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dependence on cobalamin itself, in one of its several forms, or in some unusual lineages, dependence on a cobalamin-like analog.; Presence of a B(12) (cobalamin)-binding domain implies dependence on cobalamin itself, in one of its several forms, or in some unusual lineages, dependence on a cobalamin-like analog.; Presence of a B(12) (cobalamin)-binding domain implies dependence on cobalamin itself, in one of its several forms, or in some unusual lineages, dependence on a cobalamin-like analog; Derived by automated computational analysis using gene prediction method: Protein Homology."],"old_locus_tag":["D9753_25070"],"product":["cobalamin-dependent 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rule-based-clusters)"],"transl_table":["11"],"translation":["MTAPTELAERFGTPSYVYDLDRVAAARDDLFAALPDEVEVFYAAKANPHPELLRELRTGGTRGCRAEISSVGELDAVLRAGFPGDRILYTGPGKTTGELTEALTRGVRLFSTESYGDLRRVGDTALGLGLTADCLLRVNNATGAAATSIRMTGVPSQFGFDSETLPGLAARLRDVPGTRIAGLHFFPLSCAKDEASLIAEFRHTIATAATLQQALGVPFRFLDIGGGFAAPYAVQGERPVYGELRDALAATLDEHFPGWRAGAPHIACESGRYLVADSGTLLTSVVNVKDSRDHRYLVLDAGINTFGGMSGLGRILPVSVEPHESVGADGTPASLAGPLCTPGDLLGRNVPLPPLAPGDLLTVPNAGAYGPTASLLMFLGRPAPAEIVVRGDDLVSVSRIEHTRTYDHGQAL"]}},{"location":"[7114182:7114635](+)","type":"gene","qualifiers":{"locus_tag":["D9753_RS32065"],"old_locus_tag":["D9753_32055"]}},{"location":"[7114182:7114635](+)","type":"CDS","qualifiers":{"codon_start":["1"],"inference":["COORDINATES: similar to AA sequence:RefSeq:WP_014670525.1"],"locus_tag":["D9753_RS32065"],"note":["Presence of a B(12) (cobalamin)-binding domain implies dependence on cobalamin itself, in one of its several forms, or in some unusual lineages, dependence on a cobalamin-like analog.; Presence of a B(12) (cobalamin)-binding domain implies dependence on cobalamin itself, in one of its several forms, or in some unusual lineages, dependence on a cobalamin-like analog.; Presence of a B(12) (cobalamin)-binding domain implies dependence on cobalamin itself, in one of its several forms, or in some unusual lineages, dependence on a cobalamin-like analog.; Presence of a B(12) (cobalamin)-binding domain implies dependence on cobalamin itself, in one of its several forms, or in some unusual lineages, dependence on a cobalamin-like analog; Derived by automated computational analysis using gene prediction method: Protein Homology."],"old_locus_tag":["D9753_32055"],"product":["cobalamin B12-binding domain-containing 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rule-based-clusters)"],"transl_table":["11"],"translation":["MDRGDGRTTSFSQQRLWFLDQLRPGTADHLLPLALRLRGDLDAEALAGALADVVDRHEVLRTRYSAADGEPRAYVVPRVEVPLDTVEAPAAGEAGIAAVLGRAVHGPVDLSTAPPLRATLARLGPDDHLLAVVVHHIAFDFSSWNIFTRDLAAAYRARTAGVSQGLPELPLQYADLAARQRERSAGPRLARSLDHWRTRLAGLPPLDLPTDRPRPAEFDGTAAVTRCTLPADLVAQADRLARSHRATRFMVLLAAFQAQLGRYSGQSDFAVGTPVAGRGHAAARDLIGPFVNTVVLRADLSGRPSFGELVDRVRDASLADLTHADTPFERVVGELAPPRDLSRNPLFQVSFLTLDSQAEPPDLPGLAVELVPTPVAGTPFDLALDLLGRPDGSLGLRLQYATALFAPATAARLTEDYVRLLRGMLAAPDEPLVGVTAELELLPDGERRRRLALGLGSARAVPPRTVTDLFEQQVRRTPDATAVRSGDGELSYAGLDERADGLAHRLRALGVGRGTRVGVLLERGTGLLVALLAVLKADAAYVPLDPLHPARRLGHLIEDTRAAVVVTTGALAERVAGTEARTLLLDGALPPAGPAHRLDRTTGPDDLAYVFHTSGSTGTPKGVQIPHRALTNFLHAMTARLELGPQATVLGVTTASFDPSMLELCLPLLTGARLVLADSEQARDPERLIRLIGEARPDLIQATPSMLRMLVDTGWTPDPGLTVLSGGEKLHTDLAAALAAGGAPVLDLYGPTEATIWTSVARHGADGQVRRWSALENTTVRVLDDRLEPVAEGGTGQVCIGGEGLAWGYRGRPAQTAGVFLPDPHATAPGGRLYATGDLGRLRPDGSLEILGRSDHQVKIRGHRIEPGEIEAALLALDGIRAAVVHPTPDAGGGQQLTAYLVAEDAGNPPTPDALRAELLDSLPHHLVPAAFVLLDAIPTAVSGKVDRHALPVPAPQAAGPATAPRTARERSVAEVWEEVLGATGIGAHDDFFLLGGHSLLATRVSVRLRAALGVDVPVRALFDHPTVAALAAALDGYPRSAADGPLPRLTARPRGDRTTAGR"]}},{"location":"[7677338:7677539](-)","type":"aSDomain","qualifiers":{"aSDomain":["PCP"],"aSTool":["nrps_pks_domains"],"database":["nrpspksdomains.hmm"],"detection":["hmmscan"],"domain_id":["nrpspksdomains_D9753_RS34545_PCP.1"],"evalue":["2.40E-27"],"label":["D9753_RS34545_PCP.1"],"locus_tag":["D9753_RS34545"],"protein_end":["1036"],"protein_start":["969"],"score":["86.9"],"tool":["antismash"],"translation":["ERSVAEVWEEVLGATGIGAHDDFFLLGGHSLLATRVSVRLRAALGVDVPVRALFDHPTVAALAAALD"]}},{"location":"[7677338:7680422](-)","type":"aSModule","qualifiers":{"complete":null,"domains":["nrpspksdomains_D9753_RS34545_Condensation_LCL.1","nrpspksdomains_D9753_RS34545_AMP-binding.1","nrpspksdomains_D9753_RS34545_PCP.1"],"locus_tags":["D9753_RS34545"],"tool":["antismash"],"type":["nrps"]}},{"location":"[7677833:7677896](-)","type":"CDS_motif","qualifiers":{"aSTool":["nrps_pks_domains"],"database":["abmotifs"],"detection":["hmmscan"],"domain_id":["nrpspksmotif_D9753_RS34545_0010"],"evalue":["3.50E-12"],"label":["NRPS-A_a8"],"locus_tag":["D9753_RS34545"],"protein_end":["871"],"protein_start":["850"],"score":["38.2"],"tool":["antismash"],"translation":["LGRSDHQVKIRGHRIEPGEIE"]}},{"location":"[7677863:7679039](-)","type":"aSDomain","qualifiers":{"aSDomain":["AMP-binding"],"aSTool":["nrps_pks_domains"],"database":["nrpspksdomains.hmm"],"detection":["hmmscan"],"domain_id":["nrpspksdomains_D9753_RS34545_AMP-binding.1"],"evalue":["8.40E-99"],"label":["D9753_RS34545_AMP-binding.1"],"locus_tag":["D9753_RS34545"],"protein_end":["861"],"protein_start":["469"],"score":["322.8"],"tool":["antismash"],"translation":["FEQQVRRTPDATAVRSGDGELSYAGLDERADGLAHRLRALGVGRGTRVGVLLERGTGLLVALLAVLKADAAYVPLDPLHPARRLGHLIEDTRAAVVVTTGALAERVAGTEARTLLLDGALPPAGPAHRLDRTTGPDDLAYVFHTSGSTGTPKGVQIPHRALTNFLHAMTARLELGPQATVLGVTTASFDPSMLELCLPLLTGARLVLADSEQARDPERLIRLIGEARPDLIQATPSMLRMLVDTGWTPDPGLTVLSGGEKLHTDLAAALAAGGAPVLDLYGPTEATIWTSVARHGADGQVRRWSALENTTVRVLDDRLEPVAEGGTGQVCIGGEGLAWGYRGRPAQTAGVFLPDPHATAPGGRLYATGDLGRLRPDGSLEILGRSDHQVKIR"]}},{"location":"[7677986:7678070](-)","type":"CDS_motif","qualifiers":{"aSTool":["nrps_pks_domains"],"database":["abmotifs"],"detection":["hmmscan"],"domain_id":["nrpspksmotif_D9753_RS34545_0009"],"evalue":["8.80E-09"],"label":["NRPS-A_a6"],"locus_tag":["D9753_RS34545"],"protein_end":["820"],"protein_start":["792"],"score":["27.7"],"tool":["antismash"],"translation":["GGTGQVCIGGEGLAWGYRGRPAQTAGVF"]}},{"location":"[7678211:7678241](-)","type":"CDS_motif","qualifiers":{"aSTool":["nrps_pks_domains"],"database":["abmotifs"],"detection":["hmmscan"],"domain_id":["nrpspksmotif_D9753_RS34545_0008"],"evalue":["3.30E+01"],"label":["NRPS-A_a2"],"locus_tag":["D9753_RS34545"],"protein_end":["745"],"protein_start":["735"],"score":["-0.9"],"tool":["antismash"],"translation":["AALAAGGAPV"]}},{"location":"[7678565:7678625](-)","type":"CDS_motif","qualifiers":{"aSTool":["nrps_pks_domains"],"database":["abmotifs"],"detection":["hmmscan"],"domain_id":["nrpspksmotif_D9753_RS34545_0007"],"evalue":["1.80E-08"],"label":["NRPS-A_a3"],"locus_tag":["D9753_RS34545"],"protein_end":["627"],"protein_start":["607"],"score":["26.6"],"tool":["antismash"],"translation":["AYVFHTSGSTGTPKGVQIPH"]}},{"location":"[7678811:7678853](-)","type":"CDS_motif","qualifiers":{"aSTool":["nrps_pks_domains"],"database":["abmotifs"],"detection":["hmmscan"],"domain_id":["nrpspksmotif_D9753_RS34545_0006"],"evalue":["4.80E-05"],"label":["NRPS-A_a2"],"locus_tag":["D9753_RS34545"],"protein_end":["545"],"protein_start":["531"],"score":["16.6"],"tool":["antismash"],"translation":["LAVLKADAAYVPLD"]}},{"location":"[7679393:7679507](-)","type":"CDS_motif","qualifiers":{"aSTool":["nrps_pks_domains"],"database":["abmotifs"],"detection":["hmmscan"],"domain_id":["nrpspksmotif_D9753_RS34545_0005"],"evalue":["3.80E-16"],"label":["C67_LCL_14fromHMM"],"locus_tag":["D9753_RS34545"],"protein_end":["351"],"prot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I",35.0,56.0,69.28104575163398,2e-9],["ABK32284.1","Jer4","BGC0000080.5",1,"PKS",28.0,53.0,81.69934640522875,1.88e-8],["ABK32252.1","Amb4","BGC0000014.5",1,"PKS",28.0,52.0,81.69934640522875,2.56e-8],["CAB93669.1","RumR_protein","BGC0000545.5",1,"ribosomal:RiPP:Lanthipeptide",29.0,50.0,72.54901960784314,1.47e-7],["ALI93253.1","transcriptional_regulator","BGC0001380.3",1,"saccharide",28.0,47.0,73.8562091503268,2.08e-6],["AGM05521.1","two-component_system_response_regulator","BGC0002098.2",1,"PKS",26.0,45.0,77.77777777777779,5.96e-6]],"D9753_RS11475":[["AGG35706.1","conserved_hypothetical_protein","BGC0000883.5",1,"other:other",78.0,128.0,100.0,2.65e-40]],"D9753_RS11480":[["AGG35705.1","conserved_hypothetical_protein","BGC0000883.5",1,"other:other",84.0,224.0,100.0,1.23e-76]],"D9753_RS11500":[["ACB47089.1","type_I_site-specific_deoxyribonuclease_protein_R","BGC0001060.5",1,"PKS",51.0,1063.0,100.95652173913044,0.0]],"D9753_RS11505":[["CAQ64672.1","Ku70/Ku80_protein","BGC0000087.5",1,"PKS",56.0,276.0,75.69832402234637,1.62e-91],["AEE65512.1","Ku_protein","BGC0000223.5",1,"PKS:Type II",46.0,210.0,74.86033519553072,2.24e-65],["QWT72260.1","Ku_protein","BGC0002430.3",1,"NRPS:Type I+saccharide",36.0,155.0,72.90502793296089,1.75e-44]],"D9753_RS11510":[["AEE65514.1","DNA_polymerase_LigD,_polymerase_domain_protein","BGC0000223.5",1,"PKS:Type II",50.0,267.0,98.64406779661017,7.71e-89]],"D9753_RS11525":[["TXD00268.1","hypothetical_protein","BGC0001877.4",1,"PKS",31.0,81.0,57.08812260536399,1e-18]],"D9753_RS11530":[["TXD00043.1","HAMP_domain-containing_histidine_kinase","BGC0001877.4",1,"PKS",64.0,449.0,98.06763285024155,1.22e-156],["AAS79470.1","sensory_histidine_kinase","BGC0000035.5",1,"PKS",48.0,269.0,94.44444444444444,1.42e-86],["MUL41493.1","sensor_histidine_kinase","BGC0002045.3",1,"PKS:Type II",45.0,265.0,98.06763285024155,9.92e-85],["CAH60131.1","putative_two-component_system_sensor_kinase","BGC0000700.5",1,"saccharide",44.0,258.0,99.03381642512076,8.26e-82],["AXA91286.1","hybrid_sensor_histidine_kinase/response_regulator","BGC0002044.2",1,"NRPS:Type I",32.0,62.0,53.62318840579711,4.52e-10],["QDA77064.1","multi-sensor_hybrid_histidine_kinase","BGC0002026.3",1,"NRPS:Type I+PKS",33.0,60.0,53.3816425120773,2.18e-9]],"D9753_RS11545":[["AAP13507.1","Orf18","BGC0000844.5",1,"other:other",44.0,354.0,102.2680412371134,2.6e-117],["EDY47138.1","penicillin-binding_protein_PBP","BGC0000845.5",1,"other:non-nrp beta-lactam",44.0,354.0,102.2680412371134,2.6e-117],["ABA59537.1","penicillin-binding_protein","BGC0000453.5",1,"NRPS:Type I",43.0,348.0,101.64948453608247,3.29e-115],["ACN69975.1","putative_penicillin_binding_protein","BGC0000079.5",1,"PKS",39.0,254.0,95.05154639175257,1.38e-79],["SKB24653.1","","BGC0002455.3",1,"PKS",27.0,70.0,83.09278350515464,2.07e-12],["AAP13508.1","Orf19","BGC0000844.5",1,"other:other",28.0,65.0,52.57731958762887,9.04e-11],["EDY47139.1","penicillin-binding_protein","BGC0000845.5",1,"other:non-nrp beta-lactam",28.0,65.0,52.57731958762887,9.33e-11]]},"18":{"D9753_RS11820":[["BAC70711.1","putative_AraC-family_transcriptional_regulator","BGC0000678.5",1,"terpene",85.0,213.0,97.74436090225564,3.28e-72],["RLV64596.1","transcriptional_regulator,_AraC_family,_isolated_domain_protein","BGC0001845.2",1,"other:aminocoumarin+PKS+NRPS:Type I",82.0,204.0,93.98496240601504,9.41e-69],["ARD70907.1","transcriptional_regulator","BGC0001693.3",1,"PKS",67.0,168.0,93.98496240601504,1.99e-54],["AHZ61898.1","Lom64","BGC0000240.5",1,"PKS:Type II+saccharide:hybrid/tailoring",64.0,161.0,93.98496240601504,1.16e-51],["ABP54679.1","transcriptional_regulator,_AraC_family","BGC0000241.5",1,"PKS:Type 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I",48.0,251.0,98.95833333333334,5.5e-83],["BAG19276.1","putative_tyrosinase","BGC0000912.3",1,"other:other",46.0,235.0,100.34722222222223,8.65e-77],["BAJ08174.1","o-aminophenol_oxidase","BGC0000885.3",1,"other:other",42.0,219.0,110.76388888888889,3.41e-70],["BAM73631.1","o-aminophenol_oxidase","BGC0000889.5",1,"other:other",42.0,219.0,109.72222222222223,5.12e-70],["BAG21075.1","ortho-aminophenol_oxidase","BGC0000662.5",1,"terpene",41.0,207.0,110.41666666666667,3.21e-65],["AVI10272.1","o-aminophenol_oxidase","BGC0001592.5",1,"other:other",40.0,200.0,111.45833333333333,1.18e-62],["APC57594.1","putative_tyrosinase","BGC0001624.3",1,"other:other",29.0,59.0,61.458333333333336,9.59e-10]],"D9753_RS23140":[["ABX71085.1","putative_small_membrane_protein","BGC0000238.5",1,"PKS",76.0,126.0,96.66666666666667,2.77e-39],["CAI59990.1","putative_small_membrane_protein","BGC0000700.5",1,"saccharide",78.0,114.0,86.66666666666667,3.03e-34]],"D9753_RS23145":[["BAK64657.1","putative_dehydrogenase","BGC0000135.5",1,"PKS",34.0,132.0,87.14733542319749,1.44e-35],["ATP76237.1","NdaH","BGC0001705.4",1,"NRPS:Type 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K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/1/6/","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"TACTGTATAWAWNNMCAGN","confidence":"weak","strand":1,"score":19.102541541497637,"max_score":32.92827},{"name":"CRP","start":333352,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/7/6/","description":"Cyclic AMP receptor protein","consensus":"TGTGANNNNNNTCACA","confidence":"strong","strand":-1,"score":19.255681612252616,"max_score":19.25568},{"name":"CRP","start":356161,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. 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K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/27/6/","description":"Regulator of the pyrimidine and purine metabolism","consensus":"TTGACCRNNTGGTCNR","confidence":"weak","strand":1,"score":20.37995953145542,"max_score":26.85092},{"name":"ToxT","start":344172,"species":"Vibrio cholerae O395","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/18/16/","description":"Regulator of MSHA biosynthesis","consensus":"TRTTTTTTKA","confidence":"weak","strand":1,"score":12.944735624015994,"max_score":18.57433},{"name":"VqsM","start":310789,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/234/59/","description":"Regulator of quorum-sensing signalling systems","consensus":"GGANNNYNTCGGCCA","confidence":"medium","strand":1,"score":18.365060887879554,"max_score":20.46889}],"5":[{"name":"AfsQ1","start":583580,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/AfsQ1","description":"Two-component system AfsQ1-Q2, activator of antibiotic production","consensus":"GTCACNNNNNNGTCAC","confidence":"strong","strand":-1,"score":19.523022480026007,"max_score":19.52302},{"name":"BldD","start":578679,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/BldD","description":"Development