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rule-based-clusters)"],"transl_table":["11"],"translation":["MQFRTRTAVVTGAASGIGLALSARFARAGARVVMADVADDALHRRAAELTAQDAQVTAVTADLTDPDAVEQLADTAFGLLGDVDVVCNNAGVLGPVGQPLWEVPLERMRQVFEVNHWAHVLVARAFVPRLLERGRPAHLIHTASMSAFVVGAGSAAYAASKHADLAVARSLRADLRGTGIRVSVLCPGRVDTPMVQGLTAPRGAGGDTSVSAEDVAGLVWEALGTDRFYLFSNADAPQRLRDQFDDVWRDISLPPPSPEEEPWPAPKATTAMKP"]}},{"location":"[1639259:1639772](-)","type":"aSDomain","qualifiers":{"aSDomain":["PKS_KR"],"aSTool":["nrps_pks_domains"],"database":["nrpspksdomains.hmm"],"detection":["hmmscan"],"domain_id":["nrpspksdomains_BN2145_RS07860_PKS_KR.1"],"evalue":["1.30E-11"],"label":["BN2145_RS07860_PKS_KR.1"],"locus_tag":["BN2145_RS07860"],"protein_end":["177"],"protein_start":["6"],"score":["36.7"],"tool":["antismash"],"translation":["TAVVTGAASGIGLALSARFARAGARVVMADVADDALHRRAAELTAQDAQVTAVTADLTDPDAVEQLADTAFGLLGDVDVVCNNAGVLGPVGQPLWEVPLERMRQVFEVNHWAHVLVARAFVPRLLERGRPAHLIHTASMSAFVVGAGSAAYAASKHADLAVARSLRADLRG"]}},{"location":"[1639697:1639766](-)","type":"CDS_motif","qualifiers":{"aSTool":["nrps_pks_domains"],"database":["abmotifs"],"detection":["hmmscan"],"domain_id":["nrpspksmotif_BN2145_RS07860_0001"],"evalue":["2.90E-05"],"label":["PKSI-KR_m1"],"locus_tag":["BN2145_RS07860"],"protein_end":["31"],"protein_start":["8"],"score":["16.7"],"tool":["antismash"],"translation":["VVTGAASGIGLALSARFARAGAR"]}},{"location":"[1639890:1641345](-)","type":"gene","qualifiers":{"locus_tag":["BN2145_RS07865"],"old_locus_tag":["ABM27_RS07745"]}},{"location":"[1639890:1641345](-)","type":"CDS","qualifiers":{"codon_start":["1"],"gene_functions":["transport 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sequence:RefSeq:WP_014173542.1"],"locus_tag":["BN2145_RS07880"],"note":["Derived by automated computational analysis using gene prediction method: Protein Homology."],"old_locus_tag":["ABM27_RS07760"],"product":["type I glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase"],"protein_id":["WP_029385652.1"],"transl_table":["11"],"translation":["MTITVGINGFGRIGRSYFRALLASGADIRVAAVNDLTDAKALANLLKYDSVYGPLPQEVVAEGSSLRVGDTVVEVLGERDPAQLPWGRLGVDVVIESTGVFNDAAKARKHIDAGASKVVVSAAAKNADLTLVYGVNDNLYDPEKHTIVSNASCTTNCLAPMARVLDDALGIECGTMTTIHAYTQDQNLQDGPHADPRRARAANLSTIPTTTNAASAIGLVLPSLQGKLDGFSVRVPVPVGSLTDLTVRVGRETSVEEVNSLFRKAADGDLARILRYTADPVVSADIVRDPASCIFDSLLTQVIDGRHVHVFGWYDNEWGFSNRLIDTTKLVAGVTE"]}},{"location":"[1645519:1645981](+)","type":"gene","qualifiers":{"locus_tag":["BN2145_RS07885"],"old_locus_tag":["ABM27_RS07765"]}},{"location":"[1645519:1645981](+)","type":"CDS","qualifiers":{"GO_function":["GO:0003677 - DNA binding [Evidence IEA]","GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity [Evidence 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However, it belongs more specifically to UdgX branch, whose founding member was found to bind uracil in DNA (where it does not belong), without cleaving it, appears to promote DNA repair by a pathway involving RecA, rather than base excision; Derived by automated computational analysis using gene prediction method: Protein Homology."],"old_locus_tag":["ABM27_RS16690"],"product":["UdgX family uracil-DNA binding protein"],"protein_id":["WP_029381098.1"],"transl_table":["11"],"translation":["MSPRTSAPEDAYNAAPFVPDGAGLAALREAAAGCRGCPLHRDATQTVFGAGDTGARVMLVGEQPGDQEDRQGRPFVGPAGKLLDRALAEAGIDPGEAYVTNAVKHFKFTRAEPRKRRIHKAPTLRETTACGPWLAAELALVEPELIVVLGATAGKALLGSSFRVTEVRGTVLEEEIHGRPERLVPTAHPSAVLRAEDREGAYQGLVSDLRVAARALG"]}},{"location":"[3707429:3708593](-)","type":"gene","qualifiers":{"gene":["mqnE"],"locus_tag":["BN2145_RS16965"],"old_locus_tag":["ABM27_RS16695"]}},{"location":"[3707429:3708593](-)","type":"CDS","qualifiers":{"GO_process":["GO:0009234 - menaquinone biosynthetic process [Evidence 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rule-based-clusters)","PP-binding (E-value: 3.6e-06, bitscore: 26.0, seeds: 164, tool: rule-based-clusters)","NAD_binding_4 (E-value: 6.1e-57, bitscore: 191.2, seeds: 102, tool: rule-based-clusters)","RmlD_sub_bind (E-value: 2.7e-06, bitscore: 25.3, seeds: 37, tool: 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I+saccharide+other:aminocoumarin",51.0,112.0,95.45454545454545,2.47e-33],["AAO65345.1","JadI_cyclase-like_protein","BGC0000236.5",1,"PKS",50.0,110.0,96.36363636363636,2.08e-32],["CAH10118.1","putative_cyclase","BGC0000268.5",1,"PKS",50.0,108.0,95.45454545454545,8.18e-32],["TRO56976.1","TcmI_family_type_II_polyketide_cyclase","BGC0002361.3",1,"PKS+saccharide",50.0,108.0,95.45454545454545,8.18e-32],["QOP59269.1","polyketide_synthesis_cyclase","BGC0002504.2",1,"PKS",48.0,108.0,98.18181818181819,8.18e-32],["ABM21757.1","PdmK","BGC0000256.3",1,"PKS",51.0,108.0,96.36363636363636,9.73e-32],["BAV16998.1","putative_cyclase","BGC0001384.5",1,"PKS",50.0,107.0,95.45454545454545,1.65e-31],["MBW8699682.1","Tetracenomycin_F2_cyclase","BGC0002140.2",1,"PKS",51.0,107.0,95.45454545454545,1.65e-31],["CBH32813.1","putative_cyclase","BGC0000263.5",1,"PKS",45.0,107.0,98.18181818181819,3.32e-31],["OKI81338.1","polyketide_synthase","BGC0002478.3",1,"PKS",51.0,107.0,95.45454545454545,3.32e-31],["ARO44683.1","cyclase","BGC0001769.5",1,"PKS",51.0,106.0,95.45454545454545,4.71e-31],["AVO00816.1","May17","BGC0001661.5",1,"PKS",49.0,105.0,99.0909090909091,1.96e-30],["UPN68080.1","cyclase","BGC0002672.2",1,"PKS",50.0,104.0,95.45454545454545,2.71e-30],["CBH32084.1","putative_cyclase","BGC0000211.5",1,"PKS",46.0,104.0,99.0909090909091,3.95e-30],["ACP19352.1","SaqF","BGC0000267.5",1,"PKS:Type 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II+saccharide:hybrid/tailoring",47.0,98.0,95.45454545454545,1.5e-27],["POM23761.1","Tetracenomycin_polyketide_synthesis_protein_TcmI","BGC0002369.2",1,"PKS",47.0,97.0,95.45454545454545,2.02e-27],["ARD70869.1","Polyketide_synthesis,_cyclase","BGC0001693.3",1,"PKS",43.0,93.0,96.36363636363636,9.95e-26],["BAJ07841.1","putative_cyclase","BGC0000232.5",1,"PKS",44.0,93.0,98.18181818181819,1.08e-25],["QDG00827.1","polyketide_cyclase","BGC0002028.4",1,"PKS",44.0,95.0,95.45454545454545,1.34e-25],["EHM27504.1","polyketide_synthesis_cyclase","BGC0000235.5",1,"PKS",43.0,91.0,90.0,6.13e-25],["AHZ61855.1","Lom21","BGC0000240.5",1,"PKS:Type