"TTGTAATTTTATTACAR","confidence":"weak","strand":-1,"score":19.337212083691785,"max_score":31.73147},{"name":"HgtR","start":6355869,"species":"Geobacter sulfurreducens PCA","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/60/104/","description":"Hydrogen-dependent regulator","consensus":"AWATTGTATACAGTATACR","confidence":"weak","strand":-1,"score":17.73682602742739,"max_score":36.53961},{"name":"MexT","start":6362232,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/76/59/","description":"Global virulence regulator","consensus":"ATCANNNNTGTCGAT","confidence":"weak","strand":1,"score":16.83779486592588,"max_score":21.84196},{"name":"MogR","start":6377610,"species":"Listeria monocytogenes EGD-e","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/233/35/","description":"Repressor of flagellar motility genes","consensus":"ATTTTTWAANAAAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":14.232313611150774,"max_score":26.06143},{"name":"MogR","start":6377612,"species":"Listeria monocytogenes EGD-e","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/233/35/","description":"Repressor of flagellar motility genes","consensus":"ATTTTTWAANAAAA","confidence":"weak","strand":1,"score":15.979100603299274,"max_score":26.06143},{"name":"MogR","start":6377613,"species":"Listeria monocytogenes EGD-e","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/233/35/","description":"Repressor of flagellar motility genes","consensus":"ATTTTTWAANAAAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":13.717940523911105,"max_score":26.06143},{"name":"PerR","start":6377617,"species":"Bacillus & Staphylococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/22/170/","description":"Peroxide regulator","consensus":"TATAATTATTATAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":15.54764342204435,"max_score":28.13881},{"name":"PerR","start":6377618,"species":"Bacillus & Staphylococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/22/170/","description":"Peroxide regulator","consensus":"TATAATTATTATAA","confidence":"weak","strand":1,"score":15.134595654334426,"max_score":28.13881},{"name":"ToxT","start":6377619,"species":"Vibrio cholerae O395","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/18/16/","description":"Regulator of MSHA biosynthesis","consensus":"TRTTTTTTKA","confidence":"weak","strand":-1,"score":13.909533415586957,"max_score":18.57433},{"name":"VqsM","start":6375372,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/234/59/","description":"Regulator of quorum-sensing signalling systems","consensus":"GGANNNYNTCGGCCA","confidence":"medium","strand":-1,"score":18.18319706198953,"max_score":20.46889}],"27":[{"name":"VqsM","start":6491046,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/234/59/","description":"Regulator of quorum-sensing signalling systems","consensus":"GGANNNYNTCGGCCA","confidence":"medium","strand":1,"score":18.365060887879554,"max_score":20.46889}],"28":[{"name":"ZuR_variant_1","start":6543714,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/ZuR","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TGAANNTCATTTTCA","confidence":"weak","strand":-1,"score":17.19064585641472,"max_score":28.18779},{"name":"ANR","start":6553583,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/143/58/","description":"Anaerobic transcriptional regulator","consensus":"TTGAYCCAGATCAA","confidence":"weak","strand":1,"score":19.862659196139667,"max_score":26.32537},{"name":"ArcA","start":6553557,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/47/6/","description":"Repressor of carbon oxidation","consensus":"WTGTTAAWNNNWTGTTAN","confidence":"weak","strand":1,"score":14.397269512155543,"max_score":21.55091},{"name":"CRP","start":6553624,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/7/6/","description":"Cyclic AMP receptor protein","consensus":"TGTGANNNNNNTCACA","confidence":"medium","strand":-1,"score":17.39851639042407,"max_score":19.25568},{"name":"CopR","start":6552162,"species":"Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/121/191/","description":"Copper-responsive regulator","consensus":"RTTTACANWTGTAAAC","confidence":"weak","strand":1,"score":17.84626885484361,"max_score":30.9718},{"name":"IolR","start":6552446,"species":"Caulobacter crescentus CB15","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/66/138/","description":"Regulator of the inositol catabolism","consensus":"GGANNANNYGTTCCN","confidence":"medium","strand":-1,"score":18.19518919903734,"max_score":23.7932},{"name":"MatP","start":6538107,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/31/6/","description":"Cell cycle regulator","consensus":"GTGACRYTGTCAC","confidence":"weak","strand":-1,"score":20.326825927135882,"max_score":25.75231}],"29":[{"name":"AbrC3","start":6630231,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/AbrC3","description":"Antibiotic production activator","consensus":"GAASGCGRCS","confidence":"strong","strand":1,"score":18.15655576909236,"max_score":18.15656},{"name":"CodY","start":6589759,"species":"Bacillus, Lactococcus & Streptococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/32/149/","description":"Regulator of stationary phase and virulence in Gram-positive