and antibiotic global regulator","consensus":"GTNACKCTNNGTGA","confidence":"weak","strand":-1,"score":19.594780689523173,"max_score":23.43222},{"name":"LexA_variant_1","start":526730,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/LexA","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"TCGAANKNNTGTTCGA","confidence":"weak","strand":-1,"score":21.422230583693302,"max_score":29.65219},{"name":"NrdR","start":522656,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/NrdR","description":"Represses ribonucleotide reductase encoding genes","consensus":"NCACAASATGTGGGS","confidence":"medium","strand":-1,"score":22.13752938216216,"max_score":27.17858},{"name":"NuR","start":531218,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/NuR","description":"Nickel-responsive regulator","consensus":"TTGCANANNACTYGCAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":21.225324613316644,"max_score":30.97839},{"name":"ANR","start":529027,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/143/58/","description":"Anaerobic transcriptional regulator","consensus":"TTGAYCCAGATCAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":17.625619998838822,"max_score":26.32537},{"name":"ANR","start":578951,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/143/58/","description":"Anaerobic transcriptional regulator","consensus":"TTGAYCCAGATCAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":19.696009326730216,"max_score":26.32537},{"name":"ArcA","start":522696,"species":"Escherichia coli str. 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MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/47/6/","description":"Repressor of carbon oxidation","consensus":"WTGTTAAWNNNWTGTTAN","confidence":"weak","strand":1,"score":14.491278953729687,"max_score":21.55091},{"name":"CodY","start":522690,"species":"Bacillus, Lactococcus & Streptococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/32/149/","description":"Regulator of stationary phase and virulence in Gram-positive bacteria","consensus":"AWTTTTCAGAAAATT","confidence":"medium","strand":1,"score":20.1809059143059,"max_score":27.78253},{"name":"DosR","start":579524,"species":"Mycobacterium tuberculosis H37Rv","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/4/25/","description":"Hypoxia stress response regulator","consensus":"KYGGGGACNANYGRCCCNNN","confidence":"medium","strand":-1,"score":24.31346994009772,"max_score":29.50795},{"name":"HgtR","start":579160,"species":"Geobacter sulfurreducens PCA","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/60/104/","description":"Hydrogen-dependent regulator","consensus":"AWATTGTATACAGTATACR","confidence":"weak","strand":-1,"score":16.761960380105194,"max_score":36.53961},{"name":"MexT","start":578488,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/76/59/","description":"Global virulence regulator","consensus":"ATCANNNNTGTCGAT","confidence":"weak","strand":1,"score":15.526593177631574,"max_score":21.84196},{"name":"MexT","start":578954,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/76/59/","description":"Global virulence regulator","consensus":"ATCANNNNTGTCGAT","confidence":"weak","strand":1,"score":15.526593177631575,"max_score":21.84196},{"name":"MogR","start":530351,"species":"Listeria monocytogenes EGD-e","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/233/35/","description":"Repressor of flagellar motility genes","consensus":"ATTTTTWAANAAAA","confidence":"weak","strand":1,"score":13.137088043408987,"max_score":26.06143},{"name":"MogR","start":578824,"species":"Listeria monocytogenes EGD-e","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/233/35/","description":"Repressor of flagellar motility genes","consensus":"ATTTTTWAANAAAA","confidence":"weak","strand":1,"score":13.818753534941482,"max_score":26.06143},{"name":"VqsM","start":531281,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/234/59/","description":"Regulator of quorum-sensing signalling systems","consensus":"GGANNNYNTCGGCCA","confidence":"medium","strand":-1,"score":17.879769478639655,"max_score":20.46889}],"6":[{"name":"CatR","start":669721,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/CatR","description":"H2O2-responsive repressor","consensus":"TGGANMGNRTCTAA","confidence":"medium","strand":1,"score":18.86097634776027,"max_score":25.31008},{"name":"LexA_variant_1","start":667690,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/LexA","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"TCGAANKNNTGTTCGA","confidence":"weak","strand":1,"score":19.659568823272735,"max_score":29.65219},{"name":"IolR","start":682628,"species":"Caulobacter crescentus CB15","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/66/138/","description":"Regulator of the inositol catabolism","consensus":"GGANNANNYGTTCCN","confidence":"medium","strand":1,"score":18.193786748600576,"max_score":23.7932}],"7":[{"name":"AfsQ1","start":897300,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/AfsQ1","description":"Two-component system AfsQ1-Q2, activator of antibiotic production","consensus":"GTCACNNNNNNGTCAC","confidence":"strong","strand":1,"score":19.523022480026007,"max_score":19.52302},{"name":"AfsQ1","start":946472,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/AfsQ1","description":"Two-component system AfsQ1-Q2, activator of antibiotic production","consensus":"GTCACNNNNNNGTCAC","confidence":"weak","strand":-1,"score":16.786114111227548,"max_score":19.52302},{"name":"BldD","start":855021,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/BldD","description":"Development and antibiotic global regulator","consensus":"GTNACKCTNNGTGA","confidence":"weak","strand":1,"score":18.515962968870774,"max_score":23.43222},{"name":"ZuR_variant_1","start":855204,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/ZuR","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TGAANNTCATTTTCA","confidence":"weak","strand":1,"score":18.057055621799446,"max_score":28.18779},{"name":"ZuR_variant_1","start":857305,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/ZuR","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TGAANNTCATTTTCA","confidence":"weak","strand":1,"score":18.205871918519446,"max_score":28.18779},{"name":"ZuR_variant_2","start":855029,"species":"Pseudomonas protegens Pf-5","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/46/235/","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TTGTTATAANATAACAT","confidence":"weak","strand":1,"score":15.276495093001579,"max_score":33.14175},{"name":"ZuR_variant_2","start":858719,"species":"Pseudomonas protegens Pf-5","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/46/235/","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TTGTTATAANATAACAT","confidence":"weak","strand":1,"score":15.657265351199511,"max_score":33.14175},{"name":"CodY","start":871596,"species":"Bacillus, Lactococcus & Streptococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/32/149/","description":"Regulator of stationary