II+saccharide:hybrid/tailoring",42.0,91.0,95.45454545454545,8.08e-25],["WP_037658559.1","TcmI_family_type_II_polyketide_cyclase","BGC0002000.4",1,"PKS",42.0,91.0,96.36363636363636,8.31e-25],["AAA67513.1","","BGC0000275.4",1,"PKS:Type II",43.0,88.0,93.63636363636364,1.32e-23],["AAX57190.1","auricin_polyketide_cyclase","BGC0000201.5",1,"PKS+saccharide:hybrid/tailoring",42.0,88.0,94.54545454545455,1.35e-23],["ABP54644.1","Polyketide_synthesis_cyclase","BGC0000241.5",1,"PKS:Type II+saccharide:hybrid/tailoring",41.0,87.0,95.45454545454545,1.87e-23],["BAQ25475.1","polyketide_synthesis_cyclase","BGC0001288.5",1,"PKS",43.0,83.0,90.9090909090909,1.18e-20],["CAP12598.1","TcmF2_cyclase","BGC0000219.4",1,"PKS:Type 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Yersinia sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/8/12/","description":"Ferric Uptake Regulator","consensus":"AATGANAATNATTATC","confidence":"weak","strand":-1,"score":18.51566759909886,"max_score":29.38453},{"name":"HgtR","start":954854,"species":"Geobacter sulfurreducens PCA","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/60/104/","description":"Hydrogen-dependent regulator","consensus":"AWATTGTATACAGTATACR","confidence":"weak","strand":-1,"score":18.00772325633842,"max_score":36.53961},{"name":"LuxO","start":954853,"species":"Vibrio campbellii ATCC BAA-1116","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/208/197/","description":"Repressor of luminescence","consensus":"TTGCATTTTGCAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":18.553994131994614,"max_score":26.11696},{"name":"MexT","start":936758,"species":"Pseudomonas aeruginosa 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K-12 substr. 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sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/22/170/","description":"Peroxide regulator","consensus":"TATAATTATTATAA","confidence":"weak","strand":1,"score":13.777564390044564,"max_score":28.13881},{"name":"PerR","start":1813859,"species":"Bacillus & Staphylococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/22/170/","description":"Peroxide regulator","consensus":"TATAATTATTATAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":13.268319594579388,"max_score":28.13881},{"name":"RutR","start":1820747,"species":"Escherichia coli str. 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coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/CatR","description":"H2O2-responsive repressor","consensus":"TGGANMGNRTCTAA","confidence":"weak","strand":1,"score":17.23349368928926,"max_score":25.31008},{"name":"NuR","start":1987269,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/NuR","description":"Nickel-responsive regulator","consensus":"TTGCANANNACTYGCAA","confidence":"weak","strand":1,"score":21.225324613316644,"max_score":30.97839},{"name":"ANR","start":1992207,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/143/58/","description":"Anaerobic transcriptional regulator","consensus":"TTGAYCCAGATCAA","confidence":"medium","strand":1,"score":21.93304852403107,"max_score":26.32537}],"16":[{"name":"CcpA","start":2013919,"species":"Streptococcus & Clostridium sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/25/180/","description":"Catabolite control protein A","consensus":"GAAAANGNTTNC","confidence":"weak","strand":1,"score":15.699765875752124,"max_score":20.96724},{"name":"IolR","start":2018129,"species":"Caulobacter crescentus CB15","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/66/138/","description":"Regulator of the inositol catabolism","consensus":"GGANNANNYGTTCCN","confidence":"medium","strand":1,"score":17.9255055564708,"max_score":23.7932},{"name":"MexT","start":2013736,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/76/59/","description":"Global virulence regulator","consensus":"ATCANNNNTGTCGAT","confidence":"weak","strand":-1,"score":17.30452217660188,"max_score":21.84196},{"name":"MogR","start":2014153,"species":"Listeria monocytogenes 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PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/234/59/","description":"Regulator of quorum-sensing signalling systems","consensus":"GGANNNYNTCGGCCA","confidence":"strong","strand":1,"score":19.346895489066956,"max_score":20.46889}],"17":[{"name":"AfsR","start":2284925,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/AfsR","description":"Pleiotropic regulatory for antibiotic production","consensus":"GTAAATGAACGC","confidence":"medium","strand":-1,"score":18.460677403278968,"max_score":23.04516},{"name":"AfsR","start":2285138,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/AfsR","description":"Pleiotropic regulatory for antibiotic production","consensus":"GTAAATGAACGC","confidence":"medium","strand":1,"score":18.762947008991794,"max_score":23.04516},{"name":"AfsR","start":2288627,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/AfsR","description":"Pleiotropic regulatory for antibiotic production","consensus":"GTAAATGAACGC","confidence":"medium","strand":1,"score":19.75280724874102,"max_score":23.04516},{"name":"LexA_variant_1","start":2294468,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/LexA","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"TCGAANKNNTGTTCGA","confidence":"weak","strand":1,"score":23.09332347729913,"max_score":29.65219},{"name":"LexA_variant_1","start":2309750,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/LexA","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"TCGAANKNNTGTTCGA","confidence":"weak","strand":-1,"score":19.884861963829042,"max_score":29.65219},{"name":"LexA_variant_2","start":2294469,"species":"Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/1/12/","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"MGAACAWANGTTCN","confidence":"medium","strand":-1,"score":20.9304061722907,"max_score":24.7784},{"name":"NrdR","start":2293860,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/NrdR","description":"Represses ribonucleotide reductase encoding genes","consensus":"NCACAASATGTGGGS","confidence":"strong","strand":1,"score":24.618410811635943,"max_score":27.17858},{"name":"NrdR","start":2293891,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/NrdR","description":"Represses ribonucleotide reductase encoding genes","consensus":"NCACAASATGTGGGS","confidence":"strong","strand":1,"score":26.063359264703866,"max_score":27.17858},{"name":"CRP","start":2309743,"species":"Escherichia coli str. 