bacteria","consensus":"AWTTTTCAGAAAATT","confidence":"weak","strand":1,"score":15.62525036462503,"max_score":27.78253},{"name":"FuR_variant_1","start":6617880,"species":"Bacillus, Pseudomonas, Yersinia sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/8/12/","description":"Ferric Uptake Regulator","consensus":"AATGANAATNATTATC","confidence":"weak","strand":1,"score":17.721249059299673,"max_score":29.38453},{"name":"MexT","start":6621467,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/76/59/","description":"Global virulence regulator","consensus":"ATCANNNNTGTCGAT","confidence":"weak","strand":-1,"score":16.83779486592588,"max_score":21.84196},{"name":"MogR","start":6589760,"species":"Listeria monocytogenes EGD-e","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/233/35/","description":"Repressor of flagellar motility genes","consensus":"ATTTTTWAANAAAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":12.995613228708212,"max_score":26.06143},{"name":"PerR","start":6617879,"species":"Bacillus & Staphylococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/22/170/","description":"Peroxide regulator","consensus":"TATAATTATTATAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":13.165450052799791,"max_score":28.13881}],"30":[{"name":"LexA_variant_2","start":6654183,"species":"Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/1/12/","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"MGAACAWANGTTCN","confidence":"weak","strand":1,"score":18.508942403852423,"max_score":24.7784},{"name":"ZuR_variant_1","start":6662521,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/ZuR","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TGAANNTCATTTTCA","confidence":"weak","strand":1,"score":16.491746931766254,"max_score":28.18779},{"name":"ClgR","start":6672108,"species":"Corynebacterium glutamicum ATCC 13032","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/102/77/","description":"Caseinolytic protease gene regulator","consensus":"ACGCCGNNAGCGAACA","confidence":"weak","strand":-1,"score":21.15706912894881,"max_score":30.22426},{"name":"ColR","start":6663919,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/111/58/","description":"Phenol-responsive regulator","consensus":"TTNACNNTTTTTTCAC","confidence":"weak","strand":1,"score":17.304350007850992,"max_score":30.24844},{"name":"CopR","start":6650210,"species":"Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/121/191/","description":"Copper-responsive regulator","consensus":"RTTTACANWTGTAAAC","confidence":"weak","strand":1,"score":17.134071165826345,"max_score":30.9718},{"name":"FuR_variant_1","start":6667920,"species":"Bacillus, Pseudomonas, Yersinia sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/8/12/","description":"Ferric Uptake Regulator","consensus":"AATGANAATNATTATC","confidence":"weak","strand":-1,"score":19.791466581165608,"max_score":29.38453},{"name":"IolR","start":6671718,"species":"Caulobacter crescentus CB15","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/66/138/","description":"Regulator of the inositol catabolism","consensus":"GGANNANNYGTTCCN","confidence":"medium","strand":-1,"score":19.61414981701609,"max_score":23.7932},{"name":"MexT","start":6658901,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/76/59/","description":"Global virulence regulator","consensus":"ATCANNNNTGTCGAT","confidence":"weak","strand":1,"score":17.505219526839007,"max_score":21.84196},{"name":"ToxT","start":6650207,"species":"Vibrio cholerae O395","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/18/16/","description":"Regulator of MSHA biosynthesis","consensus":"TRTTTTTTKA","confidence":"weak","strand":1,"score":14.023843431720378,"max_score":18.57433}],"31":[{"name":"AbrC3","start":6835228,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/AbrC3","description":"Antibiotic production activator","consensus":"GAASGCGRCS","confidence":"strong","strand":-1,"score":18.15655576909236,"max_score":18.15656},{"name":"ArgR","start":6785126,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/ArgR","description":"Regulator of arginine biosynthesis genes","consensus":"YGCATRNNCATGCA","confidence":"medium","strand":1,"score":18.245180097,"max_score":20.00603},{"name":"BldD","start":6775143,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/BldD","description":"Development and antibiotic global 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repressor","consensus":"TGGANMGNRTCTAA","confidence":"weak","strand":1,"score":17.98654548139751,"max_score":25.31008},{"name":"DmdR1","start":6797119,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/DmdR1","description":"Iron(II)-dependent repressor","consensus":"TTAGGTTAGGCTCACCTWA","confidence":"weak","strand":-1,"score":21.253062343452566,"max_score":36.52555},{"name":"DmdR1","start":6797224,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/DmdR1","description":"Iron(II)-dependent repressor","consensus":"TTAGGTTAGGCTCACCTWA","confidence":"strong","strand":1,"score":34.355702034316856,"max_score":36.52555},{"name":"DmdR1","start":6801092,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/DmdR1","description":"Iron(II)-dependent 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