phase and virulence in Gram-positive bacteria","consensus":"AWTTTTCAGAAAATT","confidence":"weak","strand":1,"score":14.896524932352731,"max_score":27.78253},{"name":"CodY","start":948786,"species":"Bacillus, Lactococcus & Streptococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/32/149/","description":"Regulator of stationary phase and virulence in Gram-positive bacteria","consensus":"AWTTTTCAGAAAATT","confidence":"weak","strand":-1,"score":14.252018528111286,"max_score":27.78253},{"name":"IolR","start":891899,"species":"Caulobacter crescentus CB15","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/66/138/","description":"Regulator of the inositol catabolism","consensus":"GGANNANNYGTTCCN","confidence":"medium","strand":1,"score":19.193012118200826,"max_score":23.7932},{"name":"IolR","start":897531,"species":"Caulobacter crescentus CB15","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/66/138/","description":"Regulator of the inositol catabolism","consensus":"GGANNANNYGTTCCN","confidence":"medium","strand":-1,"score":18.038182243456816,"max_score":23.7932},{"name":"MatP","start":855130,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/31/6/","description":"Cell cycle regulator","consensus":"GTGACRYTGTCAC","confidence":"weak","strand":1,"score":18.875026080326645,"max_score":25.75231},{"name":"MexT","start":897154,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/76/59/","description":"Global virulence regulator","consensus":"ATCANNNNTGTCGAT","confidence":"weak","strand":1,"score":15.526593177631574,"max_score":21.84196},{"name":"RutR","start":856109,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/27/6/","description":"Regulator of the pyrimidine and purine metabolism","consensus":"TTGACCRNNTGGTCNR","confidence":"weak","strand":-1,"score":19.10323001636399,"max_score":26.85092},{"name":"RutR","start":927776,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. 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K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/27/6/","description":"Regulator of the pyrimidine and purine metabolism","consensus":"TTGACCRNNTGGTCNR","confidence":"medium","strand":1,"score":20.98517509846512,"max_score":26.85092},{"name":"RutR","start":1113781,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. 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K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/31/6/","description":"Cell cycle regulator","consensus":"GTGACRYTGTCAC","confidence":"weak","strand":1,"score":19.108645757086347,"max_score":25.75231},{"name":"SypG","start":1166317,"species":"Vibrio fischeri ES114","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/187/19/","description":"Regulator of biofilm formation and host colonization","consensus":"TTCTCAATTTGARAA","confidence":"weak","strand":1,"score":18.626278102738357,"max_score":29.24588},{"name":"ToxT","start":1170220,"species":"Vibrio cholerae O395","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/18/16/","description":"Regulator of MSHA biosynthesis","consensus":"TRTTTTTTKA","confidence":"strong","strand":-1,"score":18.574330493520225,"max_score":18.57433}],"11":[{"name":"LexA_variant_1","start":1560005,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/LexA","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"TCGAANKNNTGTTCGA","confidence":"weak","strand":1,"score":20.243945340345824,"max_score":29.65219},{"name":"LexA_variant_2","start":1535621,"species":"Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/1/12/","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"MGAACAWANGTTCN","confidence":"weak","strand":-1,"score":18.772689427651255,"max_score":24.7784},{"name":"ZuR_variant_1","start":1534456,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/ZuR","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TGAANNTCATTTTCA","confidence":"weak","strand":-1,"score":16.680439982683346,"max_score":28.18779},{"name":"ZuR_variant_1","start":1534661,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/ZuR","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TGAANNTCATTTTCA","confidence":"weak","strand":1,"score":17.61367323828522,"max_score":28.18779},{"name":"ArcA","start":1539014,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/47/6/","description":"Repressor of carbon oxidation","consensus":"WTGTTAAWNNNWTGTTAN","confidence":"weak","strand":-1,"score":15.555730547604304,"max_score":21.55091},{"name":"ClgR","start":1568437,"species":"Corynebacterium glutamicum ATCC 13032","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/102/77/","description":"Caseinolytic protease gene regulator","consensus":"ACGCCGNNAGCGAACA","confidence":"weak","strand":1,"score":22.917670282306673,"max_score":30.22426},{"name":"CodY","start":1543850,"species":"Bacillus, Lactococcus & Streptococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/32/149/","description":"Regulator of stationary phase and virulence in Gram-positive bacteria","consensus":"AWTTTTCAGAAAATT","confidence":"weak","strand":-1,"score":16.867924412860617,"max_score":27.78253},{"name":"ColR","start":1532683,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/111/58/","description":"Phenol-responsive regulator","consensus":"TTNACNNTTTTTTCAC","confidence":"weak","strand":1,"score":19.553762857693457,"max_score":30.24844},{"name":"MexT","start":1563658,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/76/59/","description":"Global virulence regulator","consensus":"ATCANNNNTGTCGAT","confidence":"weak","strand":-1,"score":15.759792353924604,"max_score":21.84196},{"name":"VqsM","start":1553182,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/234/59/","description":"Regulator of quorum-sensing signalling systems","consensus":"GGANNNYNTCGGCCA","confidence":"medium","strand":1,"score":17.801326426645886,"max_score":20.46889}],"12":[{"name":"ANR","start":1723153,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/143/58/","description":"Anaerobic transcriptional regulator","consensus":"TTGAYCCAGATCAA","confidence":"medium","strand":-1,"score":21.280971827451374,"max_score":26.32537},{"name":"ANR","start":1735048,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/143/58/","description":"Anaerobic transcriptional regulator","consensus":"TTGAYCCAGATCAA","confidence":"weak","strand":1,"score":18.473616905393772,"max_score":26.32537},{"name":"ColR","start":1716323,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/111/58/","description":"Phenol-responsive regulator","consensus":"TTNACNNTTTTTTCAC","confidence":"weak","strand":-1,"score":17.216321763434763,"max_score":30.24844},{"name":"ColR","start":1729954,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/111/58/","description":"Phenol-responsive regulator","consensus":"TTNACNNTTTTTTCAC","confidence":"weak","strand":1,"score":20.09494890862083,"max_score":30.24844},{"name":"FuR_variant_2","start":1729510,"species":"Caulobacter crescentus CB15","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/8/138/","description":"Ferric Uptake