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MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/1/6/","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"TACTGTATAWAWNNMCAGN","confidence":"weak","strand":-1,"score":20.69851122051239,"max_score":32.92827},{"name":"NrtR","start":3553366,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/NrtR","description":"NAD synthesis repressor","consensus":"TTNTNGTCRNNNTGACGATTA","confidence":"weak","strand":1,"score":20.24590087916105,"max_score":35.6303},{"name":"NuR","start":3572027,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/NuR","description":"Nickel-responsive regulator","consensus":"TTGCANANNACTYGCAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":20.447777142187952,"max_score":30.97839},{"name":"ZuR_variant_2","start":3572038,"species":"Pseudomonas protegens Pf-5","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/46/235/","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TTGTTATAANATAACAT","confidence":"weak","strand":-1,"score":16.97544131122576,"max_score":33.14175},{"name":"ANR","start":3573777,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/143/58/","description":"Anaerobic transcriptional regulator","consensus":"TTGAYCCAGATCAA","confidence":"weak","strand":1,"score":20.421149485499633,"max_score":26.32537},{"name":"ArcA","start":3553215,"species":"Escherichia coli str. 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168","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/1/12/","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"MGAACAWANGTTCN","confidence":"medium","strand":1,"score":21.39234464653857,"max_score":24.7784},{"name":"ZuR_variant_1","start":3693088,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/ZuR","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TGAANNTCATTTTCA","confidence":"weak","strand":1,"score":20.205067931483377,"max_score":28.18779},{"name":"ANR","start":3683647,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/143/58/","description":"Anaerobic transcriptional regulator","consensus":"TTGAYCCAGATCAA","confidence":"medium","strand":-1,"score":21.15811507966584,"max_score":26.32537},{"name":"CcpA","start":3688569,"species":"Streptococcus & Clostridium sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/25/180/","description":"Catabolite control protein A","consensus":"GAAAANGNTTNC","confidence":"weak","strand":-1,"score":15.291817140702257,"max_score":20.96724},{"name":"CopR","start":3687033,"species":"Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/121/191/","description":"Copper-responsive regulator","consensus":"RTTTACANWTGTAAAC","confidence":"weak","strand":-1,"score":16.98963303001479,"max_score":30.9718},{"name":"HexR","start":3688417,"species":"Shewanella oneidensis MR-1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/80/218/","description":"Glucose-responsive regulator","consensus":"TTGTAATTTTATTACAR","confidence":"weak","strand":-1,"score":19.652315460996583,"max_score":31.73147},{"name":"PerR","start":3687042,"species":"Bacillus & Staphylococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/22/170/","description":"Peroxide regulator","consensus":"TATAATTATTATAA","confidence":"weak","strand":1,"score":13.037787909917274,"max_score":28.13881},{"name":"PsrA","start":3691019,"species":"Pseudomonas sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/109/59/","description":"Oleic acid responsive regulator","consensus":"CAAACGYNNGTTTG","confidence":"weak","strand":-1,"score":18.906307600830946,"max_score":25.87793}],"24":[{"name":"AbrC3","start":5225161,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/AbrC3","description":"Antibiotic production activator","consensus":"GAASGCGRCS","confidence":"strong","strand":-1,"score":18.15655576909236,"max_score":18.15656},{"name":"BldD","start":5230573,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/BldD","description":"Development and antibiotic global regulator","consensus":"GTNACKCTNNGTGA","confidence":"medium","strand":-1,"score":20.257526347989078,"max_score":23.43222},{"name":"CatR","start":5244422,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/CatR","description":"H2O2-responsive repressor","consensus":"TGGANMGNRTCTAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":17.98654548139751,"max_score":25.31008},{"name":"CelR","start":5225212,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/CelR","description":"Cellobiose uptake repressor","consensus":"TGGGAGCGCTCCCAN","confidence":"medium","strand":-1,"score":24.06545642163333,"max_score":30.11462},{"name":"CelR","start":5225213,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/CelR","description":"Cellobiose uptake repressor","consensus":"TGGGAGCGCTCCCAN","confidence":"medium","strand":1,"score":23.894196537642884,"max_score":30.11462},{"name":"DasR","start":5235438,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/DasR","description":"N-acetylglucosamine dependent repressor","consensus":"ANWGGTCTAGACCANW","confidence":"medium","strand":-1,"score":22.046697876720405,"max_score":27.0358},{"name":"DmdR1","start":5242251,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/DmdR1","description":"Iron(II)-dependent