Regulator","consensus":"ATTGCGAAYGNYTCTCAAN","confidence":"weak","strand":1,"score":20.626836739611353,"max_score":32.74363}],"13":[{"name":"ClgR","start":1749330,"species":"Corynebacterium glutamicum ATCC 13032","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/102/77/","description":"Caseinolytic protease gene regulator","consensus":"ACGCCGNNAGCGAACA","confidence":"weak","strand":1,"score":22.37250878964349,"max_score":30.22426},{"name":"ColR","start":1744608,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/111/58/","description":"Phenol-responsive regulator","consensus":"TTNACNNTTTTTTCAC","confidence":"weak","strand":-1,"score":16.813519006006175,"max_score":30.24844},{"name":"HexR","start":1751153,"species":"Shewanella oneidensis MR-1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/80/218/","description":"Glucose-responsive regulator","consensus":"TTGTAATTTTATTACAR","confidence":"weak","strand":-1,"score":16.409031745227516,"max_score":31.73147}],"14":[{"name":"GnfM","start":1870740,"species":"Geobacter sulfurreducens PCA","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/58/104/","description":"Regulator of nitrogen-fixation genes","consensus":"TGCNNNAAAANNNGGCA","confidence":"weak","strand":-1,"score":19.124337927115935,"max_score":27.5541}],"15":[{"name":"AfsQ1","start":1930753,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/AfsQ1","description":"Two-component system AfsQ1-Q2, activator of antibiotic production","consensus":"GTCACNNNNNNGTCAC","confidence":"strong","strand":1,"score":19.523022480026007,"max_score":19.52302},{"name":"BldD","start":1938827,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/BldD","description":"Development and antibiotic global regulator","consensus":"GTNACKCTNNGTGA","confidence":"weak","strand":-1,"score":19.347205028581484,"max_score":23.43222},{"name":"DasR","start":1904503,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/DasR","description":"N-acetylglucosamine dependent repressor","consensus":"ANWGGTCTAGACCANW","confidence":"weak","strand":-1,"score":20.170750432853477,"max_score":27.0358},{"name":"ZuR_variant_1","start":1917926,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/ZuR","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TGAANNTCATTTTCA","confidence":"weak","strand":1,"score":16.927215341542436,"max_score":28.18779},{"name":"ANR","start":1910282,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/143/58/","description":"Anaerobic transcriptional regulator","consensus":"TTGAYCCAGATCAA","confidence":"weak","strand":1,"score":18.473616905393772,"max_score":26.32537},{"name":"ANR","start":1969083,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/143/58/","description":"Anaerobic transcriptional regulator","consensus":"TTGAYCCAGATCAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":18.184110288198784,"max_score":26.32537},{"name":"ColR","start":1908727,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/111/58/","description":"Phenol-responsive regulator","consensus":"TTNACNNTTTTTTCAC","confidence":"weak","strand":-1,"score":18.819503873218736,"max_score":30.24844},{"name":"ColR","start":1930412,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/111/58/","description":"Phenol-responsive regulator","consensus":"TTNACNNTTTTTTCAC","confidence":"weak","strand":-1,"score":19.662460439045,"max_score":30.24844},{"name":"FuR_variant_1","start":1914733,"species":"Bacillus, Pseudomonas, Yersinia sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/8/12/","description":"Ferric Uptake Regulator","consensus":"AATGANAATNATTATC","confidence":"weak","strand":1,"score":16.5299792302237,"max_score":29.38453},{"name":"FuR_variant_1","start":1916513,"species":"Bacillus, Pseudomonas, Yersinia sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/8/12/","description":"Ferric Uptake Regulator","consensus":"AATGANAATNATTATC","confidence":"weak","strand":1,"score":17.5648352635486,"max_score":29.38453},{"name":"MogR","start":1904529,"species":"Listeria monocytogenes EGD-e","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/233/35/","description":"Repressor of flagellar motility genes","consensus":"ATTTTTWAANAAAA","confidence":"weak","strand":1,"score":14.179750476842559,"max_score":26.06143},{"name":"VqsM","start":1930958,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/234/59/","description":"Regulator of quorum-sensing signalling systems","consensus":"GGANNNYNTCGGCCA","confidence":"medium","strand":-1,"score":18.365060887879554,"max_score":20.46889},{"name":"VqsM","start":1931909,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/234/59/","description":"Regulator of quorum-sensing signalling systems","consensus":"GGANNNYNTCGGCCA","confidence":"medium","strand":-1,"score":18.923316951024496,"max_score":20.46889},{"name":"VqsM","start":1951283,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/234/59/","description":"Regulator of quorum-sensing signalling systems","consensus":"GGANNNYNTCGGCCA","confidence":"medium","strand":-1,"score":18.497536218202313,"max_score":20.46889}],"16":[{"name":"AfsR","start":2038542,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/AfsR","description":"Pleiotropic regulatory for antibiotic production","consensus":"GTAAATGAACGC","confidence":"medium","strand":1,"score":19.28376586714896,"max_score":23.04516},{"name":"AfsR","start":2038604,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/AfsR","description":"Pleiotropic regulatory for antibiotic production","consensus":"GTAAATGAACGC","confidence":"medium","strand":-1,"score":18.762947008991794,"max_score":23.04516},{"name":"LexA_variant_1","start":2047886,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/LexA","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"TCGAANKNNTGTTCGA","confidence":"weak","strand":1,"score":23.09332347729913,"max_score":29.65219},{"name":"LexA_variant_2","start":2047887,"species":"Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/1/12/","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"MGAACAWANGTTCN","confidence":"medium","strand":-1,"score":20.9304061722907,"max_score":24.7784},{"name":"NrdR","start":2047496,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/NrdR","description":"Represses ribonucleotide reductase encoding genes","consensus":"NCACAASATGTGGGS","confidence":"medium","strand":1,"score":22.811146052946736,"max_score":27.17858},{"name":"NrdR","start":2047527,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/NrdR","description":"Represses ribonucleotide reductase encoding genes","consensus":"NCACAASATGTGGGS","confidence":"strong","strand":1,"score":26.063359264703866,"max_score":27.17858},{"name":"HipB","start":2066904,"species":"Escherichia coli BL21(DE3)","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/240/6/","description":"Bacterial antitoxin HipB","consensus":"TATCCCNTAGAGCGGATA","confidence":"weak","strand":1,"score":19.593382538078025,"max_score":33.7334},{"name":"MexT","start":2071991,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/76/59/","description":"Global virulence