repressor","consensus":"TTAGGTTAGGCTCACCTWA","confidence":"strong","strand":-1,"score":34.355702034316856,"max_score":36.52555},{"name":"DmdR1","start":5244406,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/DmdR1","description":"Iron(II)-dependent repressor","consensus":"TTAGGTTAGGCTCACCTWA","confidence":"medium","strand":-1,"score":30.940782350469515,"max_score":36.52555},{"name":"LexA_variant_1","start":5248578,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/LexA","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"TCGAANKNNTGTTCGA","confidence":"weak","strand":1,"score":20.10138356419627,"max_score":29.65219},{"name":"LexA_variant_2","start":5248579,"species":"Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/1/12/","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"MGAACAWANGTTCN","confidence":"weak","strand":1,"score":19.250024106490862,"max_score":24.7784},{"name":"NrtR","start":5223859,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/NrtR","description":"NAD synthesis repressor","consensus":"TTNTNGTCRNNNTGACGATTA","confidence":"weak","strand":-1,"score":18.926223718064975,"max_score":35.6303},{"name":"NrtR","start":5230536,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/NrtR","description":"NAD synthesis repressor","consensus":"TTNTNGTCRNNNTGACGATTA","confidence":"weak","strand":1,"score":19.281025989182105,"max_score":35.6303},{"name":"ZuR_variant_1","start":5248579,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/ZuR","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TGAANNTCATTTTCA","confidence":"weak","strand":1,"score":16.745898592423742,"max_score":28.18779},{"name":"CRP","start":5242296,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/7/6/","description":"Cyclic AMP receptor protein","consensus":"TGTGANNNNNNTCACA","confidence":"medium","strand":-1,"score":16.375753973993042,"max_score":19.25568},{"name":"CodY","start":5230725,"species":"Bacillus, Lactococcus & Streptococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/32/149/","description":"Regulator of stationary phase and virulence in Gram-positive bacteria","consensus":"AWTTTTCAGAAAATT","confidence":"weak","strand":-1,"score":17.16107158455371,"max_score":27.78253},{"name":"MntR","start":5242253,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/30/6/","description":"Manganese transport regulator","consensus":"AAACATAGCAYAGGCTATATT","confidence":"weak","strand":-1,"score":20.905696416017086,"max_score":39.62117},{"name":"VqsM","start":5235392,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/234/59/","description":"Regulator of quorum-sensing signalling systems","consensus":"GGANNNYNTCGGCCA","confidence":"medium","strand":1,"score":17.71128412658506,"max_score":20.46889}],"25":[{"name":"SypG","start":5339172,"species":"Vibrio fischeri ES114","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/187/19/","description":"Regulator of biofilm formation and host colonization","consensus":"TTCTCAATTTGARAA","confidence":"weak","strand":1,"score":16.18092444285492,"max_score":29.24588}],"26":[{"name":"NrtR","start":5404616,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/NrtR","description":"NAD synthesis repressor","consensus":"TTNTNGTCRNNNTGACGATTA","confidence":"weak","strand":-1,"score":18.4482587836447,"max_score":35.6303},{"name":"NrtR","start":5412256,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/NrtR","description":"NAD synthesis repressor","consensus":"TTNTNGTCRNNNTGACGATTA","confidence":"weak","strand":-1,"score":19.59643850582198,"max_score":35.6303},{"name":"OsdR","start":5408754,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/OsdR","description":"Development and stress management regulator","consensus":"GGGCCGACCGGCCCT","confidence":"medium","strand":1,"score":25.089191332187063,"max_score":30.11854},{"name":"CcpA","start":5405558,"species":"Streptococcus & Clostridium sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/25/180/","description":"Catabolite control protein A","consensus":"GAAAANGNTTNC","confidence":"weak","strand":-1,"score":16.033479285582473,"max_score":20.96724},{"name":"HgtR","start":5399351,"species":"Geobacter sulfurreducens PCA","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/60/104/","description":"Hydrogen-dependent regulator","consensus":"AWATTGTATACAGTATACR","confidence":"weak","strand":-1,"score":17.435732147784204,"max_score":36.53961},{"name":"IolR","start":5386704,"species":"Caulobacter crescentus CB15","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/66/138/","description":"Regulator of the inositol catabolism","consensus":"GGANNANNYGTTCCN","confidence":"medium","strand":-1,"score":18.110859157304517,"max_score":23.7932},{"name":"MexT","start":5411289,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/76/59/","description":"Global virulence regulator","consensus":"ATCANNNNTGTCGAT","confidence":"weak","strand":1,"score":17.30452217660188,"max_score":21.84196},{"name":"PerR","start":5406274,"species":"Bacillus & Staphylococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/22/170/","description":"Peroxide regulator","consensus":"TATAATTATTATAA","confidence":"weak","strand":1,"score":12.651705062873145,"max_score":28.13881},{"name":"RpoN","start":5403789,"species":"Salmonella & Vibrio sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/9/27/","description":"Regulator of nitrogen assimilation and virulence","consensus":"GGCAYNNWNNTTGC","confidence":"medium","strand":-1,"score":16.824840068946443,"max_score":18.4649},{"name":"RutR","start":5410674,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/27/6/","description":"Regulator of the pyrimidine and purine metabolism","consensus":"TTGACCRNNTGGTCNR","confidence":"weak","strand":1,"score":19.739524621124485,"max_score":26.85092},{"name":"RutR","start":5411640,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/27/6/","description":"Regulator of the pyrimidine and purine