regulator","consensus":"ATCANNNNTGTCGAT","confidence":"weak","strand":1,"score":17.505219526839007,"max_score":21.84196},{"name":"MntR","start":2064647,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/30/6/","description":"Manganese transport regulator","consensus":"AAACATAGCAYAGGCTATATT","confidence":"weak","strand":-1,"score":19.721271844879656,"max_score":39.62117},{"name":"MogR","start":2067878,"species":"Listeria monocytogenes EGD-e","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/233/35/","description":"Repressor of flagellar motility genes","consensus":"ATTTTTWAANAAAA","confidence":"weak","strand":1,"score":13.246280404721606,"max_score":26.06143},{"name":"PsrA","start":2047887,"species":"Pseudomonas sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/109/59/","description":"Oleic acid responsive regulator","consensus":"CAAACGYNNGTTTG","confidence":"weak","strand":1,"score":19.771607294944598,"max_score":25.87793}],"17":[{"name":"BldD","start":2640988,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/BldD","description":"Development and antibiotic global regulator","consensus":"GTNACKCTNNGTGA","confidence":"weak","strand":1,"score":19.04272056740008,"max_score":23.43222},{"name":"LexA_variant_2","start":2624267,"species":"Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/1/12/","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"MGAACAWANGTTCN","confidence":"weak","strand":1,"score":18.925589155992924,"max_score":24.7784},{"name":"ZuR_variant_1","start":2547620,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/ZuR","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TGAANNTCATTTTCA","confidence":"weak","strand":1,"score":16.624335239469605,"max_score":28.18779},{"name":"ZuR_variant_1","start":2612525,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/ZuR","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TGAANNTCATTTTCA","confidence":"weak","strand":-1,"score":17.524909787229703,"max_score":28.18779},{"name":"ZuR_variant_2","start":2640945,"species":"Pseudomonas protegens Pf-5","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/46/235/","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TTGTTATAANATAACAT","confidence":"weak","strand":-1,"score":19.915577346790897,"max_score":33.14175},{"name":"CRP","start":2640954,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/7/6/","description":"Cyclic AMP receptor protein","consensus":"TGTGANNNNNNTCACA","confidence":"weak","strand":-1,"score":16.144835843564326,"max_score":19.25568},{"name":"CcpA","start":2621566,"species":"Streptococcus & Clostridium sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/25/180/","description":"Catabolite control protein A","consensus":"GAAAANGNTTNC","confidence":"weak","strand":1,"score":15.165329729691445,"max_score":20.96724},{"name":"CodY","start":2606854,"species":"Bacillus, Lactococcus & Streptococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/32/149/","description":"Regulator of stationary phase and virulence in Gram-positive bacteria","consensus":"AWTTTTCAGAAAATT","confidence":"weak","strand":1,"score":16.699539850459285,"max_score":27.78253},{"name":"ColR","start":2599905,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/111/58/","description":"Phenol-responsive regulator","consensus":"TTNACNNTTTTTTCAC","confidence":"weak","strand":1,"score":19.629958612989096,"max_score":30.24844},{"name":"FuR_variant_1","start":2612533,"species":"Bacillus, Pseudomonas, Yersinia sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/8/12/","description":"Ferric Uptake Regulator","consensus":"AATGANAATNATTATC","confidence":"weak","strand":1,"score":15.62951578793385,"max_score":29.38453},{"name":"HexR","start":2640945,"species":"Shewanella oneidensis MR-1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/80/218/","description":"Glucose-responsive regulator","consensus":"TTGTAATTTTATTACAR","confidence":"weak","strand":1,"score":16.17876098549738,"max_score":31.73147},{"name":"HgtR","start":2628046,"species":"Geobacter sulfurreducens PCA","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/60/104/","description":"Hydrogen-dependent regulator","consensus":"AWATTGTATACAGTATACR","confidence":"weak","strand":-1,"score":17.049033934945083,"max_score":36.53961},{"name":"LuxO","start":2621574,"species":"Vibrio campbellii ATCC BAA-1116","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/208/197/","description":"Repressor of luminescence","consensus":"TTGCATTTTGCAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":17.85406764502558,"max_score":26.11696},{"name":"MexT","start":2602499,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/76/59/","description":"Global virulence regulator","consensus":"ATCANNNNTGTCGAT","confidence":"weak","strand":-1,"score":15.559095003687476,"max_score":21.84196},{"name":"MntR","start":2612021,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/30/6/","description":"Manganese transport regulator","consensus":"AAACATAGCAYAGGCTATATT","confidence":"weak","strand":1,"score":19.197877167510402,"max_score":39.62117},{"name":"MogR","start":2606853,"species":"Listeria monocytogenes EGD-e","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/233/35/","description":"Repressor of flagellar motility genes","consensus":"ATTTTTWAANAAAA","confidence":"weak","strand":1,"score":13.009773443745404,"max_score":26.06143},{"name":"MogR","start":2612522,"species":"Listeria monocytogenes EGD-e","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/233/35/","description":"Repressor of flagellar motility genes","consensus":"ATTTTTWAANAAAA","confidence":"weak","strand":1,"score":13.045849943879011,"max_score":26.06143},{"name":"PerR","start":2632396,"species":"Bacillus & Staphylococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/22/170/","description":"Peroxide regulator","consensus":"TATAATTATTATAA","confidence":"weak","strand":1,"score":13.082135116177898,"max_score":28.13881},{"name":"ToxT","start":2646095,"species":"Vibrio cholerae O395","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/18/16/","description":"Regulator of MSHA biosynthesis","consensus":"TRTTTTTTKA","confidence":"weak","strand":-1,"score":13.040716146473333,"max_score":18.57433}],"18":[{"name":"BldD","start":2714380,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/BldD","description":"Development and antibiotic global regulator","consensus":"GTNACKCTNNGTGA","confidence":"weak","strand":-1,"score":19.157025889596536,"max_score":23.43222},{"name":"DmdR1","start":2702221,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/DmdR1","description":"Iron(II)-dependent repressor","consensus":"TTAGGTTAGGCTCACCTWA","confidence":"weak","strand":-1,"score":21.147967139494746,"max_score":36.52555},{"name":"HypR","start":2714255,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/HypR","description":"L-hydroxyproline utilization repressor","consensus":"TGCMATGTCAC","confidence":"weak","strand":-1,"score":18.939183330725605,"max_score":22.39835},{"name":"CRP","start":2717966,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/7/6/","description":"Cyclic AMP receptor protein","consensus":"TGTGANNNNNNTCACA","confidence":"strong","strand":-1,"score":18.38664229013578,"max_score":19.25568},{"name":"CcpA","start":2717969,"species":"Streptococcus & Clostridium sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/25/180/","description":"Catabolite control protein A","consensus":"GAAAANGNTTNC","confidence":"weak","strand":1,"score":15.69220806570592,"max_score":20.96724},{"name":"ColR","start":2700221,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/111/58/","description":"Phenol-responsive regulator","consensus":"TTNACNNTTTTTTCAC","confidence":"weak","strand":1,"score":17.670154830835003,"max_score":30.24844},{"name":"HipB","start":2711456,"species":"Escherichia coli BL21(DE3)","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/240/6/","description":"Bacterial antitoxin HipB","consensus":"TATCCCNTAGAGCGGATA","confidence":"weak","strand":-1,"score":20.937336939295385,"max_score":33.7334},{"name":"MatP","start":2704390,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. 