metabolism","consensus":"TTGACCRNNTGGTCNR","confidence":"weak","strand":1,"score":19.276511585134113,"max_score":26.85092}],"27":[{"name":"CRP","start":6183818,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/7/6/","description":"Cyclic AMP receptor protein","consensus":"TGTGANNNNNNTCACA","confidence":"medium","strand":1,"score":16.521855725616977,"max_score":19.25568},{"name":"FuR_variant_1","start":6183976,"species":"Bacillus, Pseudomonas, Yersinia sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/8/12/","description":"Ferric Uptake Regulator","consensus":"AATGANAATNATTATC","confidence":"weak","strand":-1,"score":15.67739638173129,"max_score":29.38453},{"name":"LuxO","start":6183687,"species":"Vibrio campbellii ATCC BAA-1116","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/208/197/","description":"Repressor of luminescence","consensus":"TTGCATTTTGCAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":17.04209509346318,"max_score":26.11696},{"name":"MogR","start":6186518,"species":"Listeria monocytogenes EGD-e","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/233/35/","description":"Repressor of flagellar motility genes","consensus":"ATTTTTWAANAAAA","confidence":"weak","strand":1,"score":12.971396209552191,"max_score":26.06143}],"28":[{"name":"AfsQ1","start":6719521,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/AfsQ1","description":"Two-component system AfsQ1-Q2, activator of antibiotic production","consensus":"GTCACNNNNNNGTCAC","confidence":"weak","strand":1,"score":16.86011416115592,"max_score":19.52302},{"name":"LexA_variant_1","start":6732712,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/LexA","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"TCGAANKNNTGTTCGA","confidence":"weak","strand":1,"score":21.594771533342627,"max_score":29.65219},{"name":"LexA_variant_1","start":6738729,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/LexA","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"TCGAANKNNTGTTCGA","confidence":"weak","strand":1,"score":20.073777746697765,"max_score":29.65219},{"name":"NrtR","start":6711380,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/NrtR","description":"NAD synthesis repressor","consensus":"TTNTNGTCRNNNTGACGATTA","confidence":"weak","strand":1,"score":18.22533905846388,"max_score":35.6303},{"name":"NrtR","start":6723022,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/NrtR","description":"NAD synthesis repressor","consensus":"TTNTNGTCRNNNTGACGATTA","confidence":"weak","strand":-1,"score":18.796040081874757,"max_score":35.6303},{"name":"ZuR_variant_2","start":6735867,"species":"Pseudomonas protegens Pf-5","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/46/235/","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TTGTTATAANATAACAT","confidence":"weak","strand":-1,"score":15.16376950277057,"max_score":33.14175},{"name":"CopR","start":6719613,"species":"Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/121/191/","description":"Copper-responsive regulator","consensus":"RTTTACANWTGTAAAC","confidence":"weak","strand":-1,"score":17.334768516063473,"max_score":30.9718},{"name":"FuR_variant_1","start":6712491,"species":"Bacillus, Pseudomonas, Yersinia sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/8/12/","description":"Ferric Uptake Regulator","consensus":"AATGANAATNATTATC","confidence":"weak","strand":-1,"score":16.99780864404434,"max_score":29.38453},{"name":"HexR","start":6711348,"species":"Shewanella oneidensis MR-1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/80/218/","description":"Glucose-responsive regulator","consensus":"TTGTAATTTTATTACAR","confidence":"weak","strand":-1,"score":15.91724319748362,"max_score":31.73147},{"name":"HexR","start":6733976,"species":"Shewanella oneidensis MR-1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/80/218/","description":"Glucose-responsive regulator","consensus":"TTGTAATTTTATTACAR","confidence":"weak","strand":-1,"score":15.568164423241683,"max_score":31.73147},{"name":"IolR","start":6724095,"species":"Caulobacter crescentus CB15","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/66/138/","description":"Regulator of the inositol catabolism","consensus":"GGANNANNYGTTCCN","confidence":"medium","strand":1,"score":18.63542307395641,"max_score":23.7932},{"name":"MntR","start":6733902,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/30/6/","description":"Manganese transport regulator","consensus":"AAACATAGCAYAGGCTATATT","confidence":"weak","strand":1,"score":20.74774405624085,"max_score":39.62117},{"name":"MogR","start":6735867,"species":"Listeria monocytogenes EGD-e","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/233/35/","description":"Repressor of flagellar motility genes","consensus":"ATTTTTWAANAAAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":12.477133389976286,"max_score":26.06143}],"29":[{"name":"LexA_variant_2","start":6823829,"species":"Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/1/12/","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"MGAACAWANGTTCN","confidence":"weak","strand":-1,"score":18.21943578665744,"max_score":24.7784},{"name":"LexA_variant_2","start":6823881,"species":"Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/1/12/","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"MGAACAWANGTTCN","confidence":"weak","strand":1,"score":18.908038359262246,"max_score":24.7784},{"name":"LexA_variant_2","start":6823885,"species":"Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/1/12/","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"MGAACAWANGTTCN","confidence":"medium","strand":-1,"score":20.093904904573577,"max_score":24.7784},{"name":"LexA_variant_2","start":6849109,"species":"Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/1/12/","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"MGAACAWANGTTCN","confidence":"weak","strand":1,"score":18.782507477178388,"max_score":24.7784},{"name":"CcpA","start":6849118,"species":"Streptococcus & Clostridium sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/25/180/","description":"Catabolite control protein A","consensus":"GAAAANGNTTNC","confidence":"weak","strand":-1,"score":15.312996757080747,"max_score":20.96724},{"name":"ClgR","start":6849224,"species":"Corynebacterium glutamicum ATCC 13032","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/102/77/","description":"Caseinolytic protease gene regulator","consensus":"ACGCCGNNAGCGAACA","confidence":"weak","strand":-1,"score":22.60954798694434,"max_score":30.22426},{"name":"DosR","start":6852187,"species":"Mycobacterium tuberculosis H37Rv","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/4/25/","description":"Hypoxia stress response regulator","consensus":"KYGGGGACNANYGRCCCNNN","confidence":"medium","strand":-1,"score":24.724591386823995,"max_score":29.50795},{"name":"GnfM","start":6839744,"species":"Geobacter sulfurreducens PCA","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/58/104/","description":"Regulator of nitrogen-fixation genes","consensus":"TGCNNNAAAANNNGGCA","confidence":"weak","strand":1,"score":19.137004338952096,"max_score":27.5541},{"name":"GnfM","start":6863583,"species":"Geobacter sulfurreducens PCA","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/58/104/","description":"Regulator of nitrogen-fixation genes","consensus":"TGCNNNAAAANNNGGCA","confidence":"weak","strand":1,"score":20.34560980855847,"max_score":27.5541},{"name":"HgtR","start":6835878,"species":"Geobacter sulfurreducens PCA","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/60/104/","description":"Hydrogen-dependent regulator","consensus":"AWATTGTATACAGTATACR","confidence":"weak","strand":-1,"score":20.548342390799565,"max_score":36.53961},{"name":"IolR","start":6863951,"species":"Caulobacter crescentus CB15","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/66/138/","description":"Regulator of the inositol catabolism","consensus":"GGANNANNYGTTCCN","confidence":"medium","strand":1,"score":18.214285375141152,"max_score":23.7932},{"name":"PsrA","start":6823885,"species":"Pseudomonas sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/109/59/","description":"Oleic acid responsive regulator","consensus":"CAAACGYNNGTTTG","confidence":"weak","strand":1,"score":18.160372649260598,"max_score":25.87793},{"name":"RutR","start":6823384,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/27/6/","description":"Regulator of the pyrimidine and purine metabolism","consensus":"TTGACCRNNTGGTCNR","confidence":"weak","strand":1,"score":19.788875198849308,"max_score":26.85092}],"30":[{"name":"AfsR","start":7224039,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/AfsR","description":"Pleiotropic regulatory for antibiotic production","consensus":"GTAAATGAACGC","confidence":"medium","strand":-1,"score":18.762947008991794,"max_score":23.04516},{"name":"AfsR","start":7224393,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/AfsR","description":"Pleiotropic regulatory for antibiotic production","consensus":"GTAAATGAACGC","confidence":"medium","strand":1,"score":19.283765867148958,"max_score":23.04516},{"name":"DasR","start":7229169,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/DasR","description":"N-acetylglucosamine dependent repressor","consensus":"ANWGGTCTAGACCANW","confidence":"medium","strand":-1,"score":23.810865231895917,"max_score":27.0358},{"name":"DmdR1","start":7225925,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/DmdR1","description":"Iron(II)-dependent repressor","consensus":"TTAGGTTAGGCTCACCTWA","confidence":"weak","strand":1,"score":21.05667369893655,"max_score":36.52555},{"name":"NrtR","start":7229480,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/NrtR","description":"NAD synthesis repressor","consensus":"TTNTNGTCRNNNTGACGATTA","confidence":"weak","strand":-1,"score":18.72604155009185,"max_score":35.6303},{"name":"NuR","start":7240611,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/NuR","description":"Nickel-responsive 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stationary phase and virulence in Gram-positive bacteria","consensus":"AWTTTTCAGAAAATT","confidence":"weak","strand":-1,"score":15.007950582673853,"max_score":27.78253},{"name":"ColR","start":7147179,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/111/58/","description":"Phenol-responsive regulator","consensus":"TTNACNNTTTTTTCAC","confidence":"weak","strand":1,"score":17.87085218107213,"max_score":30.24844},{"name":"ColR","start":7229203,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/111/58/","description":"Phenol-responsive regulator","consensus":"TTNACNNTTTTTTCAC","confidence":"weak","strand":1,"score":17.683834089837564,"max_score":30.24844},{"name":"FuR_variant_2","start":7240610,"species":"Caulobacter crescentus CB15","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/8/138/","description":"Ferric Uptake Regulator","consensus":"ATTGCGAAYGNYTCTCAAN","confidence":"weak","strand":-1,"score":21.41181602790471,"max_score":32.74363},{"name":"MexT","start":7227463,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/76/59/","description":"Global virulence regulator","consensus":"ATCANNNNTGTCGAT","confidence":"weak","strand":1,"score":17.07099404221891,"max_score":21.84196},{"name":"MntR","start":7158451,"species":"Escherichia coli str. 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MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/30/6/","description":"Manganese transport regulator","consensus":"AAACATAGCAYAGGCTATATT","confidence":"weak","strand":1,"score":20.16873082185088,"max_score":39.62117},{"name":"PerR","start":7226489,"species":"Bacillus & Staphylococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/22/170/","description":"Peroxide regulator","consensus":"TATAATTATTATAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":16.229593931011465,"max_score":28.13881},{"name":"PerR","start":7226490,"species":"Bacillus & Staphylococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/22/170/","description":"Peroxide regulator","consensus":"TATAATTATTATAA","confidence":"weak","strand":1,"score":15.963707581948062,"max_score":28.13881},{"name":"PsrA","start":7147121,"species":"Pseudomonas sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/109/59/","description":"Oleic acid responsive regulator","consensus":"CAAACGYNNGTTTG","confidence":"weak","strand":1,"score":19.319162388805537,"max_score":25.87793},{"name":"RutR","start":7228262,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/27/6/","description":"Regulator of the pyrimidine and purine metabolism","consensus":"TTGACCRNNTGGTCNR","confidence":"medium","strand":1,"score":21.786674254149453,"max_score":26.85092},{"name":"SypG","start":7226444,"species":"Vibrio fischeri ES114","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/187/19/","description":"Regulator of biofilm formation and host colonization","consensus":"TTCTCAATTTGARAA","confidence":"weak","strand":1,"score":19.70612738462161,"max_score":29.24588},{"name":"SypG","start":7226450,"species":"Vibrio fischeri ES114","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/187/19/","description":"Regulator of biofilm formation and host colonization","consensus":"TTCTCAATTTGARAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":16.945214195999014,"max_score":29.24588},{"name":"SypG","start":7230239,"species":"Vibrio fischeri ES114","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/187/19/","description":"Regulator of biofilm formation and host colonization","consensus":"TTCTCAATTTGARAA","confidence":"weak","strand":1,"score":17.990276169016735,"max_score":29.24588},{"name":"ToxT","start":7228399,"species":"Vibrio cholerae O395","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/18/16/","description":"Regulator of MSHA biosynthesis","consensus":"TRTTTTTTKA","confidence":"weak","strand":-1,"score":15.114898874882932,"max_score":18.57433}],"31":[{"name":"AfsQ1","start":7424097,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/AfsQ1","description":"Two-component system AfsQ1-Q2, activator of antibiotic production","consensus":"GTCACNNNNNNGTCAC","confidence":"weak","strand":1,"score":16.786114111227548,"max_score":19.52302},{"name":"AfsR","start":7435716,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/AfsR","description":"Pleiotropic regulatory for antibiotic production","consensus":"GTAAATGAACGC","confidence":"medium","strand":-1,"score":18.460677403278968,"max_score":23.04516},{"name":"DmdR1","start":7356277,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/DmdR1","description":"Iron(II)-dependent repressor","consensus":"TTAGGTTAGGCTCACCTWA","confidence":"weak","strand":-1,"score":21.13354875856974,"max_score":36.52555},{"name":"LexA_variant_2","start":7395499,"species":"Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/1/12/","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"MGAACAWANGTTCN","confidence":"weak","strand":1,"score":19.871512483237133,"max_score":24.7784},{"name":"LexA_variant_3","start":7437419,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/1/6/","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"TACTGTATAWAWNNMCAGN","confidence":"weak","strand":1,"score":18.8360045740173,"max_score":32.92827},{"name":"LexA_variant_3","start":7437420,"species":"Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/1/6/","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"TACTGTATAWAWNNMCAGN","confidence":"weak","strand":-1,"score":20.958033811323208,"max_score":32.92827},{"name":"ANR","start":7439296,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/143/58/","description":"Anaerobic transcriptional regulator","consensus":"TTGAYCCAGATCAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":19.573152578944683,"max_score":26.32537},{"name":"CodY","start":7368257,"species":"Bacillus, Lactococcus & Streptococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/32/149/","description":"Regulator of stationary phase and virulence in Gram-positive bacteria","consensus":"AWTTTTCAGAAAATT","confidence":"weak","strand":-1,"score":15.271822132678064,"max_score":27.78253},{"name":"ColR","start":7369478,"species":"Pseudomonas putida KT2440","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/111/58/","description":"Phenol-responsive regulator","consensus":"TTNACNNTTTTTTCAC","confidence":"weak","strand":1,"score":17.481728682646104,"max_score":30.24844},{"name":"FuR_variant_2","start":7361733,"species":"Caulobacter crescentus CB15","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/8/138/","description":"Ferric Uptake Regulator","consensus":"ATTGCGAAYGNYTCTCAAN","confidence":"weak","strand":1,"score":20.471952255502718,"max_score":32.74363},{"name":"FuR_variant_2","start":7375993,"species":"Caulobacter crescentus CB15","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/8/138/","description":"Ferric Uptake Regulator","consensus":"ATTGCGAAYGNYTCTCAAN","confidence":"weak","strand":-1,"score":20.07245473798783,"max_score":32.74363},{"name":"FuR_variant_2","start":7438458,"species":"Caulobacter crescentus CB15","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/8/138/","description":"Ferric Uptake Regulator","consensus":"ATTGCGAAYGNYTCTCAAN","confidence":"weak","strand":1,"score":20.324102927648088,"max_score":32.74363},{"name":"IolR","start":7368171,"species":"Caulobacter crescentus CB15","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/66/138/","description":"Regulator of the inositol catabolism","consensus":"GGANNANNYGTTCCN","confidence":"medium","strand":-1,"score":18.63542307395641,"max_score":23.7932},{"name":"IolR","start":7369670,"species":"Caulobacter crescentus CB15","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/66/138/","description":"Regulator of the inositol catabolism","consensus":"GGANNANNYGTTCCN","confidence":"medium","strand":1,"score":18.384104981906066,"max_score":23.7932},{"name":"MogR","start":7369747,"species":"Listeria