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K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/7/6/","description":"Cyclic AMP receptor protein","consensus":"TGTGANNNNNNTCACA","confidence":"medium","strand":1,"score":17.13113651431431,"max_score":19.25568},{"name":"ClgR","start":3102225,"species":"Corynebacterium glutamicum ATCC 13032","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/102/77/","description":"Caseinolytic protease gene regulator","consensus":"ACGCCGNNAGCGAACA","confidence":"weak","strand":-1,"score":22.140062703643125,"max_score":30.22426},{"name":"ColR","start":3095450,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/111/58/","description":"Phenol-responsive regulator","consensus":"TTNACNNTTTTTTCAC","confidence":"weak","strand":-1,"score":17.884531440074696,"max_score":30.24844},{"name":"ColR","start":3127622,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/111/58/","description":"Phenol-responsive regulator","consensus":"TTNACNNTTTTTTCAC","confidence":"weak","strand":1,"score":18.584457927043726,"max_score":30.24844},{"name":"DosR","start":3086090,"species":"Mycobacterium tuberculosis H37Rv","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/4/25/","description":"Hypoxia stress response regulator","consensus":"KYGGGGACNANYGRCCCNNN","confidence":"medium","strand":1,"score":24.490058671821043,"max_score":29.50795},{"name":"HexR","start":3138728,"species":"Shewanella oneidensis MR-1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/80/218/","description":"Glucose-responsive regulator","consensus":"TTGTAATTTTATTACAR","confidence":"weak","strand":-1,"score":16.93107283709988,"max_score":31.73147},{"name":"HipB","start":3138739,"species":"Escherichia coli BL21(DE3)","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/240/6/","description":"Bacterial antitoxin HipB","consensus":"TATCCCNTAGAGCGGATA","confidence":"weak","strand":-1,"score":18.7702603001621,"max_score":33.7334},{"name":"MogR","start":3138725,"species":"Listeria monocytogenes EGD-e","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/233/35/","description":"Repressor of flagellar motility genes","consensus":"ATTTTTWAANAAAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":17.80774500503113,"max_score":26.06143},{"name":"MogR","start":3138726,"species":"Listeria monocytogenes EGD-e","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/233/35/","description":"Repressor of flagellar motility genes","consensus":"ATTTTTWAANAAAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":15.060985582326651,"max_score":26.06143},{"name":"MogR","start":3152466,"species":"Listeria monocytogenes EGD-e","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/233/35/","description":"Repressor of flagellar motility genes","consensus":"ATTTTTWAANAAAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":12.718689774298849,"max_score":26.06143},{"name":"MogR","start":3152467,"species":"Listeria monocytogenes EGD-e","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/233/35/","description":"Repressor of flagellar motility genes","consensus":"ATTTTTWAANAAAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":13.001752306094046,"max_score":26.06143},{"name":"ToxT","start":3138731,"species":"Vibrio cholerae O395","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/18/16/","description":"Regulator of MSHA biosynthesis","consensus":"TRTTTTTTKA","confidence":"strong","strand":-1,"score":18.038464083026962,"max_score":18.57433}],"21":[{"name":"LexA_variant_1","start":3687152,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/LexA","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"TCGAANKNNTGTTCGA","confidence":"weak","strand":1,"score":20.190604882578814,"max_score":29.65219},{"name":"CcpA","start":3670352,"species":"Streptococcus & Clostridium sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/25/180/","description":"Catabolite control protein A","consensus":"GAAAANGNTTNC","confidence":"medium","strand":1,"score":16.899610521459042,"max_score":20.96724},{"name":"PsrA","start":3670166,"species":"Pseudomonas sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/109/59/","description":"Oleic acid responsive regulator","consensus":"CAAACGYNNGTTTG","confidence":"weak","strand":-1,"score":19.272088406213882,"max_score":25.87793},{"name":"RutR","start":3687152,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/27/6/","description":"Regulator of the pyrimidine and purine metabolism","consensus":"TTGACCRNNTGGTCNR","confidence":"weak","strand":1,"score":20.539847022484068,"max_score":26.85092},{"name":"RutR","start":3691297,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/27/6/","description":"Regulator of the pyrimidine and purine metabolism","consensus":"TTGACCRNNTGGTCNR","confidence":"medium","strand":1,"score":20.908090474651384,"max_score":26.85092}],"22":[{"name":"CelR","start":4509708,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/CelR","description":"Cellobiose uptake repressor","consensus":"TGGGAGCGCTCCCAN","confidence":"medium","strand":-1,"score":23.287886183739406,"max_score":30.11462},{"name":"CelR","start":4509709,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/CelR","description":"Cellobiose uptake repressor","consensus":"TGGGAGCGCTCCCAN","confidence":"weak","strand":1,"score":23.196023843509362,"max_score":30.11462},{"name":"ZuR_variant_1","start":4523563,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/ZuR","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TGAANNTCATTTTCA","confidence":"weak","strand":-1,"score":17.538491258424074,"max_score":28.18779},{"name":"ANR","start":4500223,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/143/58/","description":"Anaerobic transcriptional regulator","consensus":"TTGAYCCAGATCAA","confidence":"medium","strand":-1,"score":20.54400623328517,"max_score":26.32537},{"name":"MexT","start":4514458,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/76/59/","description":"Global virulence