monocytogenes EGD-e","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/233/35/","description":"Repressor of flagellar motility genes","consensus":"ATTTTTWAANAAAA","confidence":"weak","strand":1,"score":12.99561322870821,"max_score":26.06143},{"name":"VqsM","start":7430936,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/234/59/","description":"Regulator of quorum-sensing signalling systems","consensus":"GGANNNYNTCGGCCA","confidence":"medium","strand":-1,"score":18.248651395764245,"max_score":20.46889},{"name":"VqsM","start":7439081,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/234/59/","description":"Regulator of quorum-sensing signalling systems","consensus":"GGANNNYNTCGGCCA","confidence":"strong","strand":1,"score":20.468886013445566,"max_score":20.46889}],"32":[{"name":"AfsR","start":7531712,"species":"Streptomyces 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coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/CatR","description":"H2O2-responsive repressor","consensus":"TGGANMGNRTCTAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":17.98654548139751,"max_score":25.31008},{"name":"DasR","start":7493506,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/DasR","description":"N-acetylglucosamine dependent repressor","consensus":"ANWGGTCTAGACCANW","confidence":"medium","strand":-1,"score":21.789265995760353,"max_score":27.0358},{"name":"HypR","start":7571725,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/HypR","description":"L-hydroxyproline utilization repressor","consensus":"TGCMATGTCAC","confidence":"weak","strand":-1,"score":18.594059458850385,"max_score":22.39835},{"name":"LexA_variant_1","start":7547652,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/LexA","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"TCGAANKNNTGTTCGA","confidence":"weak","strand":1,"score":20.34422807169203,"max_score":29.65219},{"name":"LexA_variant_1","start":7587667,"species":"Streptomyces coelicolor","link":"https://logomotif.bioinformatics.nl/regulator/LexA","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"TCGAANKNNTGTTCGA","confidence":"weak","strand":-1,"score":23.65003650121611,"max_score":29.65219},{"name":"LexA_variant_3","start":7534907,"species":"Escherichia coli str. 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MG1655","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/1/6/","description":"Repressor of DNA damage response","consensus":"TACTGTATAWAWNNMCAGN","confidence":"weak","strand":1,"score":20.40198911878019,"max_score":32.92827},{"name":"ZuR_variant_2","start":7550026,"species":"Pseudomonas protegens Pf-5","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/46/235/","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TTGTTATAANATAACAT","confidence":"weak","strand":-1,"score":19.634374033327123,"max_score":33.14175},{"name":"ZuR_variant_2","start":7550048,"species":"Pseudomonas protegens Pf-5","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/46/235/","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TTGTTATAANATAACAT","confidence":"weak","strand":-1,"score":17.432003321675015,"max_score":33.14175},{"name":"ZuR_variant_2","start":7584670,"species":"Pseudomonas protegens Pf-5","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/46/235/","description":"Zinc-responsive repressor","consensus":"TTGTTATAANATAACAT","confidence":"weak","strand":-1,"score":16.284969638105085,"max_score":33.14175},{"name":"ClgR","start":7564143,"species":"Corynebacterium glutamicum ATCC 13032","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/102/77/","description":"Caseinolytic protease gene regulator","consensus":"ACGCCGNNAGCGAACA","confidence":"weak","strand":1,"score":21.498039671727348,"max_score":30.22426},{"name":"CodY","start":7525728,"species":"Bacillus, Lactococcus & Streptococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/32/149/","description":"Regulator of stationary phase and virulence in Gram-positive bacteria","consensus":"AWTTTTCAGAAAATT","confidence":"weak","strand":-1,"score":15.033990726833657,"max_score":27.78253},{"name":"CodY","start":7594450,"species":"Bacillus, Lactococcus & Streptococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/32/149/","description":"Regulator of stationary phase and virulence in Gram-positive bacteria","consensus":"AWTTTTCAGAAAATT","confidence":"weak","strand":-1,"score":15.965776253173422,"max_score":27.78253},{"name":"CodY","start":7594452,"species":"Bacillus, Lactococcus & Streptococcus sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/32/149/","description":"Regulator of stationary phase and virulence in Gram-positive bacteria","consensus":"AWTTTTCAGAAAATT","confidence":"weak","strand":1,"score":17.080204437637793,"max_score":27.78253},{"name":"FuR_variant_1","start":7594554,"species":"Bacillus, Pseudomonas, Yersinia sp.","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/8/12/","description":"Ferric Uptake 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HipB","consensus":"TATCCCNTAGAGCGGATA","confidence":"weak","strand":-1,"score":19.593382538078018,"max_score":33.7334},{"name":"LuxO","start":7489006,"species":"Vibrio campbellii ATCC BAA-1116","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/208/197/","description":"Repressor of luminescence","consensus":"TTGCATTTTGCAA","confidence":"weak","strand":-1,"score":17.85406764502558,"max_score":26.11696},{"name":"LuxO","start":7550041,"species":"Vibrio campbellii ATCC BAA-1116","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/208/197/","description":"Repressor of luminescence","consensus":"TTGCATTTTGCAA","confidence":"weak","strand":1,"score":19.600902874894317,"max_score":26.11696},{"name":"MexT","start":7511101,"species":"Pseudomonas aeruginosa PAO1","link":"http://www.collectf.org/browse/view_motif_reports_by_TF_and_species/76/59/","description":"Global virulence 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