regulator","consensus":"ATCANNNNTGTCGAT","confidence":"weak","strand":1,"score":17.30452217660188,"max_score":21.84196}],"23":[{"name":"AfsQ1","start":4993588,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/AfsQ1","description":"Two-component system AfsQ1-Q2, activator of antibiotic production","consensus":"GTCACNNNNNNGTCAC","confidence":"weak","strand":-1,"score":16.86011416115592,"max_score":19.52302},{"name":"DmdR1","start":5012255,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/DmdR1","description":"Iron(II)-dependent repressor","consensus":"TTAGGTTAGGCTCACCTWA","confidence":"weak","strand":1,"score":22.98989105448871,"max_score":36.52555},{"name":"DmdR1","start":5012260,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/DmdR1","description":"Iron(II)-dependent repressor","consensus":"TTAGGTTAGGCTCACCTWA","confidence":"strong","strand":-1,"score":34.355702034316856,"max_score":36.52555},{"name":"DmdR1","start":5014410,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/DmdR1","description":"Iron(II)-dependent repressor","consensus":"TTAGGTTAGGCTCACCTWA","confidence":"medium","strand":-1,"score":30.940782350469515,"max_score":36.52555},{"name":"ZuR_variant_1","start":5007160,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/ZuR","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TGAANNTCATTTTCA","confidence":"weak","strand":-1,"score":16.523265196319343,"max_score":28.18779},{"name":"ANR","start":5007017,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/143/58/","description":"Anaerobic transcriptional regulator","consensus":"TTGAYCCAGATCAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":18.111046826009066,"max_score":26.32537},{"name":"ArcA","start":4996062,"species":"Escherichia coli str. 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MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/27/6/","description":"Regulator of the pyrimidine and purine metabolism","consensus":"TTGACCRNNTGGTCNR","confidence":"weak","strand":1,"score":19.999697626105913,"max_score":26.85092}],"24":[{"name":"AbrC3","start":5138854,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/AbrC3","description":"Antibiotic production activator","consensus":"GAASGCGRCS","confidence":"strong","strand":-1,"score":18.15655576909236,"max_score":18.15656},{"name":"AfsR","start":5142349,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/AfsR","description":"Pleiotropic regulatory for antibiotic production","consensus":"GTAAATGAACGC","confidence":"medium","strand":1,"score":18.46067740327897,"max_score":23.04516},{"name":"LexA_variant_3","start":5134100,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. 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K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/47/6/","description":"Repressor of carbon oxidation","consensus":"WTGTTAAWNNNWTGTTAN","confidence":"weak","strand":1,"score":16.62507778288335,"max_score":21.55091},{"name":"CRP","start":5704808,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. 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bacteria","consensus":"AWTTTTCAGAAAATT","confidence":"weak","strand":1,"score":15.314994772857833,"max_score":27.78253},{"name":"CopR","start":6081310,"species":"Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/121/191/","description":"Copper-responsive regulator","consensus":"RTTTACANWTGTAAAC","confidence":"weak","strand":-1,"score":16.724278330465,"max_score":30.9718},{"name":"HexR","start":6066945,"species":"Shewanella oneidensis MR-1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/80/218/","description":"Glucose-responsive regulator","consensus":"TTGTAATTTTATTACAR","confidence":"weak","strand":1,"score":15.659013576319278,"max_score":31.73147},{"name":"HgtR","start":6072669,"species":"Geobacter sulfurreducens PCA","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/60/104/","description":"Hydrogen-dependent regulator","consensus":"AWATTGTATACAGTATACR","confidence":"weak","strand":-1,"score":17.13505523901968,"max_score":36.53961},{"name":"HgtR","start":6072672,"species":"Geobacter sulfurreducens PCA","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/60/104/","description":"Hydrogen-dependent regulator","consensus":"AWATTGTATACAGTATACR","confidence":"weak","strand":1,"score":18.998445686871136,"max_score":36.53961},{"name":"LuxO","start":6066957,"species":"Vibrio campbellii ATCC BAA-1116","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/208/197/","description":"Repressor of luminescence","consensus":"TTGCATTTTGCAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":18.700279037688155,"max_score":26.11696},{"name":"MogR","start":6066950,"species":"Listeria monocytogenes EGD-e","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/233/35/","description":"Repressor of flagellar motility 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genes","consensus":"ATTTTTWAANAAAA","confidence":"weak","strand":1,"score":13.836096957196965,"max_score":26.06143},{"name":"MogR","start":6066970,"species":"Listeria monocytogenes EGD-e","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/233/35/","description":"Repressor of flagellar motility genes","consensus":"ATTTTTWAANAAAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":12.688803615917084,"max_score":26.06143},{"name":"ToxT","start":6081320,"species":"Vibrio cholerae O395","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/18/16/","description":"Regulator of MSHA biosynthesis","consensus":"TRTTTTTTKA","confidence":"weak","strand":-1,"score":14.077602585031965,"max_score":18.57433},{"name":"VqsM","start":6084061,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/234/59/","description":"Regulator of quorum-sensing signalling systems","consensus":"GGANNNYNTCGGCCA","confidence":"strong","strand":-1,"score":20.468886013445566,"max_score":20.46889}],"28":[{"name":"ClgR","start":6686421,"species":"Corynebacterium glutamicum ATCC 13032","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/102/77/","description":"Caseinolytic protease gene regulator","consensus":"ACGCCGNNAGCGAACA","confidence":"weak","strand":1,"score":21.502632783027828,"max_score":30.22426}],"29":[{"name":"AbrC3","start":6836555,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/AbrC3","description":"Antibiotic production activator","consensus":"GAASGCGRCS","confidence":"strong","strand":1,"score":18.15655576909236,"max_score":18.15656},{"name":"AfsQ1","start":6879883,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/AfsQ1","description":"Two-component system AfsQ1-Q2, activator of antibiotic 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repressor","consensus":"TGCMATGTCAC","confidence":"weak","strand":1,"score":18.594059458850385,"max_score":22.39835},{"name":"LexA_variant_1","start":6867087,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/LexA","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"TCGAANKNNTGTTCGA","confidence":"weak","strand":1,"score":21.02576288708433,"max_score":29.65219},{"name":"LexA_variant_3","start":6871090,"species":"Escherichia coli str. 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